基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_029720
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 98357184-98359578
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1788 bp · LXL04_029720|LXL04_029720|OH1004|cDNA
ATGGCCGACGAAGCCAAGGCCAAAGGTAACGCCGCGTTCTCTGCCGGAAACTACACCGAAGCTATCCGTCACTTCACTGACGCCATTAACCTCGCCCCTACCAACCACGTTCTTTACTCCAACCGATCTGCCGCTTACGCTTCCCTGAATCAATATTCCGAAGCCCTAACAGATGCTCAAAAGACTGTCGATCTGAAACCCGACTGGTCCAAATGCTACTCACGACTCGGCGCGGCTCATCATGGCTTGCATCAATATGA...
CDS
下载 CDS FASTA1788 bp · LXL04_029720|LXL04_029720|OH1004|CDS
ATGGCCGACGAAGCCAAGGCCAAAGGTAACGCCGCGTTCTCTGCCGGAAACTACACCGAAGCTATCCGTCACTTCACTGACGCCATTAACCTCGCCCCTACCAACCACGTTCTTTACTCCAACCGATCTGCCGCTTACGCTTCCCTGAATCAATATTCCGAAGCCCTAACAGATGCTCAAAAGACTGTCGATCTGAAACCCGACTGGTCCAAATGCTACTCACGACTCGGCGCGGCTCATCATGGCTTGCATCAATATGA...
595 aa · LXL04_029720|LXL04_029720|OH1004|PROTEIN
MADEAKAKGNAAFSAGNYTEAIRHFTDAINLAPTNHVLYSNRSAAYASLNQYSEALTDAQKTVDLKPDWSKCYSRLGAAHHGLHQYDDAVLAYKKGLEVDPNNETLKSGLASAQSDQAAASASSRSRAPPNNLFGDAFGPDMWAKLTADPATRLYMQQPDFVNMMKDLQKNPSNLNLYLKDQRVMQALSVLLNVKMQSHMPGDDMEMPDSPPKERKRPADETETVKEKKREPEPEPEPMEVNEEEKETKEKKAQAQKEKE...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_029720 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_029720 |
|---|---|
| 位置 | Chr06:98357184-98359578 (+) |
| 描述 | Similar to HOP2: Hsp70-Hsp90 organizing protein 2 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006986 response to unfolded protein 生物过程 GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0010286 heat acclimation 生物过程 GO:0034605 cellular response to heat 生物过程 GO:0046686 response to cadmium ion 生物过程 GO:0051131 chaperone-mediated protein complex assembly 生物过程 GO:0070417 cellular response to cold 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0051879 Hsp90 protein binding 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G62740 ath:AT4G12400 gmx:547932 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.657
细胞核0.403
线粒体0.132
细胞膜0.074
内质网0.071
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF25575.1TPR_BSK1_C4-71 aaPF07719.24TPR_27-35 aaPF00515.35TPR_18-35 aaPF13414.13TPR_119-47 aaPF14559.13TPR_1912-56 aaPF00515.35TPR_171-103 aaPF07719.24TPR_271-103 aaPF17830.7STI1-HOP_DP140-192 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_029720 | PF25575.1 | TPR_BSK1_C | 4 | 71 | 3.1e-24 | 85.9 |
| LXL04_029720 | PF07719.24 | TPR_2 | 7 | 35 | 1.2e-44 | 147.4 |
| LXL04_029720 | PF00515.35 | TPR_1 | 8 | 35 | 1.2e-59 | 196.5 |
| LXL04_029720 | PF13414.13 | TPR_11 | 9 | 47 | 4.7e-38 | 129.3 |
| LXL04_029720 | PF14559.13 | TPR_19 | 12 | 56 | 1.5e-22 | 80.4 |
| LXL04_029720 | PF00515.35 | TPR_1 | 71 | 103 | 1.2e-59 | 196.5 |
| LXL04_029720 | PF07719.24 | TPR_2 | 71 | 103 | 1.2e-44 | 147.4 |
| LXL04_029720 | PF17830.7 | STI1-HOP_DP | 140 | 192 | 5.5e-26 | 90.9 |
| LXL04_029720 | PF25575.1 | TPR_BSK1_C | 249 | 317 | 3.1e-24 | 85.9 |
| LXL04_029720 | PF00515.35 | TPR_1 | 262 | 285 | 1.2e-59 | 196.5 |
| LXL04_029720 | PF13414.13 | TPR_11 | 262 | 303 | 4.7e-38 | 129.3 |
| LXL04_029720 | PF25068.3 | ARM_TT21_4th | 262 | 421 | 4.1e-07 | 31.1 |
| LXL04_029720 | PF13431.13 | TPR_17 | 278 | 309 | 7.1e-26 | 89.0 |
| LXL04_029720 | PF00515.35 | TPR_1 | 292 | 317 | 1.2e-59 | 196.5 |
| LXL04_029720 | PF13424.13 | TPR_12 | 292 | 361 | 4.7e-25 | 88.3 |
| LXL04_029720 | PF25575.1 | TPR_BSK1_C | 373 | 462 | 3.1e-24 | 85.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。