LXL04_025573 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_025573

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 113714756-113716658 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1356 bp · LXL04_025573|LXL04_025573|OH1004|cDNA

ATGATGAAACCTACGGTCATCATGGTGCCCTACCCAGCACAAGGCCACGTAACACCCATGCTCAACCTCGCCTCCGCCGTGAGCCGCCTTGGCCTTTCTCCGGTGGTTGTTACACCGGAATTCATCCACAAAACCATCGCTCACAAAAACACCAACATCACCTGCATGTCTATTCCGGACGGTTTGGAGGATGAGACCCCACGTGATTTCTTCTCGATTGAGTTTGCGATGGAGAACAACATGTCGGTGCATTTGGAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1356 bp · LXL04_025573|LXL04_025573|OH1004|CDS

ATGATGAAACCTACGGTCATCATGGTGCCCTACCCAGCACAAGGCCACGTAACACCCATGCTCAACCTCGCCTCCGCCGTGAGCCGCCTTGGCCTTTCTCCGGTGGTTGTTACACCGGAATTCATCCACAAAACCATCGCTCACAAAAACACCAACATCACCTGCATGTCTATTCCGGACGGTTTGGAGGATGAGACCCCACGTGATTTCTTCTCGATTGAGTTTGCGATGGAGAACAACATGTCGGTGCATTTGGAAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

451 aa · LXL04_025573|LXL04_025573|OH1004|PROTEIN

MMKPTVIMVPYPAQGHVTPMLNLASAVSRLGLSPVVVTPEFIHKTIAHKNTNITCMSIPDGLEDETPRDFFSIEFAMENNMSVHLENLVREINGGDSGGVAFMIVDLLASWALKVGGDCGVPVVGYWPVMFAAYQLIAAIPEMLSLGIISETGIPQNEGPIYLGYDQPPLGTQDLPWLIGNLVSRKSRFKFWTRTLSRTRTLSQILVNTFPEEHHIDTNLQDQSIKYPNITPIGPLTQHTRYRNPRFLEKDTSCLEWLDQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_025573`
TK1151 ID	TkA06G050940
OH-1004 ID	LXL04_025573
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	96.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 54.989 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_025573

位置 Chr05:113714756-113716658 (-)

描述 Similar to UGT82A1: UDP-glycosyltransferase 82A1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g22250`	UDP-糖基转移酶 82A1。	暂无已核实直接文献
`At3g02100`	UDP-糖基转移酶 83A1。	暂无已核实直接文献
`At5g59590`	在体外具有低水平槲皮素 3-O-葡萄糖基转移酶和 7-O-葡萄糖基转移酶活性。	暂无已核实直接文献
`At3g46660`	在体外具有槲皮素 3-O-葡萄糖基转移酶和 7-O-葡萄糖基转移酶活性。	暂无已核实直接文献
`At3g46670`	在体外具有低水平槲皮素 3-O-葡萄糖基转移酶和 7-O-葡萄糖基转移酶活性。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025573 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0033836 flavonol 7-O-beta-glucosyltransferase activity 分子功能

GO:0035251 UDP-glucosyltransferase activity 分子功能

GO:0047893 flavonol 3-O-glucosyltransferase activity 分子功能

GO:0080043 quercetin 3-O-glucosyltransferase activity 分子功能

GO:0080044 quercetin 7-O-glucosyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G02100

ath:AT3G22250

ath:AT3G46660

ath:AT3G46670

ath:AT5G59590

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.482

排名 1 · LXL04_025573 · OH-1004

质体0.179

排名 2 · LXL04_025573 · OH-1004

过氧化物酶体0.171

排名 3 · LXL04_025573 · OH-1004

细胞核0.146

排名 4 · LXL04_025573 · OH-1004

线粒体0.084

排名 5 · LXL04_025573 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00201.25UDPGT250-409 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_025573	`PF00201.25`	UDPGT	250	409	2.9e-23	83.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LHJ2`	拟南芥	UDP-glycosyltransferase 82A1	49.781%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9SGA8`	拟南芥	UDP-glycosyltransferase 83A1	29.424%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9LTH2`	拟南芥	UDP-glycosyltransferase 76E2	30.137%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q94AB5`	拟南芥	Flavonol 3-O-glucosyltransferase UGT76E12	29.062%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9SNB1`	拟南芥	UDP-glycosyltransferase 76E11	28.571%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情