LXL04_036668 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_036668

当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 46455156-46456369 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

861 bp · LXL04_036668|LXL04_036668|OH1004|cDNA

ATGGGGCAGAAAAATCAGAAACAATTTGACGAAAACGATTTCATATCAGAAAGTTATCTAAACCTTAAACAACCGAGAAATCAGAAACAAGAGTCAATAGAATGCTGTTATGCCGTTACCTCGGAACTCGAAATCGGAAGGATTGAAATCGGAAGGACTGAAATCGAAAGGAGCTGCAATGGAACCGTGAAATCGGGAGTAGCAAATGGAGCCGATTTGTATTTTAAGGACGGGCCTGAGTCTAACCCCCATAAGTGTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

861 bp · LXL04_036668|LXL04_036668|OH1004|CDS

ATGGGGCAGAAAAATCAGAAACAATTTGACGAAAACGATTTCATATCAGAAAGTTATCTAAACCTTAAACAACCGAGAAATCAGAAACAAGAGTCAATAGAATGCTGTTATGCCGTTACCTCGGAACTCGAAATCGGAAGGATTGAAATCGGAAGGACTGAAATCGAAAGGAGCTGCAATGGAACCGTGAAATCGGGAGTAGCAAATGGAGCCGATTTGTATTTTAAGGACGGGCCTGAGTCTAACCCCCATAAGTGTGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

286 aa · LXL04_036668|LXL04_036668|OH1004|PROTEIN

MGQKNQKQFDENDFISESYLNLKQPRNQKQESIECCYAVTSELEIGRIEIGRTEIERSCNGTVKSGVANGADLYFKDGPESNPHKCVPFLETEFLSKTPTYVHTNEPRLLATHIPYTSLPQSILDSDCRVVYMCRNPKDVLVSWFHLAHKLSDKSRGQMTIDEMFEVYGKGLMPYGSYLDHVKEYCNVSSEHLTRFLFLTYEDMKIDTNNQVKRLAEFIGYTFTKEEEANGDVEEVVRLCSFEKLRMLISMDISVRVCLM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_036668`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_036668

位置 Chr08:46455156-46456369 (-)

描述 Similar to SOT17: Cytosolic sulfotransferase 17

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g18590`	硫酸基转移酶，以3′-磷酸腺苷-5′-磷酸硫酸（PAPS）为供体，催化脱硫硫代葡萄糖苷（dsGS）的硫酸化，完成硫代葡萄糖苷核心结构生物合成的最后一步。	Desulfoglucosinolate sulfotransferases from Arabidopsis thaliana catalyze the final step in the biosynthesis of the glucosinolate core structure.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m407681200 The three desulfoglucosinolate sulfotransferase proteins in Arabidopsis have different substrate specificities and are differentially expressed.2006 · DOI: 10.1111/j.1742-4658.2005.05048.x Kinetics and substrate specificities of desulfo-glucosinolate sulfotransferases in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1111/j.1399-3054.2008.01182.x
`At1g74100`	硫酸基转移酶，以3′-磷酸腺苷-5′-磷酸硫酸（PAPS）为供体，催化脱硫硫代葡萄糖苷（dsGS）的硫酸化，完成硫代葡萄糖苷核心结构生物合成的最后一步。	Desulfoglucosinolate sulfotransferases from Arabidopsis thaliana catalyze the final step in the biosynthesis of the glucosinolate core structure.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m407681200 The three desulfoglucosinolate sulfotransferase proteins in Arabidopsis have different substrate specificities and are differentially expressed.2006 · DOI: 10.1111/j.1742-4658.2005.05048.x Kinetics and substrate specificities of desulfo-glucosinolate sulfotransferases in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1111/j.1399-3054.2008.01182.x Modulation of sulfur metabolism enables efficient glucosinolate engineering.2011 · DOI: 10.1186/1472-6750-11-12
`At2g03770`	磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 (PAPS) 作为磺酸盐供体。	暂无已核实直接文献
`At5g43690`	磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 (PAPS) 作为磺酸盐供体。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036668 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009812 flavonoid metabolic process 生物过程

GO:0019761 glucosinolate biosynthetic process 生物过程

GO:0032260 response to jasmonic acid stimulus involved in jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance 生物过程

GO:0051923 sulfation 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0008146 sulfotransferase activity 分子功能

GO:0047364 aromatic desulfoglucosinolate sulfotransferase activity 分子功能

GO:0120527 aliphatic desulfoglucosinolate sulfotransferase activity 分子功能

GO:1990135 flavonoid sulfotransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G18590

ath:AT1G74100

ath:AT2G03770

ath:AT5G43690

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.604

排名 1 · LXL04_036668 · OH-1004

细胞核0.165

排名 2 · LXL04_036668 · OH-1004

过氧化物酶体0.118

排名 3 · LXL04_036668 · OH-1004

内质网0.116

排名 4 · LXL04_036668 · OH-1004

线粒体0.065

排名 5 · LXL04_036668 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00685.34Sulfotransfer_182-246 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_036668	`PF00685.34`	Sulfotransfer_1	82	246	3.1e-43	148.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FZ80`	拟南芥	Cytosolic sulfotransferase 17	46.429%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9C9D0`	拟南芥	Cytosolic sulfotransferase 16	44.048%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9ZPQ5`	拟南芥	Cytosolic sulfotransferase 13	41.520%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9FG94`	拟南芥	Cytosolic sulfotransferase 1	42.690%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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