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基因概览

LXL04_026777

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 2773272-2775700 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1068 bp · LXL04_026777|LXL04_026777|OH1004|cDNA

ATGGCGGATATGCCGGAAGGAACGATGCGAAATGTACTGGAACAGAAAACTCTCAAGTGGGTATTCGTTGGTGGAAAGGGCGGTGTTGGAAAAACTACGTGTAGCTCTATTCTTTCAATTCTTTTGGCATCTGCGAGATCCTCTGTTCTTATAATTTCAACTGACCCAGCTCATAATCTCAGCGATGCGTTTCAACAGAGGTTCACGAAAGCTCCTACTTTGGTTAATGGGTTCACCAATTTGTATGCTATGGAGGTGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1068 bp · LXL04_026777|LXL04_026777|OH1004|CDS

ATGGCGGATATGCCGGAAGGAACGATGCGAAATGTACTGGAACAGAAAACTCTCAAGTGGGTATTCGTTGGTGGAAAGGGCGGTGTTGGAAAAACTACGTGTAGCTCTATTCTTTCAATTCTTTTGGCATCTGCGAGATCCTCTGTTCTTATAATTTCAACTGACCCAGCTCATAATCTCAGCGATGCGTTTCAACAGAGGTTCACGAAAGCTCCTACTTTGGTTAATGGGTTCACCAATTTGTATGCTATGGAGGTGGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

355 aa · LXL04_026777|LXL04_026777|OH1004|PROTEIN

MADMPEGTMRNVLEQKTLKWVFVGGKGGVGKTTCSSILSILLASARSSVLIISTDPAHNLSDAFQQRFTKAPTLVNGFTNLYAMEVDPNVENEEEGSDGMDGFLSDLANSIPGIDEAMSFAEMLKLVQTMDYSVIVFDTAPTGHTLRLLQFPSTLEKGLSKMMSLKSKFGGLLGQMSRLFGVGDEVGEDAILGRLEGMKDVIEKVNRQFKDPDLTTFVCVCIPEFLSLYETERLVQELTKFEIDTHNIIINQVLFDEEGV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_026777`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_026777

位置 Chr06:2773272-2775700 (+)

描述 Similar to GET3A: ATPase GET3A

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g01910`	ATP酶，参与尾锚定（TA）蛋白向内质网的翻译后输送。	Loss of GET pathway orthologs in Arabidopsis thaliana causes root hair growth defects and affects SNARE abundance.2017 · DOI: 10.1073/pnas.1619525114

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026777 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0048767 root hair elongation 生物过程

GO:0071816 tail-anchored membrane protein insertion into ER membrane 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0043529 GET complex 细胞组分

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

aag:5574421

ath:AT1G01910

cnb:CNBK0900

cne:CNK02640

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.593

排名 1 · LXL04_026777 · OH-1004

细胞核0.309

排名 2 · LXL04_026777 · OH-1004

高尔基体0.190

排名 3 · LXL04_026777 · OH-1004

内质网0.131

排名 4 · LXL04_026777 · OH-1004

溶酶体／液泡0.073

排名 5 · LXL04_026777 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02374.22ArsA_ATPase19-310 aa

PF01656.30CbiA21-210 aa

PF13614.13AAA_3125-143 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_026777	`PF02374.22`	ArsA_ATPase	19	310	1.5e-103	347.0
LXL04_026777	`PF01656.30`	CbiA	21	210	5.4e-10	40.0
LXL04_026777	`PF13614.13`	AAA_31	25	143	2.6e-09	37.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q949M9`	拟南芥	ATPase GET3A	78.063%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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