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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G621070
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 156720183-156722684 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2424 bp · TkA01G621070|TK1151|cDNA

ATGGGTTTTCGGGGTTTCAGGTTATTGTTCATTGGTGTTGTGTTCTTGTTGTGTTTATCTTCTGGTTATTCCCAATTTAATCCGGCGGACAAGTATTCTATAGATTGTGGATCTCCGAGCAACACCAGCATCGGCAATCGGGTTTTTGTATCTGATAATTTGGCCTCAAGTTTTCTTTCAACCCCACAAAATGTTTTGGTTGATACTTCTGCTAACTCAATTCCATCATCTGAATACTCTCAGCTGTATAGAACAGCAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2424 bp · TkA01G621070|TK1151|CDS

ATGGGTTTTCGGGGTTTCAGGTTATTGTTCATTGGTGTTGTGTTCTTGTTGTGTTTATCTTCTGGTTATTCCCAATTTAATCCGGCGGACAAGTATTCTATAGATTGTGGATCTCCGAGCAACACCAGCATCGGCAATCGGGTTTTTGTATCTGATAATTTGGCCTCAAGTTTTCTTTCAACCCCACAAAATGTTTTGGTTGATACTTCTGCTAACTCAATTCCATCATCTGAATACTCTCAGCTGTATAGAACAGCAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

807 aa · TkA01G621070|TK1151|PROTEIN

MGFRGFRLLFIGVVFLLCLSSGYSQFNPADKYSIDCGSPSNTSIGNRVFVSDNLASSFLSTPQNVLVDTSANSIPSSEYSQLYRTARIFTQTSTYTFRITQSGRHWIRLYFFPFSASNYDLTSATFSVSTRDHALLSDFKTNNESVKEYSVNVTSGDLEITFTPSGTSFAFLNALEVVSVPDPLIRDDAMSVTPPTSFKGMLTKALETVARVNMGGPVVTSRNDSLWRSWVTDRSFSKNQNLESNVSNPSAVRYPAGGAT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G621070
TK1151 IDTkA01G621070
OH-1004 IDLXL04_008664
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)51.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.309 / OH-1004 91.657
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G621070
位置Chr01:156720183-156722684 (+)
描述Similar to At5g61350: Probable receptor-like protein kinase At5g61350
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g59700 可能的受体样蛋白激酶 At5g59700。 暂无已核实直接文献
At5g54380 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
A receptor-like kinase mediates the response of Arabidopsis cells to the inhibition of cellulose synthesis.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.018
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At4g39110 可能的受体样蛋白激酶 At4g39110。 暂无已核实直接文献
At2g21480 可能的受体样蛋白激酶At2g21480。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008664 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0051924 regulation of calcium ion transport 生物过程
GO:0080092 regulation of pollen tube growth 生物过程
GO:0080147 root hair cell development 生物过程
GO:0097275 intracellular ammonium homeostasis 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G21480
ath:AT3G46290
ath:AT4G39110
ath:AT5G54380
ath:AT5G61350
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.779
排名 1 · TkA01G621070 · TK1151
内质网0.095
排名 2 · TkA01G621070 · TK1151
细胞质0.090
排名 3 · TkA01G621070 · TK1151
溶酶体／液泡0.069
排名 4 · TkA01G621070 · TK1151
细胞核0.044
排名 5 · TkA01G621070 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11721Malectin32-163 aa
PF12819Malectin_like34-384 aa
PF25275Golvesin_C77-133 aa
PF11721Malectin209-363 aa
PF25275Golvesin_C265-324 aa
PF08693SKG6396-440 aa
PF04478Mid2399-436 aa
PF19428Sema4F_C403-471 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G621070PF11721Malectin321635.5e-1969.5
TkA01G621070PF12819Malectin_like343842.6e-35123.0
TkA01G621070PF25275Golvesin_C771330.01815.8
TkA01G621070PF11721Malectin2093635.5e-1969.5
TkA01G621070PF25275Golvesin_C2653240.01815.8
TkA01G621070PF08693SKG63964400.01115.4
TkA01G621070PF04478Mid23994360.004917.4
TkA01G621070PF19428Sema4F_C4034710.212.1
TkA01G621070PF02439Adeno_E3_CR24084360.004917.3
TkA01G621070PF01034Syndecan4094370.02715.2
TkA01G621070PF27291AF_14574094770.02815.4
TkA01G621070PF21314TM_ErbB14114370.01815.5
TkA01G621070PF12669FeoB_associated4144380.3212.1
TkA01G621070PF22495HTH_924354680.03914.0
TkA01G621070PF07714PK_Tyr_Ser-Thr4816731.4e-47162.9
TkA01G621070PF00069Pkinase4816831.8e-43149.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LX66拟南芥sp|Q9LX66|HERK_ARATH Receptor-like protein kinase HERK 160.500%Swiss-Prot高置信
Q9FN92拟南芥sp|Q9FN92|Y5597_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g5970059.900%Swiss-Prot高置信
Q9LK35拟南芥sp|Q9LK35|THE1_ARATH Receptor-like protein kinase THESEUS 150.800%Swiss-Prot高置信
Q9T020拟南芥sp|Q9T020|Y4391_ARATH Probable receptor-like protein kinase At4g3911051.300%Swiss-Prot高置信
Q9SJT0拟南芥sp|Q9SJT0|Y2214_ARATH Probable receptor-like protein kinase At2g2148048.900%Swiss-Prot中等置信

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