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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_031225
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 2756794-2762139 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3378 bp · LXL04_031225|LXL04_031225|OH1004|cDNA

ATGAGATAGAAGGTACTTGAAGAAAGCGAGTACAGTGAGGGAAACAGGAGAAACGCTTTCTACTTTTTAGAAGAATTTTTTTATCTCTAAGATTTTCGTTCATGTTCTGTACATGTAATGGAAACCAAAGGAAGACTGATTGCAGGTTCACATAACAGAAACGAGTTTGTTCTTATCAATGCTGATGATGTCGGAAGAGTGACTTCTGTAAAAGAATTGAGTGGACAGATTTGCAAGATTTGTGGAGATGAGATTGAAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

3261 bp · LXL04_031225|LXL04_031225|OH1004|CDS

ATGGAAACCAAAGGAAGACTGATTGCAGGTTCACATAACAGAAACGAGTTTGTTCTTATCAATGCTGATGATGTCGGAAGAGTGACTTCTGTAAAAGAATTGAGTGGACAGATTTGCAAGATTTGTGGAGATGAGATTGAAATTACTGTGGATGAGGAACCATTTGTGGCGTGCAATGAATGTGCATTCCCTATTTGCAGACCTTGCTATGAATATGAAAGAAGAGAAGGTAGTCAAGGATGCCCTCAATGCAAAACCAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1086 aa · LXL04_031225|LXL04_031225|OH1004|PROTEIN

METKGRLIAGSHNRNEFVLINADDVGRVTSVKELSGQICKICGDEIEITVDEEPFVACNECAFPICRPCYEYERREGSQGCPQCKTRYKRIKGSPRVEGDEEEDEFDDLDDEFDIGNHEEVLFSRFAESANNYGFATPSKMDGGTLNPDIPLLTYHQVDDEVSPDKNAIIIPPIMRRSKRVHPMQFCDTDSVVSMPPRPMDPKRDIAVYGYGTVAWKDRMEAWRKRQSDKLEMVTHDGHSACEHDGDMDDPDLPKMDEGR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_031225
TK1151 IDTkA08G095810
OH-1004 IDLXL04_031225
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.161 / OH-1004 28.361
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_031225
位置Chr07:2756794-2762139 (-)
描述Similar to CESA6: Cellulose synthase A catalytic subunit 6 [UDP-forming]
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g64740 纤维素合酶末端复合物的催化亚基，是 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶所需的。
PROCUSTE1 encodes a cellulose synthase required for normal cell elongation specifically in roots and dark-grown hypocotyls of Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.12.2409
Resistance against herbicide isoxaben and cellulose deficiency caused by distinct mutations in same cellulose synthase isoform CESA6.2002 · DOI: 10.1104/pp.010822
Genetic evidence for three unique components in primary cell-wall cellulose synthase complexes in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706592104
Organization of cellulose synthase complexes involved in primary cell wall synthesis in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706569104
At2g21770 可能的纤维素合酶终端复合体（‘花状体’）的催化亚基，参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶，这是细胞壁形成的主要机制。 暂无已核实直接文献
At5g09870 纤维素合酶末端复合物（“玫瑰花结”）的催化亚基，是 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶（细胞壁形成的主要机制）所需的。
Organization of cellulose synthase complexes involved in primary cell wall synthesis in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706569104
At4g39350 纤维素合酶末端复合物的催化亚基，是 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶所需的。
Functional analysis of the cellulose synthase genes CesA1, CesA2, and CesA3 in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1104/pp.010931
Knockout of the AtCESA2 gene affects microtubule orientation and causes abnormal cell expansion in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.088393
Organization of cellulose synthase complexes involved in primary cell wall synthesis in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706569104

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0424400 可能的纤维素合酶终端复合体（‘花状体’）的催化亚基，参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶，这是细胞壁形成的主要机制。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031225 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009833 plant-type primary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0010192 mucilage biosynthetic process 生物过程
GO:0010214 seed coat development 生物过程
GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0048354 mucilage biosynthetic process involved in seed coat development 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G21770
ath:AT4G39350
ath:AT5G09870
ath:AT5G64740
dosa:Os07g0424400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.562
排名 1 · LXL04_031225 · OH-1004
内质网0.193
排名 2 · LXL04_031225 · OH-1004
高尔基体0.157
排名 3 · LXL04_031225 · OH-1004
细胞质0.135
排名 4 · LXL04_031225 · OH-1004
溶酶体／液泡0.090
排名 5 · LXL04_031225 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14569.13zf-UDP30-105 aa
PF03552.21Cellulose_synt357-1073 aa
PF13632.13Glyco_trans_2_3776-881 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_031225PF14569.13zf-UDP301051.8e-39134.3
LXL04_031225PF03552.21Cellulose_synt35710731327.7
LXL04_031225PF13632.13Glyco_trans_2_37768817.7e-0729.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94JQ6拟南芥Cellulose synthase A catalytic subunit 6 [UDP-forming]76.923%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SJ22拟南芥Probable cellulose synthase A catalytic subunit 9 [UDP-forming]76.169%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8L778拟南芥Cellulose synthase A catalytic subunit 5 [UDP-forming]76.562%Swiss-Prot强数据库同源证据
O48947拟南芥Cellulose synthase A catalytic subunit 2 [UDP-forming]77.127%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q69V23水稻Probable cellulose synthase A catalytic subunit 3 [UDP-forming]69.475%Swiss-Prot强数据库同源证据

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