基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_032394
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 21714216-21721808
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4134 bp · LXL04_032394|LXL04_032394|OH1004|cDNA
ATGTCTTATGCACTTAATGCGATTTCTCACTTACGAATCCCATATGAAGATCATATCGAATCAGCTACCGATGACATGGATGATGAAAACATCATTGGCGAAAACGATGAATGTGTAAGTTACAAAGGGAAACTTTTGTGGTCTGGACAGTTGATCGATATAGTTGCACAAGAATATGATCGCCATCTCTCTGAAGGTGTCTCCAAGTTTGAAGCTAATGCTTTAATACTTTCTAGTCTCAAGCATAAAAACATTGTCTC...
CDS
下载 CDS FASTA4134 bp · LXL04_032394|LXL04_032394|OH1004|CDS
ATGTCTTATGCACTTAATGCGATTTCTCACTTACGAATCCCATATGAAGATCATATCGAATCAGCTACCGATGACATGGATGATGAAAACATCATTGGCGAAAACGATGAATGTGTAAGTTACAAAGGGAAACTTTTGTGGTCTGGACAGTTGATCGATATAGTTGCACAAGAATATGATCGCCATCTCTCTGAAGGTGTCTCCAAGTTTGAAGCTAATGCTTTAATACTTTCTAGTCTCAAGCATAAAAACATTGTCTC...
1377 aa · LXL04_032394|LXL04_032394|OH1004|PROTEIN
MSYALNAISHLRIPYEDHIESATDDMDDENIIGENDECVSYKGKLLWSGQLIDIVAQEYDRHLSEGVSKFEANALILSSLKHKNIVSLVGFCEDPYWVIIVTKYEAHNKSLDKYLNDYSSLSWMKRLRICVGIARGLSYLHYEEGRNYSVIHCNIKSSSILLDDNWEPKISYFGNSIRTPVAQRHRLLHAKHSGTIGYMDEIYEKTKGVTHKVDVFAFGVVLFEVLFGCEAWSAEDDDVDGESLVQSARCHYQKGTLEDM...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_032394 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_032394 |
|---|---|
| 位置 | Chr07:21714216-21721808 (+) |
| 描述 | Similar to At5g59700: Probable receptor-like protein kinase At5g59700 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程 GO:0010483 pollen tube reception 生物过程 GO:0051924 regulation of calcium ion transport 生物过程 GO:0080147 root hair cell development 生物过程 GO:0097275 intracellular ammonium homeostasis 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分 GO:0043680 filiform apparatus 细胞组分 GO:0004672 protein kinase activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G59700 ath:AT5G61350 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.486
细胞膜0.358
细胞核0.306
内质网0.051
溶酶体／液泡0.039
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr64-302 aaPF00069.32Pkinase68-300 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr365-590 aaPF00069.32Pkinase398-663 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr706-960 aaPF00069.32Pkinase719-961 aaPF14299.14PP21034-1173 aaPF14299.14PP21210-1372 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_032394 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 64 | 302 | 4.7e-104 | 348.0 |
| LXL04_032394 | PF00069.32 | Pkinase | 68 | 300 | 2.3e-93 | 313.1 |
| LXL04_032394 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 365 | 590 | 4.7e-104 | 348.0 |
| LXL04_032394 | PF00069.32 | Pkinase | 398 | 663 | 2.3e-93 | 313.1 |
| LXL04_032394 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 706 | 960 | 4.7e-104 | 348.0 |
| LXL04_032394 | PF00069.32 | Pkinase | 719 | 961 | 2.3e-93 | 313.1 |
| LXL04_032394 | PF14299.14 | PP2 | 1034 | 1173 | 6.7e-41 | 140.4 |
| LXL04_032394 | PF14299.14 | PP2 | 1210 | 1372 | 6.7e-41 | 140.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9FN92 | 拟南芥 | Probable receptor-like protein kinase At5g59700 | 40.774% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FLJ8 | 拟南芥 | Probable receptor-like protein kinase At5g61350 | 42.169% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
O22187 | 拟南芥 | Probable receptor-like protein kinase At2g23200 | 42.857% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q3E8W4 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase ANXUR2 | 40.122% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9LX66 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase HERK 1 | 41.018% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |