基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_033273
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 40017150-40018367
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA620 bp · LXL04_033273|LXL04_033273|OH1004|cDNA
ATGAAGGAGGTCAAAGTCAAACAAAGCAGTACATCTGGAAAGAGCAATATCAGATCTATAAATAGCATAATTCTCAGGTTTCCTCATTTCAGAGAGGGATTGCAAGAGGTTAGGGATGTTTTTCGACAGTACGATACTGATGCTAATGGAACTATCAACCGCGAGGAGCTAAAAAAATGCTTACAAGAATTACAATTGGACTGCACTGAGCAAGAAATTGATGATCTTTTTGAGTCTTGCGATTTGACTGGGAAAAAAGG...
CDS
下载 CDS FASTA579 bp · LXL04_033273|LXL04_033273|OH1004|CDS
ATGAAGGAGGTCAAAGTCAAACAAAGCAGTACATCTGGAAAGAGCAATATCAGATCTATAAATAGCATAATTCTCAGGTTTCCTCATTTCAGAGAGGGATTGCAAGAGGTTAGGGATGTTTTTCGACAGTACGATACTGATGCTAATGGAACTATCAACCGCGAGGAGCTAAAAAAATGCTTACAAGAATTACAATTGGACTGCACTGAGCAAGAAATTGATGATCTTTTTGAGTCTTGCGATTTGACTGGGAAAAAAGG...
192 aa · LXL04_033273|LXL04_033273|OH1004|PROTEIN
MKEVKVKQSSTSGKSNIRSINSIILRFPHFREGLQEVRDVFRQYDTDANGTINREELKKCLQELQLDCTEQEIDDLFESCDLTGKKGMKFNEFVVVLCLVYLLVDTSSSHHTATKIGSPVLKATFDTMIEAFLYLDKNGDGKLNKKDITKAMNDHFHLEKSPIHITATRFKEMDWNKDGKVGFREFLFSLIR
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_033273 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_033273 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:40017150-40018367 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | 暂无功能描述 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程 GO:0009612 response to mechanical stimulus 生物过程 GO:0009646 response to absence of light 生物过程 GO:0009652 thigmotropism 生物过程 GO:0010152 pollen maturation 生物过程 GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程 GO:0051301 cell division 生物过程 GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程 GO:1902584 positive regulation of response to water deprivation 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G41100 ath:AT3G24110 ath:AT4G26470 dosa:Os03g0688300 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.571
细胞膜0.256
细胞核0.236
线粒体0.068
内质网0.060
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF13499.13EF-hand_736-94 aaPF00036.39EF-hand_136-63 aaPF13405.13EF-hand_636-64 aaPF13202.13EF-hand_538-61 aaPF10591.16SPARC_Ca_bdg40-94 aaPF13499.13EF-hand_7126-187 aaPF13405.13EF-hand_6128-153 aaPF00036.39EF-hand_1129-153 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_033273 | PF13499.13 | EF-hand_7 | 36 | 94 | 1.8e-20 | 73.8 |
| LXL04_033273 | PF00036.39 | EF-hand_1 | 36 | 63 | 2.3e-18 | 65.0 |
| LXL04_033273 | PF13405.13 | EF-hand_6 | 36 | 64 | 9.8e-17 | 59.8 |
| LXL04_033273 | PF13202.13 | EF-hand_5 | 38 | 61 | 4.4e-15 | 55.1 |
| LXL04_033273 | PF10591.16 | SPARC_Ca_bdg | 40 | 94 | 1e-07 | 33.0 |
| LXL04_033273 | PF13499.13 | EF-hand_7 | 126 | 187 | 1.8e-20 | 73.8 |
| LXL04_033273 | PF13405.13 | EF-hand_6 | 128 | 153 | 9.8e-17 | 59.8 |
| LXL04_033273 | PF00036.39 | EF-hand_1 | 129 | 153 | 2.3e-18 | 65.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。