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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_032039
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 15403594-15411153 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3309 bp · LXL04_032039|LXL04_032039|OH1004|cDNA

ATGGCGTATTGTCCCTTGATTAAATGTAAATCATGCTTATATTGGCCTCTGATGTTGATGATGATACATGTTCATATGGTCTGGCAAATACACGGGGACTGTATAGAAGAGGAGAGAAAGGCACTACTAGAAATTAAAGCCTCCTATATCAAGACATATGATTCAAAAATTGACTATTTTCTCCCTACCTGGGTTGATTATGGCAATAGTACCCTTAAAAATGGTGGCGGGGACTGTTGTGATTGGGAGAGGATCAGCTG...

CDS

下载 CDS FASTA

3309 bp · LXL04_032039|LXL04_032039|OH1004|CDS

ATGGCGTATTGTCCCTTGATTAAATGTAAATCATGCTTATATTGGCCTCTGATGTTGATGATGATACATGTTCATATGGTCTGGCAAATACACGGGGACTGTATAGAAGAGGAGAGAAAGGCACTACTAGAAATTAAAGCCTCCTATATCAAGACATATGATTCAAAAATTGACTATTTTCTCCCTACCTGGGTTGATTATGGCAATAGTACCCTTAAAAATGGTGGCGGGGACTGTTGTGATTGGGAGAGGATCAGCTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1102 aa · LXL04_032039|LXL04_032039|OH1004|PROTEIN

MAYCPLIKCKSCLYWPLMLMMIHVHMVWQIHGDCIEEERKALLEIKASYIKTYDSKIDYFLPTWVDYGNSTLKNGGGDCCDWERISCNTTTGHITDVSLSRLRGLDVYWGDGSKLWSLNVSLFLHFRELTSLDLSDAYLDKEILKTDFAALENLEVLNLTECEFTGTLNIQGFARVSTLRKLKTLNLGHNGFNESIITSLLTISSLTNVDLSGNPFSGPFPAQELARLTNIEKLDISDTGLDGTPNIQACKSLSRLKRLK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_032039
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_032039
位置Chr07:15403594-15411153 (+)
描述Similar to RLP13: Receptor-like protein 13
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g74170 受体样蛋白 13。 暂无已核实直接文献
At1g07390 参与植物防御。
The receptor-like protein ReMAX of Arabidopsis detects the microbe-associated molecular pattern eMax from Xanthomonas.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.110833
Perception of the novel MAMP eMax from different Xanthomonas species requires the Arabidopsis receptor-like protein ReMAX and the receptor kinase SOBIR.2013 · DOI: 10.4161/psb.27408
At1g74190 受体样蛋白 15。 暂无已核实直接文献
At5g49290 类受体蛋白56。 暂无已核实直接文献
At1g74180 类受体蛋白14。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032039 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07390
ath:AT1G74170
ath:AT1G74190
ath:AT5G49290
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.858
排名 1 · LXL04_032039 · OH-1004
内质网0.092
排名 2 · LXL04_032039 · OH-1004
细胞质0.060
排名 3 · LXL04_032039 · OH-1004
细胞核0.042
排名 4 · LXL04_032039 · OH-1004
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · LXL04_032039 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598.2LRR_14132-290 aa
PF23598.2LRR_14297-490 aa
PF13855.13LRR_8303-362 aa
PF13855.13LRR_8365-410 aa
PF13855.13LRR_8554-612 aa
PF13855.13LRR_8601-637 aa
PF13855.13LRR_8651-709 aa
PF23598.2LRR_14733-837 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_032039PF23598.2LRR_141322904.8e-30105.2
LXL04_032039PF23598.2LRR_142974904.8e-30105.2
LXL04_032039PF13855.13LRR_83033625.1e-54180.6
LXL04_032039PF13855.13LRR_83654105.1e-54180.6
LXL04_032039PF13855.13LRR_85546125.1e-54180.6
LXL04_032039PF13855.13LRR_86016375.1e-54180.6
LXL04_032039PF13855.13LRR_86517095.1e-54180.6
LXL04_032039PF23598.2LRR_147338374.8e-30105.2
LXL04_032039PF13855.13LRR_87438015.1e-54180.6
LXL04_032039PF13855.13LRR_89059605.1e-54180.6
LXL04_032039PF13855.13LRR_89439845.1e-54180.6
LXL04_032039PF12799.14LRR_49509883.7e-35119.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C6A6拟南芥Receptor-like protein 1337.477%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LNV9拟南芥Receptor-like protein 135.953%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9C6A8拟南芥Receptor-like protein 1539.796%Swiss-Prot中等数据库同源证据
F4K4T3拟南芥Receptor-like protein 5635.893%Swiss-Prot中等数据库同源证据
F4HTV4拟南芥Receptor-like protein 1436.239%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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