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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_038358
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 38508608-38511088 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1251 bp · LXL04_038358|LXL04_038358|OH1004|cDNA

ATGTATTATGTCTCCCTCACTCACACACACCGCGACTATGTAGCTGCTTTAGAGAGAGAAAGTGAAGCAAAAAAGCAGCAATCTTCACGAGCTCCCTTCAACTTCTCTCTCTATATCTATCTACCTGTATGTATATACCGCCATTTATTTATTAAGAATCGGATGGATCGATCTGCGCTTGCTGTGGGTCCGGGTATGGATATGCCTATCATGCACGACAGTGATCGCTACGAGCTAGTGAGAGACATTGGTTCTGGTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1251 bp · LXL04_038358|LXL04_038358|OH1004|CDS

ATGTATTATGTCTCCCTCACTCACACACACCGCGACTATGTAGCTGCTTTAGAGAGAGAAAGTGAAGCAAAAAAGCAGCAATCTTCACGAGCTCCCTTCAACTTCTCTCTCTATATCTATCTACCTGTATGTATATACCGCCATTTATTTATTAAGAATCGGATGGATCGATCTGCGCTTGCTGTGGGTCCGGGTATGGATATGCCTATCATGCACGACAGTGATCGCTACGAGCTAGTGAGAGACATTGGTTCTGGTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

416 aa · LXL04_038358|LXL04_038358|OH1004|PROTEIN

MYYVSLTHTHRDYVAALERESEAKKQQSSRAPFNFSLYIYLPVCIYRHLFIKNRMDRSALAVGPGMDMPIMHDSDRYELVRDIGSGNFGVARLMRDKQTNELVAVKYIERGEKIDENVQREIINHRSLRHPNIVRFKEVILTPTHLAIVMEYASGGELFERICNAGRFPEDEARFFFQQLISGVSYCHNMQVCHRDLKLENTLLDGSPAPRLKICDFGYSKSSVLHSQPKSTVGTPAYIAPEVLLKKEYDGKIADVWSCG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_038358
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_038358
位置Chr09:38508608-38511088 (-)
描述Similar to SRK2E: Serine/threonine-protein kinase SRK2E
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g33950 可能激活脱落酸信号通路，参与干旱、黑暗及高 CO₂ 等条件下的气孔关闭。
Use of infrared thermal imaging to isolate Arabidopsis mutants defective in stomatal regulation.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01322.x
Arabidopsis OST1 protein kinase mediates the regulation of stomatal aperture by abscisic acid and acts upstream of reactive oxygen species production.2002 · DOI: 10.1105/tpc.007906
ABA-activated SnRK2 protein kinase is required for dehydration stress signaling in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1093/pcp/pcf188
Cytoplasmic alkalization precedes reactive oxygen species production during methyl jasmonate- and abscisic acid-induced stomatal closure.2004 · DOI: 10.1104/pp.103.032250
The regulatory domain of SRK2E/OST1/SnRK2.6 interacts with ABI1 and integrates abscisic acid (ABA) and osmotic stress signals controlling stomatal closure in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m509820200
The identification of genes involved in the stomatal response to reduced atmospheric relative humidity.2006 · DOI: 10.1016/j.cub.2006.03.028
Identification of features regulating OST1 kinase activity and OST1 function in guard cells.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.079327
Plant stomata function in innate immunity against bacterial invasion.2006 · DOI: 10.1016/j.cell.2006.06.054
Ozone-triggered rapid stomatal response involves the production of reactive oxygen species, and is controlled by SLAC1 and OST1.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04159.x
At5g66880 与 SRK2D 一起，是脱落酸 信号通路的关键成分和激活剂，可调节多种 ABA 反应，例如种子发芽、Pro 积累、根生长抑制、休眠和幼苗生长，以及较小程度的气孔关闭。
Identification of two protein kinases required for abscisic acid regulation of seed germination, root growth, and gene expression in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.048538

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0610900 可能在高渗反应的信号转导中发挥作用。
ABA Regulates Subcellular Redistribution of OsABI-LIKE2, a Negative Regulator in ABA Signaling, to Control Root Architecture and Drought Resistance in Oryza sativa.2015 · DOI: 10.1093/pcp/pcv154
Os12g0586100 可能在高渗应答信号转导中起作用（可能）。 暂无已核实直接文献
Os03g0764800 可能在高渗应答信号转导中起作用（可能）。
ABA Regulates Subcellular Redistribution of OsABI-LIKE2, a Negative Regulator in ABA Signaling, to Control Root Architecture and Drought Resistance in Oryza sativa.2015 · DOI: 10.1093/pcp/pcv154
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038358 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005985 sucrose metabolic process 生物过程
GO:0006636 unsaturated fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G33950
ath:AT5G66880
dosa:Os03g0610900
dosa:Os03g0764800
dosa:Os12g0586100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.581
排名 1 · LXL04_038358 · OH-1004
细胞核0.425
排名 2 · LXL04_038358 · OH-1004
细胞膜0.151
排名 3 · LXL04_038358 · OH-1004
线粒体0.062
排名 4 · LXL04_038358 · OH-1004
高尔基体0.061
排名 5 · LXL04_038358 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase77-333 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr79-329 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_038358PF00069.32Pkinase773338.8e-74248.9
LXL04_038358PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr793295.9e-33115.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q940H6拟南芥Serine/threonine-protein kinase SRK2E86.264%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q39193拟南芥Serine/threonine-protein kinase SRK2I77.410%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q75H77水稻Serine/threonine-protein kinase SAPK1082.094%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q75V57水稻Serine/threonine-protein kinase SAPK979.121%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7Y0B9水稻Serine/threonine-protein kinase SAPK884.112%Swiss-Prot强数据库同源证据

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