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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_028213
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 34799447-34802074 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2559 bp · LXL04_028213|LXL04_028213|OH1004|cDNA

ATGGGGTTTGCTCTCTTGGGTTCAATTGTGGTTCTAACTCTGTTCTTTTGGTCAAACCTTGGTCAACAACAAGAACAGCACACACCCATTCCCAATACAGATGAGTtcttcatctttgatttctttCAAAAAATGGGTGCAATGAATTCGTCTTCTTTTTCTCATGTTTACAATTTTTCATCCCCCTTTTGTTCATCGCAAATTGTTTTCTGTGATGCCAATCAAGAACATGTCGTAGGTCTAAATGCTCGTAATTTGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

2559 bp · LXL04_028213|LXL04_028213|OH1004|CDS

ATGGGGTTTGCTCTCTTGGGTTCAATTGTGGTTCTAACTCTGTTCTTTTGGTCAAACCTTGGTCAACAACAAGAACAGCACACACCCATTCCCAATACAGATGAGTTCTTCATCTTTGATTTCTTTCAAAAAATGGGTGCAATGAATTCGTCTTCTTTTTCTCATGTTTACAATTTTTCATCCCCCTTTTGTTCATCGCAAATTGTTTTCTGTGATGCCAATCAAGAACATGTCGTAGGTCTAAATGCTCGTAATTTGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

852 aa · LXL04_028213|LXL04_028213|OH1004|PROTEIN

MGFALLGSIVVLTLFFWSNLGQQQEQHTPIPNTDEFFIFDFFQKMGAMNSSSFSHVYNFSSPFCSSQIVFCDANQEHVVGLNARNLGLSGSIPDNTIGKLTKLQSLDLSNNQIVNLPDDFWSLGSLKTLNLSNNKISMNLPSNIGNFGSLEILDLSVNNFFGCFPESISSLISLQVLNLNRNGFESTVPLGIVSCKSLISLDLSSNGFNGSLPDGFGSSFPKLKSLNLAGNAMRGSVVEIFRESLEVVDLSSNHIEGHIS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_028213
TK1151 IDTkA07G131120
OH-1004 IDLXL04_028213
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_028213
位置Chr06:34799447-34802074 (-)
描述Similar to At2g24230: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g24230
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g24230 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g24230。 暂无已核实直接文献
At5g58150 可能是非活性富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g58150。 暂无已核实直接文献
At5g07280 具有丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶活性的受体，决定雄性孢原细胞起始细胞的正确数量，并进一步决定绒毡层和中间层细胞的特性。 暂无已核实直接文献
At4g39400 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
Brassinosteroid-insensitive dwarf mutants of Arabidopsis accumulate brassinosteroids.1999 · DOI: 10.1104/pp.121.3.743
Brassinosteroid-insensitive-1 is a ubiquitously expressed leucine-rich repeat receptor serine/threonine kinase.2000 · DOI: 10.1104/pp.123.4.1247
The Arabidopsis transthyretin-like protein is a potential substrate of BRASSINOSTEROID-INSENSITIVE 1.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.023903
The Arabidopsis thaliana brassinosteroid receptor (AtBRI1) contains a domain that functions as a guanylyl cyclase in vitro.2007 · DOI: 10.1371/journal.pone.0000449
BSKs mediate signal transduction from the receptor kinase BRI1 in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1156973
Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106
BSKs are partially redundant positive regulators of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12175

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0342300 可能参与根部的油菜素类固醇 感知。
The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028213 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0010234 anther wall tapetum cell fate specification 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0019199 transmembrane receptor protein kinase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G24230
ath:AT5G07280
ath:AT5G58150
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.852
排名 1 · LXL04_028213 · OH-1004
内质网0.089
排名 2 · LXL04_028213 · OH-1004
细胞质0.074
排名 3 · LXL04_028213 · OH-1004
细胞核0.061
排名 4 · LXL04_028213 · OH-1004
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · LXL04_028213 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23211.1LRR_LRWD188-163 aa
PF13855.13LRR_891-136 aa
PF23598.2LRR_1495-155 aa
PF12799.14LRR_4125-163 aa
PF13855.13LRR_8149-207 aa
PF13855.13LRR_8221-277 aa
PF23598.2LRR_14282-355 aa
PF12799.14LRR_4290-329 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_028213PF23211.1LRR_LRWD1881637.1e-0626.6
LXL04_028213PF13855.13LRR_8911361.3e-2899.2
LXL04_028213PF23598.2LRR_14951557.1e-1865.2
LXL04_028213PF12799.14LRR_41251638.2e-31106.1
LXL04_028213PF13855.13LRR_81492071.3e-2899.2
LXL04_028213PF13855.13LRR_82212771.3e-2899.2
LXL04_028213PF23598.2LRR_142823557.1e-1865.2
LXL04_028213PF12799.14LRR_42903298.2e-31106.1
LXL04_028213PF12799.14LRR_43383718.2e-31106.1
LXL04_028213PF00069.32Pkinase5326151.2e-31110.8
LXL04_028213PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr5337734.4e-32112.1
LXL04_028213PF00069.32Pkinase6668391.2e-31110.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGK9拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g2423062.002%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LVN2拟南芥Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g5815047.619%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LYN8拟南芥Leucine-rich repeat receptor protein kinase EMS132.062%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O22476拟南芥Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 132.059%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q6ZCZ2水稻Brassinosteroid LRR receptor kinase BRL332.907%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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