基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_033274
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 40018660-40020365
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1434 bp · LXL04_033274|LXL04_033274|OH1004|cDNA
ATGCTTGATTCTCGTTTCAATGCCCGGCTTGGCGATTTTGGGTTAGCTCGGTGGCTAGAACATGAATTTAAGTACCAAAATGTTTCACCCTCGGTCAAACACTACCAAGTCAAGGCGGCAGATACCACACGCATTGGCGGCACAATCGGCTACTTGTCGCCGGAAAGCTTCCAGAAAGGTGGTCTTGCCACGGCCAAATCCGATGTTTTCAGCTTTGGGATCGTGTTACTCGAAATTGCTTCGGGAAGAAAAGCAGTCGA...
CDS
下载 CDS FASTA1434 bp · LXL04_033274|LXL04_033274|OH1004|CDS
ATGCTTGATTCTCGTTTCAATGCCCGGCTTGGCGATTTTGGGTTAGCTCGGTGGCTAGAACATGAATTTAAGTACCAAAATGTTTCACCCTCGGTCAAACACTACCAAGTCAAGGCGGCAGATACCACACGCATTGGCGGCACAATCGGCTACTTGTCGCCGGAAAGCTTCCAGAAAGGTGGTCTTGCCACGGCCAAATCCGATGTTTTCAGCTTTGGGATCGTGTTACTCGAAATTGCTTCGGGAAGAAAAGCAGTCGA...
477 aa · LXL04_033274|LXL04_033274|OH1004|PROTEIN
MLDSRFNARLGDFGLARWLEHEFKYQNVSPSVKHYQVKAADTTRIGGTIGYLSPESFQKGGLATAKSDVFSFGIVLLEIASGRKAVDLTLPEGSYKVPDMELLILALLCTLHDPGSRPNMKWVVDALSGNTCVKIPDLPSFKSHPRYISVSPITSTSITNTTTTITITTTTTTTTTTTVSSGSTASTTTKAELDFGTAYHGVINNSEIIIKRLGMKTCPALRGRFANELSNMGRLNHRNLVQLYGWCTEHGEMLIVYHCI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_033274 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_033274 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:40018660-40020365 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to LECRKS2: Receptor like protein kinase S.2 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0009617 response to bacterium 生物过程 GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009845 seed germination 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0071395 cellular response to jasmonic acid stimulus 生物过程 GO:0071446 cellular response to salicylic acid stimulus 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G32800 ath:AT3G55550 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.652
细胞质0.265
细胞核0.228
内质网0.040
高尔基体0.029
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00069.32Pkinase1-85 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr2-84 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr194-437 aaPF00069.32Pkinase195-435 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_033274 | PF00069.32 | Pkinase | 1 | 85 | 6.5e-24 | 85.4 |
| LXL04_033274 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 2 | 84 | 6e-31 | 108.4 |
| LXL04_033274 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 194 | 437 | 6e-31 | 108.4 |
| LXL04_033274 | PF00069.32 | Pkinase | 195 | 435 | 6.5e-24 | 85.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
O48837 | 拟南芥 | Receptor like protein kinase S.2 | 45.576% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9M2S4 | 拟南芥 | L-type lectin-domain containing receptor kinase S.4 | 34.831% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9M020 | 拟南芥 | Lectin-domain containing receptor kinase VI.3 | 33.579% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O81291 | 拟南芥 | L-type lectin-domain containing receptor kinase IV.4 | 33.829% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q66GN2 | 拟南芥 | Lectin-domain containing receptor kinase VI.4 | 33.212% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |