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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_030258
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 112763552-112768768 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1452 bp · LXL04_030258|LXL04_030258|OH1004|cDNA

ATGGATCCACAGCCGCAAAAGAACACCAACTTCTACAACACATCTTCAGCTCTCGAAGTCGGCGACGATGGATTCCGCAAAAACATCGACGACGACGGCCGCGAAAAACGAACCGGAACTTTGGTTACTGCGAGTGCACATATCATTACTGCTGTGATAGGATCTGGAGTGTTGTCACTGGCATGGGCTATCGCGCAGCTGGGATGGGTGGCCGGACCCGCCGTCCTCATGGCGTTCTCCTTCATAACTTACTTCACCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1452 bp · LXL04_030258|LXL04_030258|OH1004|CDS

ATGGATCCACAGCCGCAAAAGAACACCAACTTCTACAACACATCTTCAGCTCTCGAAGTCGGCGACGATGGATTCCGCAAAAACATCGACGACGACGGCCGCGAAAAACGAACCGGAACTTTGGTTACTGCGAGTGCACATATCATTACTGCTGTGATAGGATCTGGAGTGTTGTCACTGGCATGGGCTATCGCGCAGCTGGGATGGGTGGCCGGACCCGCCGTCCTCATGGCGTTCTCCTTCATAACTTACTTCACCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

483 aa · LXL04_030258|LXL04_030258|OH1004|PROTEIN

MDPQPQKNTNFYNTSSALEVGDDGFRKNIDDDGREKRTGTLVTASAHIITAVIGSGVLSLAWAIAQLGWVAGPAVLMAFSFITYFTSTLLADSYRTPDPVTGKRNYTYMDVVQSNLGGKKVQLCGIAQYVNLVGVTIGYTITASISMVAVRKSNCYHDEGHEADCKLSNYPYMIIFAVIQILLSQIPNFDKLSWLSIVAAVMSFAYSSIGLGLSIAKVAEPGHARTSLTGVEVGVDVTGAEKIWRTFQAIGDIAFAYAYS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_030258
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_030258
位置Chr06:112763552-112768768 (+)
描述Similar to AAP6: Amino acid permease 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g49630 氨基酸-质子同向转运体。 暂无已核实直接文献
At1g58360 氨基酸-质子同向转运体。
AAP1 transports uncharged amino acids into roots of Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03045.x
AAP1 regulates import of amino acids into developing Arabidopsis embryos.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03890.x
Substrate specificity and expression profile of amino acid transporters (AAPs) in Arabidopsis.1995 · DOI: 10.1074/jbc.270.27.16315
Differential expression of two related amino acid transporters with differing substrate specificity in Arabidopsis thaliana.1993 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1993.04060993.x
At1g10010 氨基酸-质子同向转运体。
The amino acid permease AAP8 is important for early seed development in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1007/s00425-007-0527-x
At1g77380 氨基酸-质子同向转运体。
Substrate specificity and expression profile of amino acid transporters (AAPs) in Arabidopsis.1995 · DOI: 10.1074/jbc.270.27.16315
At5g63850 氨基酸-质子同向转运体。
Substrate specificity and expression profile of amino acid transporters (AAPs) in Arabidopsis.1995 · DOI: 10.1074/jbc.270.27.16315

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030258 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0003333 amino acid transmembrane transport 生物过程
GO:0006865 amino acid transport 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0015800 acidic amino acid transport 生物过程
GO:0015802 basic amino acid transport 生物过程
GO:0015804 neutral amino acid transport 生物过程
GO:0015808 L-alanine transport 生物过程
GO:0015810 aspartate transmembrane transport 生物过程
GO:0015827 tryptophan transport 生物过程
GO:0043090 amino acid import 生物过程
GO:0098712 L-glutamate import across plasma membrane 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10010
ath:AT1G58360
ath:AT1G77380
ath:AT5G49630
ath:AT5G63850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.710
排名 1 · LXL04_030258 · OH-1004
溶酶体／液泡0.129
排名 2 · LXL04_030258 · OH-1004
细胞质0.094
排名 3 · LXL04_030258 · OH-1004
内质网0.088
排名 4 · LXL04_030258 · OH-1004
高尔基体0.049
排名 5 · LXL04_030258 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01490.25Aa_trans38-471 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_030258PF01490.25Aa_trans384714.3e-124415.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P92934拟南芥Amino acid permease 677.634%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q42400拟南芥Amino acid permease 170.625%Swiss-Prot强数据库同源证据
O80592拟南芥Amino acid permease 869.068%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q39134拟南芥Amino acid permease 361.359%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FN04拟南芥Amino acid permease 461.050%Swiss-Prot强数据库同源证据

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