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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_029865
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 102446760-102448248 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1323 bp · LXL04_029865|LXL04_029865|OH1004|cDNA

ATGCGTCAGAAGAAATCAGTCCTTCAGATCGGAGAAGAAACCTCGGATGAAAATCCCAGTTTCAAAGTCCAAATCGCACCAGATTACGATGGACAAAAACCCAGTTTCAAACAAGAATCATCAGCCACAAAACAACCTCAGCTCATGATTCCCCAACACCGTAATTCCCACCGGAAAATTCATCAGAAGTCCTTAGTTTGCTGTTCATCTTCAGACGCCCTTTTAGCCACGAAATCAGTTGTTCTGAAAGTGTTGAAGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1323 bp · LXL04_029865|LXL04_029865|OH1004|CDS

ATGCGTCAGAAGAAATCAGTCCTTCAGATCGGAGAAGAAACCTCGGATGAAAATCCCAGTTTCAAAGTCCAAATCGCACCAGATTACGATGGACAAAAACCCAGTTTCAAACAAGAATCATCAGCCACAAAACAACCTCAGCTCATGATTCCCCAACACCGTAATTCCCACCGGAAAATTCATCAGAAGTCCTTAGTTTGCTGTTCATCTTCAGACGCCCTTTTAGCCACGAAATCAGTTGTTCTGAAAGTGTTGAAGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

440 aa · LXL04_029865|LXL04_029865|OH1004|PROTEIN

MRQKKSVLQIGEETSDENPSFKVQIAPDYDGQKPSFKQESSATKQPQLMIPQHRNSHRKIHQKSLVCCSSSDALLATKSVVLKVLKLNHVKVFWIKAPSRVLILICLPSVYFFSLNHHQSLYLYILFLITLCILILSLLNLPSIRLFIARSLSNMGNASKTSPPVVWSIGTKNQFESSTISGFLVKVYSNGDVYEGEFYKGKCSGSGVYYYNMNGRYEGDWVDQKYDGYGVETWAKGSRYRGQYRQGLRHGYGVYKFFTG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_029865
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_029865
位置Chr06:102446760-102448248 (+)
描述Similar to PIP5K1: Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g21980 催化磷脂酰肌醇4,5-二磷酸和磷脂酰肌醇3,4-二磷酸的合成。
AtPIP5K1, an Arabidopsis thaliana phosphatidylinositol phosphate kinase, synthesizes PtdIns(3,4)P(2) and PtdIns(4,5)P(2) in vitro and is inhibited by phosphorylation.2001 · DOI: 10.1042/0264-6021:3590583
At2g41210 磷脂酰肌醇4-磷酸5-激酶5。 暂无已核实直接文献
At3g56960 磷脂酰肌醇 4-磷酸 5-激酶 4。 暂无已核实直接文献
At1g77740 具有磷脂酰肌醇（PtdIns）磷酸激酶活性（可能）。
Arabidopsis Rab-E GTPases exhibit a novel interaction with a plasma-membrane phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase.2009 · DOI: 10.1242/jcs.053488
At1g60890 磷脂酰肌醇4-磷酸5-激酶8。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029865 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009827 plant-type cell wall modification 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0046488 phosphatidylinositol metabolic process 生物过程
GO:0046854 phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016324 apical plasma membrane 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0003785 actin monomer binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G21980
ath:AT2G41210
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.390
排名 1 · LXL04_029865 · OH-1004
细胞核0.379
排名 2 · LXL04_029865 · OH-1004
细胞膜0.140
排名 3 · LXL04_029865 · OH-1004
内质网0.080
排名 4 · LXL04_029865 · OH-1004
线粒体0.070
排名 5 · LXL04_029865 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02493.27MORN217-239 aa
PF02493.27MORN240-262 aa
PF02493.27MORN263-284 aa
PF02493.27MORN286-308 aa
PF02493.27MORN309-331 aa
PF02493.27MORN332-354 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_029865PF02493.27MORN2172393.4e-37124.8
LXL04_029865PF02493.27MORN2402623.4e-37124.8
LXL04_029865PF02493.27MORN2632843.4e-37124.8
LXL04_029865PF02493.27MORN2863083.4e-37124.8
LXL04_029865PF02493.27MORN3093313.4e-37124.8
LXL04_029865PF02493.27MORN3323543.4e-37124.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q56YP2拟南芥Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 135.795%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SLG9拟南芥Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 536.782%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9M1K2拟南芥Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 433.908%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q8L796拟南芥Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 232.990%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q8RY89拟南芥Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 835.393%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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