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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G322400
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 80178413-80182481 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2749 bp · TkA01G322400|TK1151|cDNA

CCTTAATCATCTACACTACTGACTGCAGAATCACCCATTATACTTCCAGATTTCTCCAAAAAAAACTTGAGGAAGGCAGACGGTAGTCAACTACATGGATTCCTTCGGCGGCTCATACTTCACCGACGAGAAAGCAGCGAAGGTCGAGAATATCTTCTTGGAGTTCCTTAAAAGTTTTAGATTAGATGCGCATTCAAGAGAACCTTTCTACGAGTCAGAAATCGAAGCAATGAGACCAAATGAGTCCAACACCATGTTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

2370 bp · TkA01G322400|TK1151|CDS

ATGGATTCCTTCGGCGGCTCATACTTCACCGACGAGAAAGCAGCGAAGGTCGAGAATATCTTCTTGGAGTTCCTTAAAAGTTTTAGATTAGATGCGCATTCAAGAGAACCTTTCTACGAGTCAGAAATCGAAGCAATGAGACCAAATGAGTCCAACACCATGTTTATTGATTTCTCTCATGTTATGAGGTTCAGCGATATTCTACAGAAGGCCATATCTGATGAATATCTGAGGTTTGAGTCGTACCTGAAGAACGCATG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

789 aa · TkA01G322400|TK1151|PROTEIN

MDSFGGSYFTDEKAAKVENIFLEFLKSFRLDAHSREPFYESEIEAMRPNESNTMFIDFSHVMRFSDILQKAISDEYLRFESYLKNACKRFVMGQKPTFITDDNPNKDINIAFYNLPVIKRLRELSTSEIGRLVSVTGVVTRTSEVRPELLQGTFKCLECGTIVKNVEQQYKYTEPMICINAMCAKKGSWTLLRQESKFADWQRVRMQETSKEIPAGSLPRSLDVILRHDIVEQARAGDTVIFTGTVVVIPDIFALSAPGE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G322400
TK1151 IDTkA01G322400
OH-1004 IDLXL04_003562
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G322400
位置Chr01:80178413-80182481 (+)
描述Similar to MCM6: DNA replication licensing factor MCM6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g44635 MCM2-7 复合物（MCM 复合物）的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0235800 MCM2-7 复合物（MCM 复合物）的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。 暂无已核实直接文献
UniProt: B8AZX3 MCM2-7 复合物（MCM 复合物）的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003562 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000724 double-strand break repair via homologous recombination 生物过程
GO:0000727 double-strand break repair via break-induced replication 生物过程
GO:0006270 DNA replication initiation 生物过程
GO:0006279 premeiotic DNA replication 生物过程
GO:0030174 regulation of DNA-templated DNA replication initiation 生物过程
GO:0044786 cell cycle DNA replication 生物过程
GO:1902969 mitotic DNA replication 生物过程
GO:1902975 mitotic DNA replication initiation 生物过程
GO:0000347 THO complex 细胞组分
GO:0000785 chromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005656 nuclear pre-replicative complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G44635
dosa:Os05g0235800
spo:2540784
xtr:548975
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.926
排名 1 · TkA01G322400 · TK1151
细胞质0.137
排名 2 · TkA01G322400 · TK1151
线粒体0.034
排名 3 · TkA01G322400 · TK1151
细胞膜0.018
排名 4 · TkA01G322400 · TK1151
内质网0.008
排名 5 · TkA01G322400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14551MCM_N19-114 aa
PF20776SLS1_N40-53 aa
PF17207MCM_OB121-249 aa
PF00493MCM319-534 aa
PF01078Mg_chelatase365-393 aa
PF07728AAA_5369-487 aa
PF07726AAA_3407-484 aa
PF01078Mg_chelatase421-488 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G322400PF14551MCM_N191141.4e-1351.7
TkA01G322400PF20776SLS1_N40530.213.0
TkA01G322400PF17207MCM_OB1212492.1e-41141.3
TkA01G322400PF00493MCM3195348.1e-96320.2
TkA01G322400PF01078Mg_chelatase3653937.4e-0729.5
TkA01G322400PF07728AAA_53694870.001119.7
TkA01G322400PF07726AAA_34074840.004317.7
TkA01G322400PF01078Mg_chelatase4214887.4e-0729.5
TkA01G322400PF00158Sigma54_activat4234820.01116.1
TkA01G322400PF20776SLS1_N5365650.213.0
TkA01G322400PF17855MCM_lid5496332.5e-2486.3
TkA01G322400PF18263WHD_MCM66757882.5e-2176.5
TkA01G322400PF14551MCM_N6836981.4e-1351.7
TkA01G322400PF07728AAA_57107630.001119.7
TkA01G322400PF17855MCM_lid7137482.5e-2486.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4KAB8拟南芥sp|F4KAB8|MCM6_ARATH DNA replication licensing factor MCM670.200%Swiss-Prot高置信
Q6F353水稻sp|Q6F353|MCM6_ORYSJ DNA replication licensing factor MCM671.300%Swiss-Prot高置信
B8AZX3水稻sp|B8AZX3|MCM6_ORYSI DNA replication licensing factor MCM671.200%Swiss-Prot高置信

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