LXL04_037177 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_037177

当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 1024061-1031959 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2397 bp · LXL04_037177|LXL04_037177|OH1004|cDNA

ATGGAGGCTGCAAGGAAACAGTTCCTGAACGAATTCGGTGAATCGTACGGTTATCCGAATGCTCCAAAAACCATCGATGAAATCCGAGCTACTGAATTTAAACGAATTGATGGAAATGTGTACTTGGATCACGCTGGTGCAACTTTATATTCTGAATTACAGATGGAGGCGATATTTAAAGATCTTACCACCACTGTATACGGAAATCCTCATAGTCAAAGCAGCTCTAGCTTGACCTCATCAGACATTGTAGAAGATGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2397 bp · LXL04_037177|LXL04_037177|OH1004|CDS

ATGGAGGCTGCAAGGAAACAGTTCCTGAACGAATTCGGTGAATCGTACGGTTATCCGAATGCTCCAAAAACCATCGATGAAATCCGAGCTACTGAATTTAAACGAATTGATGGAAATGTGTACTTGGATCACGCTGGTGCAACTTTATATTCTGAATTACAGATGGAGGCGATATTTAAAGATCTTACCACCACTGTATACGGAAATCCTCATAGTCAAAGCAGCTCTAGCTTGACCTCATCAGACATTGTAGAAGATGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

798 aa · LXL04_037177|LXL04_037177|OH1004|PROTEIN

MEAARKQFLNEFGESYGYPNAPKTIDEIRATEFKRIDGNVYLDHAGATLYSELQMEAIFKDLTTTVYGNPHSQSSSSLTSSDIVEDARHQVLKICNASPKEYKCIFTSGATSALKLIGEAFPWTNESTFMYTIENHNSVLGIREYALNKGASALAIDFEETEKIGSNKSSIKVTQYPIQKRSETRVLEKEPTGDTYNLFAFPTECNFSGARFNLDLIDMIKEDSERVLEGSQHSRGCWMVLLDAAKGCSTDPPDLSKHKA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_037177`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_037177

位置 Chr09:1024061-1031959 (+)

描述 Similar to FLACCA: Molybdenum cofactor sulfurase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g16540`	对钼辅因子进行硫化。	The Arabidopsis LOS5/ABA3 locus encodes a molybdenum cofactor sulfurase and modulates cold stress- and osmotic stress-responsive gene expression.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010101 ABA3 is a molybdenum cofactor sulfurase required for activation of aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1074/jbc.c100472200 Tandem orientation of duplicated xanthine dehydrogenase genes from Arabidopsis thaliana: differential gene expression and enzyme activities.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m312929200 Characterization of the NifS-like domain of ABA3 from Arabidopsis thaliana provides insight into the mechanism of molybdenum cofactor sulfuration.2005 · DOI: 10.1074/jbc.m411195200 Binding of sulfurated molybdenum cofactor to the C-terminal domain of ABA3 from Arabidopsis thaliana provides insight into the mechanism of molybdenum cofactor sulfuration.2008 · DOI: 10.1074/jbc.m708549200

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os06g0670000`	对钼辅因子进行硫化。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037177 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006777 Mo-molybdopterin cofactor biosynthetic process 生物过程

GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009688 abscisic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009749 response to glucose 生物过程

GO:0010118 stomatal movement 生物过程

GO:0010182 sugar mediated signaling pathway 生物过程

GO:0018315 molybdenum incorporation into molybdenum-molybdopterin complex 生物过程

GO:0032787 monocarboxylic acid metabolic process 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G16540

dosa:Os06g0670000

sly:543832

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.569

排名 1 · LXL04_037177 · OH-1004

细胞核0.423

排名 2 · LXL04_037177 · OH-1004

线粒体0.083

排名 3 · LXL04_037177 · OH-1004

质体0.049

排名 4 · LXL04_037177 · OH-1004

过氧化物酶体0.038

排名 5 · LXL04_037177 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00266.26Aminotran_540-161 aa

PF00266.26Aminotran_5234-482 aa

PF03476.22MOSC_N516-634 aa

PF03473.24MOSC662-794 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_037177	`PF00266.26`	Aminotran_5	40	161	5.5e-29	102.0
LXL04_037177	`PF00266.26`	Aminotran_5	234	482	5.5e-29	102.0
LXL04_037177	`PF03476.22`	MOSC_N	516	634	1.2e-19	71.0
LXL04_037177	`PF03473.24`	MOSC	662	794	3.5e-24	85.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C5X8`	拟南芥	Molybdenum cofactor sulfurase	61.622%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q655R6`	水稻	Molybdenum cofactor sulfurase	60.024%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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