基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_035369
当前版本: OH-1004
染色体: Chr08
坐标: 21258859-21262474
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1182 bp · LXL04_035369|LXL04_035369|OH1004|cDNA
ATGATAAGTCCGGTGTTACCTTCCCACATCGTAATTAACCAATCGAGCGATCGTCGGCCGTTTGCTCTTCTCGGGCGCGGAATTCCTCCATTTTCCACTCTGCTCAATCGTTACGTCGCAATGTCTGACTGGCAACAGTATGCTCAAACAATAATATTCGGTTTGATATTTTCATTTCTTCTTGCAAAGCTCTTTTCTATAATATTCTCGTTTCGCGACCAAAATCTCCGTATTACTCGTGCTAACTCTGACGAAGATCA...
CDS
下载 CDS FASTA1182 bp · LXL04_035369|LXL04_035369|OH1004|CDS
ATGATAAGTCCGGTGTTACCTTCCCACATCGTAATTAACCAATCGAGCGATCGTCGGCCGTTTGCTCTTCTCGGGCGCGGAATTCCTCCATTTTCCACTCTGCTCAATCGTTACGTCGCAATGTCTGACTGGCAACAGTATGCTCAAACAATAATATTCGGTTTGATATTTTCATTTCTTCTTGCAAAGCTCTTTTCTATAATATTCTCGTTTCGCGACCAAAATCTCCGTATTACTCGTGCTAACTCTGACGAAGATCA...
393 aa · LXL04_035369|LXL04_035369|OH1004|PROTEIN
MISPVLPSHIVINQSSDRRPFALLGRGIPPFSTLLNRYVAMSDWQQYAQTIIFGLIFSFLLAKLFSIIFSFRDQNLRITRANSDEDQSYEKVSESESESPHKEKKPSAEFPKDYNTSDEDKPLVVQGHGNAWSSSDSDDDWEGVESTELDEAFSAATAFVAATAADRSSPKVSNDLQLQLYGLYKIATEGPCSVPQPSALKMTARAKWNAWQKLGAMPTDEAMLKYLEIITELYPTWVAGSTSKTRDGNANERSSNDTRP...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_035369 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA04G137400 |
| OH-1004 ID | LXL04_035369 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Strict |
| 蛋白一致性 (%) | 100.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 89.822覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_035369 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr08:21258859-21262474 (-) | ||||||
| 描述 | Similar to ACBP1: Acyl-CoA-binding domain-containing protein 1 | ||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| ||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0001666 response to hypoxia 生物过程 GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程 GO:0006869 lipid transport 生物过程 GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程 GO:0010162 seed dormancy process 生物过程 GO:0010288 response to lead ion 生物过程 GO:0048316 seed development 生物过程 GO:0055089 fatty acid homeostasis 生物过程 GO:0055092 sterol homeostasis 生物过程 GO:1900140 regulation of seedling development 生物过程 | ||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT4G27780 ath:AT5G53470 bta:618245 dosa:Os04g0681900 hsa:84320 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.235
细胞核0.227
内质网0.199
质体0.175
高尔基体0.147
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00887.25ACBP150-229 aaPF12796.14Ank_2268-341 aaPF13637.13Ank_4282-331 aaPF12796.14Ank_2283-374 aaPF13857.13Ank_5299-351 aaPF13606.13Ank_3310-338 aaPF00023.37Ank311-342 aaPF13637.13Ank_4315-364 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_035369 | PF00887.25 | ACBP | 150 | 229 | 1.2e-25 | 90.1 |
| LXL04_035369 | PF12796.14 | Ank_2 | 268 | 341 | 9.2e-29 | 100.6 |
| LXL04_035369 | PF13637.13 | Ank_4 | 282 | 331 | 1.2e-18 | 67.5 |
| LXL04_035369 | PF12796.14 | Ank_2 | 283 | 374 | 9.2e-29 | 100.6 |
| LXL04_035369 | PF13857.13 | Ank_5 | 299 | 351 | 2.4e-14 | 54.0 |
| LXL04_035369 | PF13606.13 | Ank_3 | 310 | 338 | 3e-11 | 43.1 |
| LXL04_035369 | PF00023.37 | Ank | 311 | 342 | 2.8e-17 | 62.5 |
| LXL04_035369 | PF13637.13 | Ank_4 | 315 | 364 | 1.2e-18 | 67.5 |
| LXL04_035369 | PF13857.13 | Ank_5 | 333 | 383 | 2.4e-14 | 54.0 |
| LXL04_035369 | PF00023.37 | Ank | 344 | 374 | 2.8e-17 | 62.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。