LXL04_036264 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_036264

当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 39000599-39007359 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3123 bp · LXL04_036264|LXL04_036264|OH1004|cDNA

ATGTTAATGAAGACACCTAGTAAGAGGATTGAGAAACTTGTGTACATTAATGTTGTAGGAAATCATTTATTTGGTAGTGACATGAATGAGAGTAAGAGGTACGTGTTTGAGATTATGGGCCCTATACGTTCCGCCCCTGCTATCTCCACTGCAAAACAAGACTCCCAACGACGACTTGCAAAACAAGACTTCCAACGACGACTGGGGCAGCAAGAAACCATGGCAGTCGGAAAGGAAAACGTGGAGGTGGTGGAGATAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

3123 bp · LXL04_036264|LXL04_036264|OH1004|CDS

ATGTTAATGAAGACACCTAGTAAGAGGATTGAGAAACTTGTGTACATTAATGTTGTAGGAAATCATTTATTTGGTAGTGACATGAATGAGAGTAAGAGGTACGTGTTTGAGATTATGGGCCCTATACGTTCCGCCCCTGCTATCTCCACTGCAAAACAAGACTCCCAACGACGACTTGCAAAACAAGACTTCCAACGACGACTGGGGCAGCAAGAAACCATGGCAGTCGGAAAGGAAAACGTGGAGGTGGTGGAGATAAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1040 aa · LXL04_036264|LXL04_036264|OH1004|PROTEIN

MLMKTPSKRIEKLVYINVVGNHLFGSDMNESKRYVFEIMGPIRSAPAISTAKQDSQRRLAKQDFQRRLGQQETMAVGKENVEVVEITKPRTDTRDYKRILLPNSLQVLLISDPDTDKCAASMNVGVGSFSDPEGLEGLAHFLEHMLFYASEKYPLEDSYSTYISEHGGRTNAYTSSEHTNYYFDVNADCFDEALDRFAQFFIKPLMSADATTREIKAVDSENQKNLLSDGWRINQLQKHLSAEGHPYHKFSTGNWDTLEV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_036264`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_036264

位置 Chr08:39000599-39007359 (-)

描述 Similar to PXM16: Insulin-degrading enzyme-like 1, peroxisomal

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g41790`	可能参与病原体或创伤反应的肽酶。	暂无已核实直接文献
`At3g57470`	胰岛素降解酶样 2。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036264 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006508 proteolysis 生物过程

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0010815 bradykinin catabolic process 生物过程

GO:0010992 ubiquitin recycling 生物过程

GO:0019885 antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I 生物过程

GO:0030163 protein catabolic process 生物过程

GO:0032092 positive regulation of protein binding 生物过程

GO:0042447 hormone catabolic process 生物过程

GO:0043171 peptide catabolic process 生物过程

GO:0045732 positive regulation of protein catabolic process 生物过程

GO:0045861 negative regulation of proteolysis 生物过程

GO:0050435 amyloid-beta metabolic process 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G41790

ath:AT3G57470

bta:523752

hsa:3416

rno:25700

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.486

排名 1 · LXL04_036264 · OH-1004

细胞核0.177

排名 2 · LXL04_036264 · OH-1004

线粒体0.121

排名 3 · LXL04_036264 · OH-1004

细胞外0.110

排名 4 · LXL04_036264 · OH-1004

内质网0.110

排名 5 · LXL04_036264 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00675.26Peptidase_M16107-241 aa

PF05193.27Peptidase_M16_C269-446 aa

PF16187.11Peptidase_M16_M454-733 aa

PF05193.27Peptidase_M16_C740-925 aa

PF22456.2PqqF-like_C_4845-944 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_036264	`PF00675.26`	Peptidase_M16	107	241	3.7e-38	131.5
LXL04_036264	`PF05193.27`	Peptidase_M16_C	269	446	9.1e-46	156.7
LXL04_036264	`PF16187.11`	Peptidase_M16_M	454	733	6.1e-103	344.5
LXL04_036264	`PF05193.27`	Peptidase_M16_C	740	925	9.1e-46	156.7
LXL04_036264	`PF22456.2`	PqqF-like_C_4	845	944	5.7e-23	81.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O22941`	拟南芥	Insulin-degrading enzyme-like 1, peroxisomal	70.443%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`F4J3D9`	拟南芥	Insulin-degrading enzyme-like 2	66.114%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情