基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_031241
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 3029889-3031240
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA984 bp · LXL04_031241|LXL04_031241|OH1004|cDNA
ATGATGGATCCAAAGTTCGCCGGGAACCCAATCCCCACTTCACCGTATTATGGTGGTGGTCGGACTGATATCGATCAGATGCCGGAAACGCCCAATCGCGGAAGCCACCACCGCCGGGCCATGTCGGAGACCTTCTTCCGGTTCCCAGACGAAGACATGCTACTAGACGACGTCGTTGCGGACTTCAACTTCGCCAATATAGACCTCCCATCGCTGTCCTGCGACGCTCCTGTACCTACCACAACGGAAGATTCTTGTAA...
CDS
下载 CDS FASTA984 bp · LXL04_031241|LXL04_031241|OH1004|CDS
ATGATGGATCCAAAGTTCGCCGGGAACCCAATCCCCACTTCACCGTATTATGGTGGTGGTCGGACTGATATCGATCAGATGCCGGAAACGCCCAATCGCGGAAGCCACCACCGCCGGGCCATGTCGGAGACCTTCTTCCGGTTCCCAGACGAAGACATGCTACTAGACGACGTCGTTGCGGACTTCAACTTCGCCAATATAGACCTCCCATCGCTGTCCTGCGACGCTCCTGTACCTACCACAACGGAAGATTCTTGTAA...
327 aa · LXL04_031241|LXL04_031241|OH1004|PROTEIN
MMDPKFAGNPIPTSPYYGGGRTDIDQMPETPNRGSHHRRAMSETFFRFPDEDMLLDDVVADFNFANIDLPSLSCDAPVPTTTEDSCKSDRESNDVNASKLTARKPLGYSSHIRSLSVGSDFFDGFGLSSAAEPEKLGGGGAYRHRHSSSMDGSPATSFEGDSVSMMLDNSKKALPPDKLAELSLIDPKRAKRILANRQSAARSKERKTRYTSELERKVQTLQTEATTLSAEVTKLQRDTSGLTSENKELKLRLEAMEQHA...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_031241 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_031241 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:3029889-3031240 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to VIP1: Transcription factor VIP1 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程 GO:0007231 osmosensory signaling pathway 生物过程 GO:0009294 DNA-mediated transformation 生物过程 GO:0009652 thigmotropism 生物过程 GO:0009970 cellular response to sulfate starvation 生物过程 GO:0045596 negative regulation of cell differentiation 生物过程 GO:0051170 import into nucleus 生物过程 GO:1902358 sulfate transmembrane transport 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G43700 ath:AT2G31370 ath:AT2G40620 dosa:Os03g0336200 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.973
细胞质0.099
细胞膜0.027
内质网0.014
质体0.011
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF07716.21bZIP_2186-237 aaPF00170.27bZIP_1188-247 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_031241 | PF07716.21 | bZIP_2 | 186 | 237 | 3.8e-07 | 30.7 |
| LXL04_031241 | PF00170.27 | bZIP_1 | 188 | 247 | 1.1e-10 | 42.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9MA75 | 拟南芥 | Transcription factor VIP1 | 46.313% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q04088 | 拟南芥 | Probable transcription factor PosF21 | 45.455% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O22873 | 拟南芥 | bZIP transcription factor 18 | 46.360% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q6S4P4 | 水稻 | Transcription factor RF2b | 43.945% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q69IL4 | 水稻 | Transcription factor RF2a | 62.838% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |