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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_033022
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 34046897-34048783 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1658 bp · LXL04_033022|LXL04_033022|OH1004|cDNA

ACAGCTTTATCTCCTTAGCTGGTTATCAGATACCCATCTTCTCTTCTATTTACATTTTCTTCATTTCCACACCATTGAACAACAATGGCGGCTGTAGCCACTCTACCGGAGCATGAAGAAGTCATATCCATCCCCACCACCACTACTCCGCCGCAACCCTTTGCTCTGCCGGTGGATTCGGAGAACAAAGCCACAAAGATGAAGATCTTCTCAGTAGCCCAACCCCACATGAGAGCCTTCCATCTCTCATGGCTTTCTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1563 bp · LXL04_033022|LXL04_033022|OH1004|CDS

ATGGCGGCTGTAGCCACTCTACCGGAGCATGAAGAAGTCATATCCATCCCCACCACCACTACTCCGCCGCAACCCTTTGCTCTGCCGGTGGATTCGGAGAACAAAGCCACAAAGATGAAGATCTTCTCAGTAGCCCAACCCCACATGAGAGCCTTCCATCTCTCATGGCTTTCTTTCTGCACTTGTGTCATCTCCACCTTCGCCGCCGCCCCGCTTGTTCCCATCATCCGGGACAACCTCAACCTCACCCGCGCTGACAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

520 aa · LXL04_033022|LXL04_033022|OH1004|PROTEIN

MAAVATLPEHEEVISIPTTTTPPQPFALPVDSENKATKMKIFSVAQPHMRAFHLSWLSFCTCVISTFAAAPLVPIIRDNLNLTRADISNAGIASVSGSILSRLVMGVLCDLVGPRYGCAVINILAAPVVFSVSFVADAGGYVAVRFMIGFSLATFVSCQYWTSVMFNGKIIGVVNGVSGGWGDVGGGLTQLLMPVLFHVISHMLGATPFTVWRIAFFIPGWFHVIVGVLVLLYGQDLPDGNFAQIRKNGSASKDKFSKVF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_033022
TK1151 IDTkA08G223250
OH-1004 IDLXL04_033022
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.046 / OH-1004 99.808
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_033022
位置Chr07:34046897-34048783 (+)
描述Similar to NRT2.4: High affinity nitrate transporter 2.4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g60770 参与高亲和力硝酸盐转运。
Disruption of the nitrate transporter genes AtNRT2.1 and AtNRT2.2 restricts growth at low external nitrate concentration.2004 · DOI: 10.1007/s00425-004-1266-x
At3g45060 参与高亲和硝酸盐转运。
The NRT2.5 and NRT2.6 genes are involved in growth promotion of Arabidopsis by the plant growth-promoting rhizobacterium (PGPR) strain Phyllobacterium brassicacearum STM196.2013 · DOI: 10.1111/nph.12158
At1g08090 参与硝酸盐转运，但似乎不能自行介导转运。
Major alterations of the regulation of root NO(3)(-) uptake are associated with the mutation of Nrt2.1 and Nrt2.2 genes in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1104/pp.127.1.262
Disruption of the nitrate transporter genes AtNRT2.1 and AtNRT2.2 restricts growth at low external nitrate concentration.2004 · DOI: 10.1007/s00425-004-1266-x
The putative high-affinity nitrate transporter NRT2.1 represses lateral root initiation in response to nutritional cues.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0504219102
A central role for the nitrate transporter NRT2.1 in the integrated morphological and physiological responses of the root system to nitrogen limitation in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.075721
Dissection of the AtNRT2.1:AtNRT2.2 inducible high-affinity nitrate transporter gene cluster.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.091223
Nitrate signaling and the two component high affinity uptake system in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.4161/psb.2.4.3870
At5g60780 参与高亲和力硝酸盐转运。 暂无已核实直接文献
At1g08100 参与高亲和力硝酸盐转运。
Major alterations of the regulation of root NO(3)(-) uptake are associated with the mutation of Nrt2.1 and Nrt2.2 genes in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1104/pp.127.1.262
Disruption of the nitrate transporter genes AtNRT2.1 and AtNRT2.2 restricts growth at low external nitrate concentration.2004 · DOI: 10.1007/s00425-004-1266-x
Dissection of the AtNRT2.1:AtNRT2.2 inducible high-affinity nitrate transporter gene cluster.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.091223

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033022 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010167 response to nitrate 生物过程
GO:0015706 nitrate transmembrane transport 生物过程
GO:0042128 nitrate assimilation 生物过程
GO:0048527 lateral root development 生物过程
GO:0071249 cellular response to nitrate 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0015112 nitrate transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08090
ath:AT1G08100
ath:AT3G45060
ath:AT5G60770
ath:AT5G60780
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.656
排名 1 · LXL04_033022 · OH-1004
细胞质0.137
排名 2 · LXL04_033022 · OH-1004
溶酶体／液泡0.106
排名 3 · LXL04_033022 · OH-1004
内质网0.098
排名 4 · LXL04_033022 · OH-1004
高尔基体0.058
排名 5 · LXL04_033022 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07690.22MFS_156-413 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_033022PF07690.22MFS_1564131.7e-2074.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FJH8拟南芥High affinity nitrate transporter 2.465.243%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LXH0拟南芥High affinity nitrate transporter 2.668.725%Swiss-Prot强数据库同源证据
O82811拟南芥High-affinity nitrate transporter 2.165.269%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FJH7拟南芥High affinity nitrate transporter 2.368.526%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LMZ9拟南芥High-affinity nitrate transporter 2.263.783%Swiss-Prot强数据库同源证据

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