基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_026060
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 120297011-120300624
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2178 bp · LXL04_026060|LXL04_026060|OH1004|cDNA
ATGTCCATGTCCCCCACCCCTGTCGTTCCAACTCCTAAACTTACcactactactactactactactactactaccACCACTCTTCCAAATCCCATGGAAATGGTGAAACCTCATGAAAACCCTCCTTATGTTGCTTACCCGGTTGACCTTCAACTCGCCTTATACCCCATAACTTTGAAGTTTGAAGATGTTGTTTATAAAGTTAAAATGGAGCAAAAAGGTACATGGTGTGGAGGAACAGGAAGGACGAAAGAGAAGAC...
CDS
下载 CDS FASTA2178 bp · LXL04_026060|LXL04_026060|OH1004|CDS
ATGTCCATGTCCCCCACCCCTGTCGTTCCAACTCCTAAACTTACCACTACTACTACTACTACTACTACTACTACCACCACTCTTCCAAATCCCATGGAAATGGTGAAACCTCATGAAAACCCTCCTTATGTTGCTTACCCGGTTGACCTTCAACTCGCCTTATACCCCATAACTTTGAAGTTTGAAGATGTTGTTTATAAAGTTAAAATGGAGCAAAAAGGTACATGGTGTGGAGGAACAGGAAGGACGAAAGAGAAGAC...
725 aa · LXL04_026060|LXL04_026060|OH1004|PROTEIN
MSMSPTPVVPTPKLTTTTTTTTTTTTTLPNPMEMVKPHENPPYVAYPVDLQLALYPITLKFEDVVYKVKMEQKGTWCGGTGRTKEKTILNGVTGKVYPGEILAMLGPSGSGKTTLLTALGGRLPGNLSGKITYNTRPFSGSMKRRTGFVTQEDVLYPHLTVTETLFFTAMLRLPKTLTQDEKVQHVERVVSELGLTRCQNSMIGGPLFRGISGGEKKRVSIGQEMLINPSLLLLDEPTSGLDSTTAQRIITTIKRLASGG...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_026060 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_026060 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:120297011-120300624 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ABCG14: ABC transporter G family member 14 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程 GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程 GO:0010148 transpiration 生物过程 GO:0010184 cytokinin transport 生物过程 GO:0010208 pollen wall assembly 生物过程 GO:0010222 stem vascular tissue pattern formation 生物过程 GO:0010588 cotyledon vascular tissue pattern formation 生物过程 GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0055085 transmembrane transport 生物过程 GO:0140115 export across plasma membrane 生物过程 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G31770 ath:AT3G25620 ath:AT4G27420 ath:AT5G06530 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.662
细胞质0.153
内质网0.117
溶酶体／液泡0.102
高尔基体0.074
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00005.34ABC_tran89-239 aaPF19055.7ABC2_membrane_7268-401 aaPF01061.30ABC2_membrane397-603 aaPF12698.14ABC2_membrane_3448-651 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_026060 | PF00005.34 | ABC_tran | 89 | 239 | 1.2e-27 | 97.9 |
| LXL04_026060 | PF19055.7 | ABC2_membrane_7 | 268 | 401 | 4e-16 | 59.6 |
| LXL04_026060 | PF01061.30 | ABC2_membrane | 397 | 603 | 2.1e-43 | 149.0 |
| LXL04_026060 | PF12698.14 | ABC2_membrane_3 | 448 | 651 | 4.5e-07 | 30.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9C6W5 | 拟南芥 | ABC transporter G family member 14 | 76.052% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q7XA72 | 拟南芥 | ABC transporter G family member 21 | 58.889% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9SZR9 | 拟南芥 | ABC transporter G family member 9 | 54.262% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q93YS4 | 拟南芥 | ABC transporter G family member 22 | 48.995% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9FT51 | 拟南芥 | ABC transporter G family member 27 | 50.080% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |