基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_037297
当前版本: OH-1004
染色体: Chr09
坐标: 5506349-5509043
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1617 bp · LXL04_037297|LXL04_037297|OH1004|cDNA
ATGGAAATTGGTTCGGCTCCGATCAACCAGTGTTCCAAGGAACATCAGAAAATCTATCAAGATTGGTTCGTTTGCGCTGACTCAGATGGCGATGGACGTATTACCGGCGTCGACGCCACAAAGTTCTTCGCCATGTCCAATTTAGCTCGACAAGACCTCAAACAGGTGTGGGCGATTGCGGATTCTAAACGACAAGGCTTTCTTGGTTTCAATGAGTTCGTTATGGCAATGCAGTCACAGCTTTTCCTTGTTACACTTGA...
CDS
下载 CDS FASTA1617 bp · LXL04_037297|LXL04_037297|OH1004|CDS
ATGGAAATTGGTTCGGCTCCGATCAACCAGTGTTCCAAGGAACATCAGAAAATCTATCAAGATTGGTTCGTTTGCGCTGACTCAGATGGCGATGGACGTATTACCGGCGTCGACGCCACAAAGTTCTTCGCCATGTCCAATTTAGCTCGACAAGACCTCAAACAGGTGTGGGCGATTGCGGATTCTAAACGACAAGGCTTTCTTGGTTTCAATGAGTTCGTTATGGCAATGCAGTCACAGCTTTTCCTTGTTACACTTGA...
538 aa · LXL04_037297|LXL04_037297|OH1004|PROTEIN
MEIGSAPINQCSKEHQKIYQDWFVCADSDGDGRITGVDATKFFAMSNLARQDLKQVWAIADSKRQGFLGFNEFVMAMQSQLFLVTLDIHKNFDDAVDAEQLKPPTMEGLDVLLAKKKHQHKPSDVEMNGGASQIEIPTSSKHAKNLPLKAVTSIVDGLKKLYIQKLKPLETMHRFNEFVSPALTNSDFDAKPMVMLLGQYSTGKTTFIKHLLKSGYPGAHIGPEPTTDRFVAVMNGADERSIPGNTVAVQADMPFHGLNN...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_037297 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA04G269900 |
| OH-1004 ID | LXL04_037297 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 96.500 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 100.000覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_037297 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr09:5506349-5509043 (+) | |||||||||
| 描述 | Similar to EHD1: EH domain-containing protein 1 | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程 GO:0006897 endocytosis 生物过程 GO:0010886 positive regulation of cholesterol storage 生物过程 GO:0016197 endosomal transport 生物过程 GO:0032456 endocytic recycling 生物过程 GO:0032956 regulation of actin cytoskeleton organization 生物过程 GO:0034383 low-density lipoprotein particle clearance 生物过程 GO:0042538 hyperosmotic salinity response 生物过程 GO:0042632 cholesterol homeostasis 生物过程 GO:0051260 protein homooligomerization 生物过程 GO:0060271 cilium assembly 生物过程 GO:0061512 protein localization to cilium 生物过程 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G20290 ath:AT4G05520 bta:511908 hsa:10938 pon:100172373 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.556
细胞膜0.286
细胞核0.211
高尔基体0.091
内质网0.076
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF12763.14EH15-78 aaPF16880.11EHD_N157-189 aaPF00350.30Dynamin_N194-354 aaPF01926.30MMR_HSR1194-353 aaPF00009.34GTP_EFTU194-373 aaPF18150.7DUF5600428-529 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_037297 | PF12763.14 | EH | 15 | 78 | 7e-09 | 36.3 |
| LXL04_037297 | PF16880.11 | EHD_N | 157 | 189 | 5.1e-14 | 52.6 |
| LXL04_037297 | PF00350.30 | Dynamin_N | 194 | 354 | 6.9e-14 | 52.9 |
| LXL04_037297 | PF01926.30 | MMR_HSR1 | 194 | 353 | 3.5e-08 | 34.3 |
| LXL04_037297 | PF00009.34 | GTP_EFTU | 194 | 373 | 3.9e-06 | 27.3 |
| LXL04_037297 | PF18150.7 | DUF5600 | 428 | 529 | 1.4e-35 | 122.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。