基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_033538
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 47084110-47084743
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA462 bp · LXL04_033538|LXL04_033538|OH1004|cDNA
ATGGCATCTTTActaaaccacagggaccatttctgtaactttgtCAAAGTTCTATCCACTTCATATTTCATACTTATTATACTTAATCTGGCATCTCTCAGGATAAGCACTGCATGTCTCTTGGTTATTCTCTCTCAAGTCTACAGACCTAGCTTTGTTTTCTTGTCATTGCTTGCTTTGGATATTGCAAGCCATTGGATGCAGATGTACAGTACTTTCTTGGTTGGTAAATCTAATCATAAAGACGTCAAAGACAGCAG...
CDS
下载 CDS FASTA462 bp · LXL04_033538|LXL04_033538|OH1004|CDS
ATGGCATCTTTACTAAACCACAGGGACCATTTCTGTAACTTTGTCAAAGTTCTATCCACTTCATATTTCATACTTATTATACTTAATCTGGCATCTCTCAGGATAAGCACTGCATGTCTCTTGGTTATTCTCTCTCAAGTCTACAGACCTAGCTTTGTTTTCTTGTCATTGCTTGCTTTGGATATTGCAAGCCATTGGATGCAGATGTACAGTACTTTCTTGGTTGGTAAATCTAATCATAAAGACGTCAAAGACAGCAG...
153 aa · LXL04_033538|LXL04_033538|OH1004|PROTEIN
MASLLNHRDHFCNFVKVLSTSYFILIILNLASLRISTACLLVILSQVYRPSFVFLSLLALDIASHWMQMYSTFLVGKSNHKDVKDSSSWLFKLYYGNRIFMGYCCIACEVNYYLFLLFLLPFISLLLILVIVVKNMTIFCPRVQLILQLGADF
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_033538 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_033538 |
|---|---|
| 位置 | Chr07:47084110-47084743 (-) |
| 描述 | Similar to PIS2: Probable CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase 2 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源:OH1004 · |
| GO 注释(OH1004 来源) | GO:0006661 phosphatidylinositol biosynthetic process 生物过程 GO:0008654 phospholipid biosynthetic process 生物过程 GO:0046341 CDP-diacylglycerol metabolic process 生物过程 GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分 GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0003881 CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase activity 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G68000 ath:AT4G38570 cal:CAALFM_C405210WA hsa:10423 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。
细胞核0.298
细胞质0.289
内质网0.211
线粒体0.172
细胞膜0.106
LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果
预测功能结构域
没有找到该查询的结果。
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。