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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_036699
当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 46768415-46771298 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2484 bp · LXL04_036699|LXL04_036699|OH1004|cDNA

ATGTTGCTTAGCTATCAAAGCATGTTAACAGCCAATGAAGATCAATCTTACAAGATGATACAGGTGGGAGTGATTCTTGATATGGAATCGTCGGTAGGGAAGGTCGCTTATAGTTGCATCACTATGGCTATAGCTGACTTTTACACATCCAATCCTCACTACAAAACAAGGATAGTTTTATCAATAAGAGATACAAAAGGAAAACCACTACGTGCCTTGTCTTATGCTCGTGATTTTTTGGAGAACACAAAAGTGCAAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2484 bp · LXL04_036699|LXL04_036699|OH1004|CDS

ATGTTGCTTAGCTATCAAAGCATGTTAACAGCCAATGAAGATCAATCTTACAAGATGATACAGGTGGGAGTGATTCTTGATATGGAATCGTCGGTAGGGAAGGTCGCTTATAGTTGCATCACTATGGCTATAGCTGACTTTTACACATCCAATCCTCACTACAAAACAAGGATAGTTTTATCAATAAGAGATACAAAAGGAAAACCACTACGTGCCTTGTCTTATGCTCGTGATTTTTTGGAGAACACAAAAGTGCAAGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

827 aa · LXL04_036699|LXL04_036699|OH1004|PROTEIN

MLLSYQSMLTANEDQSYKMIQVGVILDMESSVGKVAYSCITMAIADFYTSNPHYKTRIVLSIRDTKGKPLRALSYARDFLENTKVQAIIGPESTAEARFLEVLEDETNKPILSFSTSLYSNQTPYILGIARDETIQFKGIAAMVESFKANNVIVICEDTTNGREMATCIVSAFQEKNIHVTYTRLFPTYASKEHVREELHKLQTMQATVFVIHTPPSLSSNLFSSAKEMGMMDEGYMWTVTSKTTNFLDSMDAEAIESMQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_036699
TK1151 IDTkA04G028800
OH-1004 IDLXL04_036699
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 62.152
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_036699
位置Chr08:46768415-46771298 (+)
描述Similar to GLR1.2: Glutamate receptor 1.2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g48400 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g48410 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g07520 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。
Arabidopsis thaliana glutamate receptor ion channel function demonstrated by ion pore transplantation.2008 · DOI: 10.1016/j.jmb.2008.06.076
At2g29120 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g04110 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。
The putative glutamate receptor 1.1 (AtGLR1.1) functions as a regulator of carbon and nitrogen metabolism in Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1073/pnas.1030961100
The putative glutamate receptor 1.1 (AtGLR1.1) in Arabidopsis thaliana regulates abscisic acid biosynthesis and signaling to control development and water loss.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch159
Arabidopsis thaliana glutamate receptor ion channel function demonstrated by ion pore transplantation.2008 · DOI: 10.1016/j.jmb.2008.06.076

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036699 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0006814 sodium ion transport 生物过程
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0030003 intracellular monoatomic cation homeostasis 生物过程
GO:0071230 cellular response to amino acid stimulus 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G29120
ath:AT3G04110
ath:AT3G07520
ath:AT5G48400
ath:AT5G48410
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.810
排名 1 · LXL04_036699 · OH-1004
内质网0.070
排名 2 · LXL04_036699 · OH-1004
细胞质0.069
排名 3 · LXL04_036699 · OH-1004
溶酶体／液泡0.039
排名 4 · LXL04_036699 · OH-1004
细胞外0.033
排名 5 · LXL04_036699 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13458.13Peripla_BP_620-371 aa
PF01094.35ANF_receptor38-371 aa
PF10613.15Lig_chan-Glu_bd450-534 aa
PF00497.26SBP_bac_3452-756 aa
PF00060.33Lig_chan548-789 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_036699PF13458.13Peripla_BP_6203712.8e-2383.8
LXL04_036699PF01094.35ANF_receptor383716.6e-56190.6
LXL04_036699PF10613.15Lig_chan-Glu_bd4505342.5e-0834.7
LXL04_036699PF00497.26SBP_bac_34527565.8e-1452.7
LXL04_036699PF00060.33Lig_chan5487895.5e-2898.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LV72拟南芥Glutamate receptor 1.237.881%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FH75拟南芥Glutamate receptor 1.337.282%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8LGN1拟南芥Glutamate receptor 1.436.803%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8LGN0拟南芥Glutamate receptor 2.735.230%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9M8W7拟南芥Glutamate receptor 1.132.964%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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