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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_028538
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 44811641-44814843 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1680 bp · LXL04_028538|LXL04_028538|OH1004|cDNA

atgatCAAACAAAACCTAGACATAGCGGCTTCTCCAGATGGCCAGATGTTGCCGTCAGAAATCCAGGTATTTGCAGCGGCGGAAGTGGTGGCGGCAGCCTACGAAGCCATGACCAATGCGTTGGTGAAGAATTCCCGTCACACGGTTTCACTAGTCTTTGACGAAAGGAATATCACAAACGCCGGCTCAACCATGCGGAGAAACTCACGTAGGTCGGGCAGATATGTCAATGCTAGAAACAAATCCCCCGTCATTACAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1680 bp · LXL04_028538|LXL04_028538|OH1004|CDS

ATGATCAAACAAAACCTAGACATAGCGGCTTCTCCAGATGGCCAGATGTTGCCGTCAGAAATCCAGGTATTTGCAGCGGCGGAAGTGGTGGCGGCAGCCTACGAAGCCATGACCAATGCGTTGGTGAAGAATTCCCGTCACACGGTTTCACTAGTCTTTGACGAAAGGAATATCACAAACGCCGGCTCAACCATGCGGAGAAACTCACGTAGGTCGGGCAGATATGTCAATGCTAGAAACAAATCCCCCGTCATTACAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

559 aa · LXL04_028538|LXL04_028538|OH1004|PROTEIN

MIKQNLDIAASPDGQMLPSEIQVFAAAEVVAAAYEAMTNALVKNSRHTVSLVFDERNITNAGSTMRRNSRRSGRYVNARNKSPVITTSAIAGLLKALLLSKSSHKITTIPNTPISIPLQNHRQPPKSIPLATNMSSPQPPNTATKTRSSRKGFCSGFGDCMTKPTIASSPPSQSYSRLELQVEELHKEVKKEKELKSMYKIRLERTQDYLKYCLQVAQDNGFLDLILNKKDNPQESSSTHSSAIVQASTNPQTPPNVAKN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_028538
TK1151 IDTkA07G166700
OH-1004 IDLXL04_028538
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)90.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 97.317
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_028538
位置Chr06:44811641-44814843 (-)
描述Similar to STY17: Serine/threonine-protein kinase STY17
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g35780 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可特异性磷酸化细胞质中可裂解前序列内的叶绿体前体蛋白。
A protein kinase family in Arabidopsis phosphorylates chloroplast precursor proteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m606580200
The cytosolic kinases STY8, STY17, and STY46 are involved in chloroplast differentiation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182774
At4g38470 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可特异性磷酸化细胞质中可裂解前序列内的叶绿体前体蛋白。
A protein kinase family in Arabidopsis phosphorylates chloroplast precursor proteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m606580200
The cytosolic kinases STY8, STY17, and STY46 are involved in chloroplast differentiation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182774
At2g17700 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可特异性磷酸化细胞质中可裂解前序列内的叶绿体前体蛋白。
A protein kinase family in Arabidopsis phosphorylates chloroplast precursor proteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m606580200
The cytosolic kinases STY8, STY17, and STY46 are involved in chloroplast differentiation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182774

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028538 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009190 cyclic nucleotide biosynthetic process 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004712 protein serine/threonine/tyrosine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G17700
ath:AT4G35780
ath:AT4G38470
vg:9925495
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.479
排名 1 · LXL04_028538 · OH-1004
细胞膜0.342
排名 2 · LXL04_028538 · OH-1004
细胞核0.246
排名 3 · LXL04_028538 · OH-1004
高尔基体0.075
排名 4 · LXL04_028538 · OH-1004
内质网0.053
排名 5 · LXL04_028538 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr282-546 aa
PF00069.32Pkinase283-544 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_028538PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr2825461.4e-42146.5
LXL04_028538PF00069.32Pkinase2835441.2e-44153.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RWL6拟南芥Serine/threonine-protein kinase STY1740.502%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
F4JTP5拟南芥Serine/threonine-protein kinase STY4640.502%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
O22558拟南芥Serine/threonine-protein kinase STY837.615%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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