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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_027647
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 21002522-21003661 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

897 bp · LXL04_027647|LXL04_027647|OH1004|cDNA

ATGAGAAAATCATTGAAGCGGCCAGGGTTCCGTTTTAAACCTACTGATGTTGAATTGGCTATGTATTACCTCAAGAAAAAGTTACTAAACATAAAGCTTGACCCCGAAGTTATTGCAGAAATTAATATAAACGATTTCAGCCCATGGGATCTTCCAGCCAAATCCATCTTAAGTGGTGATCTAGAATGGTACTTTTTTTCCCCAAAACCTAAAAAGTACTTAAGTGGGCCCAGAATGAACCGGGCAACTAAAACCGGTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

897 bp · LXL04_027647|LXL04_027647|OH1004|CDS

ATGAGAAAATCATTGAAGCGGCCAGGGTTCCGTTTTAAACCTACTGATGTTGAATTGGCTATGTATTACCTCAAGAAAAAGTTACTAAACATAAAGCTTGACCCCGAAGTTATTGCAGAAATTAATATAAACGATTTCAGCCCATGGGATCTTCCAGCCAAATCCATCTTAAGTGGTGATCTAGAATGGTACTTTTTTTCCCCAAAACCTAAAAAGTACTTAAGTGGGCCCAGAATGAACCGGGCAACTAAAACCGGTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

298 aa · LXL04_027647|LXL04_027647|OH1004|PROTEIN

MRKSLKRPGFRFKPTDVELAMYYLKKKLLNIKLDPEVIAEININDFSPWDLPAKSILSGDLEWYFFSPKPKKYLSGPRMNRATKTGHWKGTGKDKEVKHKGKTVAMRKTLIFYMGHPPKWTRTNWVMHEYRMKDEDLANQGVCQDAYMVCRVFEKSDVGPKNGAQYGGQFEEDDDDDEGSSVTSVMMVGVLVNPNNASTSGAGPSTITSLENEKPTDVLVNDDVMLTRGDLSSIRNKDTQKAYKEVEDGKGKKVMSDDGI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_027647
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_027647
位置Chr06:21002522-21003661 (+)
描述Similar to NAC078: NAC domain-containing protein 78
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g04410 通过受调控的膜内蛋白水解（RIP）活化的转录激活因子（根据相似性）。 暂无已核实直接文献
At5g09330 转录调控因子，可结合目标基因启动子区域的特定 DNA 序列。 暂无已核实直接文献
At3g10500 通过受调控的膜内蛋白水解（RIP）活化的转录激活因子。
A NAC transcription factor NTL4 promotes reactive oxygen species production during drought-induced leaf senescence in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2012.04932.x
The Arabidopsis NAC transcription factor NTL4 participates in a positive feedback loop that induces programmed cell death under heat stress conditions.2014 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2014.07.003
At3g10490 结合靶基因启动子中5′-(C/T)A(C/A)G-3′基序的转录抑制因子。
Two novel NAC transcription factors regulate gene expression and flowering time by associating with the histone demethylase JMJ14.2015 · DOI: 10.1093/nar/gku1382
C-terminal domains of a histone demethylase interact with a pair of transcription factors and mediate specific chromatin association.2015 · DOI: 10.1038/celldisc.2015.3

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0119966 转录因子，作为茉莉酸（JA）信号通路的调控因子。
Disruption of a novel gene for a NAC-domain protein in rice confers resistance to Rice dwarf virus.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03712.x
The NAC transcription factor RIM1 of rice is a new regulator of jasmonate signaling.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.04107.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027647 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009644 response to high light intensity 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009819 drought recovery 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009962 regulation of flavonoid biosynthetic process 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G10490
ath:AT3G10500
ath:AT5G04410
ath:AT5G09330
dosa:Os03g0119966
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.961
排名 1 · LXL04_027647 · OH-1004
细胞质0.096
排名 2 · LXL04_027647 · OH-1004
细胞膜0.037
排名 3 · LXL04_027647 · OH-1004
内质网0.029
排名 4 · LXL04_027647 · OH-1004
质体0.012
排名 5 · LXL04_027647 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02365.21NAM8-132 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_027647PF02365.21NAM81325.3e-40137.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84K00拟南芥NAC domain-containing protein 7853.179%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FY82拟南芥NAC domain-containing protein 8249.010%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q949N0拟南芥NAC domain-containing protein 5354.878%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SQY0拟南芥NAC domain containing protein 5248.333%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8H045水稻NAC domain-containing protein 5452.174%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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