LXL04_038206 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_038206

当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 34240518-34247187 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3060 bp · LXL04_038206|LXL04_038206|OH1004|cDNA

ATGGCAACTTCTTCatcaagaggaagaagcagtTCACCTTTCCACCACCGGAAGCCATCAAGTactttttcttcatcttcatcaacttcgTCTTTTAAGCAGCTCATTCCTCGCTCCTGTTCGTCTTCCGCAACTACGTCGTTTTACGGAGCTTCCGGTAACGGTTACGGTTCCGGTTCCAGATCCATCACTCCCGGTGGGGCAAGGTCTGATTCGATGTATTCAAAAGGAGGTTATGGAGGCCGGTCACCGGTCGGTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

3060 bp · LXL04_038206|LXL04_038206|OH1004|CDS

ATGGCAACTTCTTCATCAAGAGGAAGAAGCAGTTCACCTTTCCACCACCGGAAGCCATCAAGTACTTTTTCTTCATCTTCATCAACTTCGTCTTTTAAGCAGCTCATTCCTCGCTCCTGTTCGTCTTCCGCAACTACGTCGTTTTACGGAGCTTCCGGTAACGGTTACGGTTCCGGTTCCAGATCCATCACTCCCGGTGGGGCAAGGTCTGATTCGATGTATTCAAAAGGAGGTTATGGAGGCCGGTCACCGGTCGGTTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1019 aa · LXL04_038206|LXL04_038206|OH1004|PROTEIN

MATSSSRGRSSSPFHHRKPSSTFSSSSSTSSFKQLIPRSCSSSATTSFYGASGNGYGSGSRSITPGGARSDSMYSKGGYGGRSPVGFPSADELIGEPVDGTPKSGGGDSISVTIRFRPLSEREYQRGDEISWYADGDKLVRNEYNPVTSYAFDRVFGPSAVTQEVYEVAARPVVKTAMEGVNGTVFAYGVTSSGKTHTMHGDHHSPGIIPLAIKDVFSIIQDTPGREFLLRVSYLEIYNEVINDLLDPTGQNLRVREDAQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_038206`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_038206

位置 Chr09:34240518-34247187 (+)

描述 Similar to KIN7D: Kinesin-like protein KIN-7D, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g39050`	类动力蛋白KIN-7D，线粒体。	暂无已核实直接文献
`At2g21380`	类驱动蛋白KIN-7M，叶绿体。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os10g0512800`	类驱动蛋白KIN-7K，叶绿体型。	暂无已核实直接文献
`Os04g0434600`	类驱动蛋白 KIN-7E，叶绿体定位。	暂无已核实直接文献
`Os02g0775400`	可能的向负端驱动电机蛋白，具有微管增强的 ATP 酶活性。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038206 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程

GO:0031347 regulation of defense response 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005871 kinesin complex 细胞组分

GO:0005874 microtubule 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0008017 microtubule binding 分子功能

GO:0008270 zinc ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G21380

ath:AT4G39050

osa:9271714

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.597

排名 1 · LXL04_038206 · OH-1004

细胞核0.280

排名 2 · LXL04_038206 · OH-1004

细胞膜0.172

排名 3 · LXL04_038206 · OH-1004

高尔基体0.066

排名 4 · LXL04_038206 · OH-1004

溶酶体／液泡0.059

排名 5 · LXL04_038206 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00225.30Kinesin115-426 aa

PF16796.12Microtub_bd139-246 aa

PF13920.13zf-C3HC4_3970-1012 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_038206	`PF00225.30`	Kinesin	115	426	2.7e-105	352.7
LXL04_038206	`PF16796.12`	Microtub_bd	139	246	4.4e-20	72.9
LXL04_038206	`PF13920.13`	zf-C3HC4_3	970	1012	2.1e-11	44.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8W5R5`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-7D, mitochondrial	70.554%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9SJU0`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-7M, chloroplastic	67.535%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9FW70`	水稻	Kinesin-like protein KIN-7K, chloroplastic	66.327%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`B9FFA3`	水稻	Kinesin-like protein KIN-7E, chloroplastic	78.708%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q6YZ52`	水稻	Kinesin-like protein KIN-7D, chloroplastic	72.146%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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