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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_032273
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 19793729-19799117 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2406 bp · LXL04_032273|LXL04_032273|OH1004|cDNA

ATGACTTCAGAAAACGACATACATGCCTGGATCAGAAAGATGCCTAAACTTGAAAATGCCTATCTGCAAAAATTCAGACTTTACGAATCTCGCTCGAACTTTTATATGGTTGGACGCAGTAAGAACAGATCAGTATGGAGGGTATTAAAGATTGACAGGACAGAAGCTTCAGAGCTAAATATCATTGAGGATCCTACAATGTACACAGAAACCGAATGTAGTGAATTGCTAACGCGTATCCATGATGGAAATAAGTGCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2406 bp · LXL04_032273|LXL04_032273|OH1004|CDS

ATGACTTCAGAAAACGACATACATGCCTGGATCAGAAAGATGCCTAAACTTGAAAATGCCTATCTGCAAAAATTCAGACTTTACGAATCTCGCTCGAACTTTTATATGGTTGGACGCAGTAAGAACAGATCAGTATGGAGGGTATTAAAGATTGACAGGACAGAAGCTTCAGAGCTAAATATCATTGAGGATCCTACAATGTACACAGAAACCGAATGTAGTGAATTGCTAACGCGTATCCATGATGGAAATAAGTGCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

801 aa · LXL04_032273|LXL04_032273|OH1004|PROTEIN

MTSENDIHAWIRKMPKLENAYLQKFRLYESRSNFYMVGRSKNRSVWRVLKIDRTEASELNIIEDPTMYTETECSELLTRIHDGNKCIGGLKFVTICYGIVGFIKFLGPYYMLLITKRKKMGVICGHAIYAITKSEILAIPNSTIASNMDCSKNENRYKKLLCSVDLTKDFYFSYSYNIMHSLQKNLSTHETCQDVHETMFVWNEFLTTEIHNQLNNNLWTVSLIYGFFKQVKLLLSEKEFKLTLIARRSRHYAGTRYLKR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_032273
TK1151 IDTkA08G163150
OH-1004 IDLXL04_032273
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)89.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 89.492 / OH-1004 33.833
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_032273
位置Chr07:19793729-19799117 (+)
描述Similar to SAC2: Phosphoinositide phosphatase SAC2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g14205 PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 暂无已核实直接文献
At3g43220 PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 暂无已核实直接文献
At5g20840 PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 暂无已核实直接文献
At1g22620 磷脂肌醇磷酸酶，催化磷脂酰肌醇-3,5-二磷酸（PtdIns(3,5)P2）的水解。
Mutation of SAC1, an Arabidopsis SAC domain phosphoinositide phosphatase, causes alterations in cell morphogenesis, cell wall synthesis, and actin organization.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.031377
At1g17340 PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032273 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007010 cytoskeleton organization 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0036092 phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0046856 phosphatidylinositol dephosphorylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0004438 phosphatidylinositol-3-phosphate phosphatase activity 分子功能
GO:0043812 phosphatidylinositol-4-phosphate phosphatase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17340
ath:AT1G22620
ath:AT3G14205
ath:AT3G43220
ath:AT5G20840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.576
排名 1 · LXL04_032273 · OH-1004
细胞核0.219
排名 2 · LXL04_032273 · OH-1004
高尔基体0.159
排名 3 · LXL04_032273 · OH-1004
细胞膜0.144
排名 4 · LXL04_032273 · OH-1004
溶酶体／液泡0.126
排名 5 · LXL04_032273 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02383.24Syja_N97-394 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_032273PF02383.24Syja_N973948.4e-85285.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94A27拟南芥Phosphoinositide phosphatase SAC256.382%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7XZU2拟南芥Phosphoinositide phosphatase SAC356.965%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7XZU1拟南芥Phosphoinositide phosphatase SAC455.583%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7XZU3拟南芥Phosphatidylinositol-3-phosphatase SAC153.045%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8RW97拟南芥Phosphoinositide phosphatase SAC553.797%Swiss-Prot强数据库同源证据

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