基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_025846
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 117592034-117593947
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1170 bp · LXL04_025846|LXL04_025846|OH1004|cDNA
ATGGTGGCATTAGAGTGGCTAAGACCTGTTGTAGATACAATGGGATGGGACTACTGCATTGTTTGGCTATTTGGTGATGATCCTTCAAGGTACATTGAGTGGAGTTGGTGTTGTTGCAATGGTAGTCGAGGTGTTTGTAGAAATGTCAAAGAGGAAATCGATGCAACGAAACAACATTTTCCTCAATTATGCAGAGATACTTATGTTAATCACTCTTTGAGGACAAAAGCTTGCGAGAAACTAGCTACGATTCCTTTTCA...
CDS
下载 CDS FASTA1170 bp · LXL04_025846|LXL04_025846|OH1004|CDS
ATGGTGGCATTAGAGTGGCTAAGACCTGTTGTAGATACAATGGGATGGGACTACTGCATTGTTTGGCTATTTGGTGATGATCCTTCAAGGTACATTGAGTGGAGTTGGTGTTGTTGCAATGGTAGTCGAGGTGTTTGTAGAAATGTCAAAGAGGAAATCGATGCAACGAAACAACATTTTCCTCAATTATGCAGAGATACTTATGTTAATCACTCTTTGAGGACAAAAGCTTGCGAGAAACTAGCTACGATTCCTTTTCA...
389 aa · LXL04_025846|LXL04_025846|OH1004|PROTEIN
MVALEWLRPVVDTMGWDYCIVWLFGDDPSRYIEWSWCCCNGSRGVCRNVKEEIDATKQHFPQLCRDTYVNHSLRTKACEKLATIPFHLPLYSGIHGEVAMSSQPAWIHDTIGTQVLMPVNGGLIELYRSKLVQRDPDMIETLTTQFNIFSAKYIMSPKTEASPNGSNSSFISVDSTQFSPINFLGHDVSSKKKQYMKIKQKNGKELYQSKNLVTERNRRNRIKDGLFALRALVPKISKMDRASIVGDAVEYIKELQLNVQ...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_025846 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_025846 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:117592034-117593947 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to BHLH90: Transcription factor bHLH90 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0009555 pollen development 生物过程 GO:0010444 guard mother cell differentiation 生物过程 GO:0048653 anther development 生物过程 GO:0048654 anther morphogenesis 生物过程 GO:0048657 anther wall tapetum cell differentiation 生物过程 GO:0048658 anther wall tapetum development 生物过程 GO:0050826 response to freezing 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G10610 ath:AT1G12860 ath:AT2G16910 dosa:Os02g0120500 osa:4328113 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.883
细胞质0.174
细胞膜0.049
内质网0.030
质体0.014
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF14215.13bHLH-MYC_N7-146 aaPF00010.32HLH213-256 aaPF23177.2bHLH_IRO3213-275 aaPF22754.5bHLH-TF_ACT-like_plant312-381 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_025846 | PF14215.13 | bHLH-MYC_N | 7 | 146 | 1.6e-14 | 55.3 |
| LXL04_025846 | PF00010.32 | HLH | 213 | 256 | 3.8e-11 | 43.3 |
| LXL04_025846 | PF23177.2 | bHLH_IRO3 | 213 | 275 | 7.8e-06 | 26.9 |
| LXL04_025846 | PF22754.5 | bHLH-TF_ACT-like_plant | 312 | 381 | 1.3e-08 | 35.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q0WNR2 | 拟南芥 | Transcription factor bHLH90 | 33.641% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9ZVX2 | 拟南芥 | Transcription factor ABORTED MICROSPORES | 40.884% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9LPW3 | 拟南芥 | Transcription factor SCREAM2 | 37.423% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9LSE2 | 拟南芥 | Transcription factor ICE1 | 36.316% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q6YUS3 | 水稻 | Transcription factor TDR | 32.243% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |