基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_031167
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 1572578-1573986
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA936 bp · LXL04_031167|LXL04_031167|OH1004|cDNA
ATGGGAAGATCTCCTTCTTCTGAAGAAAACAACCTCAAAAAGGGTCCATGGACTCCTGAAGAAGATCAAAAGCTGACTGATTACATTCAGAAACATGGCCATGGGAGTTGGAGAGCTCTCCCTAAACTTGCCGGTCTGAAAAGATGTGGAAAGAGTTGCAGACTGAGATGGACGAATTATCTGAGACCAGATATCAAGCGAGGAAAATTCTCAAACGAAGAAGAGAACACCATTCTTCACCTTCACTCCATTCTTGGAAA...
CDS
下载 CDS FASTA936 bp · LXL04_031167|LXL04_031167|OH1004|CDS
ATGGGAAGATCTCCTTCTTCTGAAGAAAACAACCTCAAAAAGGGTCCATGGACTCCTGAAGAAGATCAAAAGCTGACTGATTACATTCAGAAACATGGCCATGGGAGTTGGAGAGCTCTCCCTAAACTTGCCGGTCTGAAAAGATGTGGAAAGAGTTGCAGACTGAGATGGACGAATTATCTGAGACCAGATATCAAGCGAGGAAAATTCTCAAACGAAGAAGAGAACACCATTCTTCACCTTCACTCCATTCTTGGAAA...
311 aa · LXL04_031167|LXL04_031167|OH1004|PROTEIN
MGRSPSSEENNLKKGPWTPEEDQKLTDYIQKHGHGSWRALPKLAGLKRCGKSCRLRWTNYLRPDIKRGKFSNEEENTILHLHSILGNKWSAIAAHLPGRTDNEIKNYWNTHLKKRLIQMGIDPMTHQPKTDLFSCLPQLIALANLKELLEQTQLAHNLQYFNLLRQPLAIAENNPDLATALNAINQEPDPYFSNNSLQVGQERVEMSDFFSVENAAVAIGGGGSQPLQQQVPFDQEDVVQSQMGLINDKSSSSTWNLLPP...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_031167 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_031167 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:1572578-1573986 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to MYB93: Transcription factor MYB93 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0010345 suberin biosynthetic process 生物过程 GO:0045723 positive regulation of fatty acid biosynthetic process 生物过程 GO:0071365 cellular response to auxin stimulus 生物过程 GO:1901332 negative regulation of lateral root development 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G34670 ath:AT4G05100 ath:AT4G21440 ath:AT5G10280 ath:AT5G65230 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.929
细胞质0.167
细胞膜0.024
内质网0.013
线粒体0.012
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00249.38Myb_DNA-binding14-61 aaPF13921.13Myb_DNA-bind_617-76 aaPF00249.38Myb_DNA-binding67-112 aaPF13921.13Myb_DNA-bind_673-114 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_031167 | PF00249.38 | Myb_DNA-binding | 14 | 61 | 6.3e-38 | 129.4 |
| LXL04_031167 | PF13921.13 | Myb_DNA-bind_6 | 17 | 76 | 1.4e-21 | 77.1 |
| LXL04_031167 | PF00249.38 | Myb_DNA-binding | 67 | 112 | 6.3e-38 | 129.4 |
| LXL04_031167 | PF13921.13 | Myb_DNA-bind_6 | 73 | 114 | 1.4e-21 | 77.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9S9Z2 | 拟南芥 | Transcription factor MYB93 | 49.863% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9SBF3 | 拟南芥 | Transcription factor MYB92 | 46.512% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9FJP2 | 拟南芥 | Transcription factor MYB53 | 67.213% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9LDR8 | 拟南芥 | Transcription factor MYB102 | 60.101% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9M0Y5 | 拟南芥 | Transcription factor MYB74 | 79.231% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |