TkA01G629240 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G629240

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 159133535-159135472 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1823 bp · TkA01G629240|TK1151|cDNA

CTTAATTTTTTACATCACCCATGTAGAAAAGAAAAGAGAGAAATGTCATTTCGAACCTTCCAATTATCTGATAAGGAAAACCCTATCGGTAACAGAAACCATGCCCCAAATCGTTAAACCCTAACTACCACCAAGCCATGGCGATCCTTCAGATCCTTCCCTCACCTCCGTCTTTCCGTTATACGGCTTGCTTCCGTTCCTTCCCCAGAATTCTCATACCCCGAGCATCCATTAATGGCGACCACACTGTCTCGACCTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1170 bp · TkA01G629240|TK1151|CDS

ATGGCGATCCTTCAGATCCTTCCCTCACCTCCGTCTTTCCGTTATACGGCTTGCTTCCGTTCCTTCCCCAGAATTCTCATACCCCGAGCATCCATTAATGGCGACCACACTGTCTCGACCTCGCAGCAACCCACTCGCCGTGGCCGGAAAAAATCAACCTCTACCACAACAATACCCTCCACTAAAAGTTCCAGTCGCACGAAGAAATCAGAACTAGAAGTAAACAGAATTGAAAATGAAGAAAATTTAGAGGATTTTGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

389 aa · TkA01G629240|TK1151|PROTEIN

MAILQILPSPPSFRYTACFRSFPRILIPRASINGDHTVSTSQQPTRRGRKKSTSTTTIPSTKSSSRTKKSELEVNRIENEENLEDFEDGIDFPYEDPPLICCFGAAQKEFVPTVRVSDQQMDPDMYSEWKMLQWDPPEFARAPGGPPSNVAIAHVRLGGRAAFMGKVGDDDLGQELVLMMNKEKVQTRSVKIDPKEKTGCSYMKITFDKKGKMKAEKVKDAAEDSFMSSELNLSVLKEARIFHFNSEVLLTDSMQSALFK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G629240`
TK1151 ID	TkA01G629240
OH-1004 ID	LXL04_000177
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.943 / OH-1004 81.237 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G629240

位置 Chr01:159133535-159135472 (+)

描述 Similar to FLN1: Fructokinase-like 1, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g54090`	叶绿体正常发育所需，最有可能通过调节质体编码聚合酶依赖性叶绿体转录。	Plastidial thioredoxin z interacts with two fructokinase-like proteins in a thiol-dependent manner: evidence for an essential role in chloroplast development in Arabidopsis and Nicotiana benthamiana.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071001 The plastid-localized pfkB-type carbohydrate kinases FRUCTOKINASE-LIKE 1 and 2 are essential for growth and development of Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1186/1471-2229-12-102
`At1g69200`	叶绿体正常发育所需，最有可能通过调节质体编码聚合酶 (PEP) 依赖性叶绿体转录。	Plastidial thioredoxin z interacts with two fructokinase-like proteins in a thiol-dependent manner: evidence for an essential role in chloroplast development in Arabidopsis and Nicotiana benthamiana.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071001 The plastid-localized pfkB-type carbohydrate kinases FRUCTOKINASE-LIKE 1 and 2 are essential for growth and development of Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1186/1471-2229-12-102 The reduced plastid-encoded polymerase-dependent plastid gene expression leads to the delayed greening of the Arabidopsis fln2 mutant.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0073092
`At1g06030`	可能在维持碳流向淀粉形成中起重要作用。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000177 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006000 fructose metabolic process 生物过程

GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006633 fatty acid biosynthetic process 生物过程

GO:0009658 chloroplast organization 生物过程

GO:0009662 etioplast organization 生物过程

GO:0016051 carbohydrate biosynthetic process 生物过程

GO:0019252 starch biosynthetic process 生物过程

GO:0042793 plastid transcription 生物过程

GO:0000427 plastid-encoded plastid RNA polymerase complex 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G66430

ath:AT1G69200

ath:AT3G54090

ath:AT3G59480

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.945

排名 1 · TkA01G629240 · TK1151

线粒体0.053

排名 2 · TkA01G629240 · TK1151

细胞核0.035

排名 3 · TkA01G629240 · TK1151

细胞质0.024

排名 4 · TkA01G629240 · TK1151

细胞膜0.017

排名 5 · TkA01G629240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14529Exo_endo_phos_244-58 aa

PF00294PfkB121-327 aa

PF14529Exo_endo_phos_2171-186 aa

PF14529Exo_endo_phos_2251-334 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G629240	`PF14529`	Exo_endo_phos_2	44	58	0.17	12.4
TkA01G629240	`PF00294`	PfkB	121	327	2.5e-28	100.0
TkA01G629240	`PF14529`	Exo_endo_phos_2	171	186	0.17	12.4
TkA01G629240	`PF14529`	Exo_endo_phos_2	251	334	0.17	12.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M394`	拟南芥	sp\|Q9M394\|SCKL1_ARATH Fructokinase-like 1, chloroplastic	66.700%	Swiss-Prot	高置信
`F4I0K2`	拟南芥	sp\|F4I0K2\|SCKL2_ARATH Fructokinase-like 2, chloroplastic	45.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LNE3`	拟南芥	sp\|Q9LNE3\|SCRK2_ARATH Probable fructokinase-2	35.400%	Swiss-Prot	中等置信

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