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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_026521
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 127728811-127730262 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1452 bp · LXL04_026521|LXL04_026521|OH1004|cDNA

ATGGAAGAAGAAATCTCCCACCGCCCACCGGAGAAACTTCTCAGAGCGGCGGTATCGGAGCTAAAAATACAGCAAGCGATTGCATGTCCATTGATGGCGATGAACTTGACATGGTTTGCCAAGATAGCCATCACCACAGCGTTTCTCGGTCGGCTGGGTGAGCTTGAGTTAGCCAGTGGTGCTCTCGGGTTCATGTTTGCAAACGTCACTGGTTTCTCGGTCTTAAACGGTCTATGTGGTGCCATGGAGCCTATCTGCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1452 bp · LXL04_026521|LXL04_026521|OH1004|CDS

ATGGAAGAAGAAATCTCCCACCGCCCACCGGAGAAACTTCTCAGAGCGGCGGTATCGGAGCTAAAAATACAGCAAGCGATTGCATGTCCATTGATGGCGATGAACTTGACATGGTTTGCCAAGATAGCCATCACCACAGCGTTTCTCGGTCGGCTGGGTGAGCTTGAGTTAGCCAGTGGTGCTCTCGGGTTCATGTTTGCAAACGTCACTGGTTTCTCGGTCTTAAACGGTCTATGTGGTGCCATGGAGCCTATCTGCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

483 aa · LXL04_026521|LXL04_026521|OH1004|PROTEIN

MEEEISHRPPEKLLRAAVSELKIQQAIACPLMAMNLTWFAKIAITTAFLGRLGELELASGALGFMFANVTGFSVLNGLCGAMEPICGQAYGAKNFKLLHKTLVMMVTLLLLTSLPVCFLWLNVDKILIGFGQQEDISTEAKRYLICLLPDLIITSFLCPLKSYMSSQSITIPIMFTSALAVVLHVPVNIFLVKTRGFEGVSMAIWVTDLMVVVMLAVYLAVTEIKKGGTWKEGGWSDQTLLDWVRLLKLSGPCCLTTCLE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_026521
TK1151 IDTkA06G006980
OH-1004 IDLXL04_026521
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)85.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_026521
位置Chr05:127728811-127730262 (+)
描述Similar to DTX56: Protein DETOXIFICATION 56
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g22790 可能作为保卫细胞 CO₂ 信号通路中的 HCO₃⁻ 感知组分。
A molecular pathway for CO₂ response in Arabidopsis guard cells.2015 · DOI: 10.1038/ncomms7057
At4g29140 作为多药和毒素挤压转运蛋白发挥作用，负向调节植物抗病性。
ADP1 affects plant architecture by regulating local auxin biosynthesis.2014 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003954
A subgroup of MATE transporter genes regulates hypocotyl cell elongation in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1093/jxb/erv344
At1g71870 可能作为多药物和毒素外排转运蛋白，将IAA结合物从细胞质转运到过氧化物酶体中。 暂无已核实直接文献
At5g19700 可能作为下胚轴细胞在光照下伸长的负调节剂。
A subgroup of MATE transporter genes regulates hypocotyl cell elongation in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1093/jxb/erv344
At5g52050 在气孔细胞中作为一种多药物和毒素外排转运蛋白，在脱落酸 (ABA) 的外排中发挥作用。
A DTX/MATE-type transporter facilitates abscisic acid efflux and modulates ABA sensitivity and drought tolerance in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1093/mp/ssu063
A subgroup of MATE transporter genes regulates hypocotyl cell elongation in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1093/jxb/erv344

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026521 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010015 root morphogenesis 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0010600 regulation of auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0031348 negative regulation of defense response 生物过程
GO:0046620 regulation of organ growth 生物过程
GO:0060586 multicellular organismal-level iron ion homeostasis 生物过程
GO:0071244 cellular response to carbon dioxide 生物过程
GO:0080168 abscisic acid transport 生物过程
GO:1902456 regulation of stomatal opening 生物过程
GO:1990961 xenobiotic detoxification by transmembrane export across the plasma membrane 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G71870
ath:AT4G22790
ath:AT4G29140
ath:AT5G19700
ath:AT5G52050
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.631
排名 1 · LXL04_026521 · OH-1004
溶酶体／液泡0.145
排名 2 · LXL04_026521 · OH-1004
内质网0.104
排名 3 · LXL04_026521 · OH-1004
细胞质0.082
排名 4 · LXL04_026521 · OH-1004
高尔基体0.050
排名 5 · LXL04_026521 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01554.24MatE30-189 aa
PF01554.24MatE252-414 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_026521PF01554.24MatE301891.3e-59201.2
LXL04_026521PF01554.24MatE2524141.3e-59201.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O49660拟南芥Protein DETOXIFICATION 5659.874%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SZE2拟南芥Protein DETOXIFICATION 5137.083%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LE20拟南芥Protein DETOXIFICATION 5437.243%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q4PSF4拟南芥Protein DETOXIFICATION 5237.581%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FJ87拟南芥Protein DETOXIFICATION 5034.812%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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