基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_029134
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 81654393-81657418
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1776 bp · LXL04_029134|LXL04_029134|OH1004|cDNA
ATGGGCATTCTCCTTACAGTTTTTCAGGGGCCATTGCTATTCTACTTTCTATCACTCTCCTTTCTATTCAACAGACTCCAAGGTCTCACTAGTGATGGTGAAGCTCTTGTAAACTTTCGAACAAACATTATTAGTTCGGATGGTTTGCTTCGTCAATGGAGGCCAGAAGATCCGGATCCATGTGAGTGGAAAGGGGTTACATGTGATTTAAAAACCAAAAGAGTTGTCTATTTGAATCTTTCCAATCACAAGTTGAGTGG...
CDS
下载 CDS FASTA1776 bp · LXL04_029134|LXL04_029134|OH1004|CDS
ATGGGCATTCTCCTTACAGTTTTTCAGGGGCCATTGCTATTCTACTTTCTATCACTCTCCTTTCTATTCAACAGACTCCAAGGTCTCACTAGTGATGGTGAAGCTCTTGTAAACTTTCGAACAAACATTATTAGTTCGGATGGTTTGCTTCGTCAATGGAGGCCAGAAGATCCGGATCCATGTGAGTGGAAAGGGGTTACATGTGATTTAAAAACCAAAAGAGTTGTCTATTTGAATCTTTCCAATCACAAGTTGAGTGG...
591 aa · LXL04_029134|LXL04_029134|OH1004|PROTEIN
MGILLTVFQGPLLFYFLSLSFLFNRLQGLTSDGEALVNFRTNIISSDGLLRQWRPEDPDPCEWKGVTCDLKTKRVVYLNLSNHKLSGPVSPDIGKLDRLKFLDLHYNNFYGAIPPELGNCTELQGLFLQNNYLSGIIPTEIGNLSNLQTLDVSSNSLSGSIPTSIGNLRSLLNFNVSNNFLSGPIPSDGVFDKFGTATFLGNRGLCGKHINQSCKDDDGGSSGSQPTGSQNVKKNSGRLLISASATVGALLLVALMCFWG...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_029134 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_029134 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:81654393-81657418 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to FEI1: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI 1 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0009664 plant-type cell wall organization 生物过程 GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程 GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程 GO:0010192 mucilage biosynthetic process 生物过程 GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程 GO:0030154 cell differentiation 生物过程 GO:0040008 regulation of growth 生物过程 GO:0045089 positive regulation of innate immune response 生物过程 GO:0048354 mucilage biosynthetic process involved in seed coat development 生物过程 GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G31420 ath:AT2G35620 dosa:Os04g0457800 dosa:Os08g0174700 osa:4336035 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.870
内质网0.090
细胞质0.064
细胞核0.039
溶酶体／液泡0.027
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF08263.18LRRNT_230-69 aaPF23598.2LRR_14117-178 aaPF12799.14LRR_4121-158 aaPF13855.13LRR_8122-179 aaPF00069.32Pkinase308-571 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr309-573 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_029134 | PF08263.18 | LRRNT_2 | 30 | 69 | 2.1e-11 | 44.6 |
| LXL04_029134 | PF23598.2 | LRR_14 | 117 | 178 | 1.2e-09 | 38.2 |
| LXL04_029134 | PF12799.14 | LRR_4 | 121 | 158 | 5.2e-06 | 27.3 |
| LXL04_029134 | PF13855.13 | LRR_8 | 122 | 179 | 2.1e-07 | 31.3 |
| LXL04_029134 | PF00069.32 | Pkinase | 308 | 571 | 1.3e-46 | 159.9 |
| LXL04_029134 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 309 | 573 | 2.2e-42 | 145.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
C0LGF4 | 拟南芥 | LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI 1 | 76.408% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
C0LGL9 | 拟南芥 | LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI 2 | 73.793% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
B8BB68 | 水稻 | LRR receptor kinase BAK1 | 36.984% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q6Z4U4 | 水稻 | LRR receptor kinase BAK1 | 36.984% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q7XV05 | 水稻 | LRR receptor kinase SERK2 | 35.409% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |