LXL04_025493 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_025493

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 112508508-112510022 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

768 bp · LXL04_025493|LXL04_025493|OH1004|cDNA

atggcGGAAGTTGTGGGAGCGAAAGAGAGCGCGGTGGTGGATGGTGGTTCGACGATGTTTAGCGAGGTGGAGGTGAGAGAGATGTCGGGGTTCAAGCGTGGTGGCGATGATCACGTGGAAGTCACGTGTGGGTGCACTAGCTTCTGCTACGGTGACGCCGTCGGCACGCTTAGGGTGTTCGCTAGTGGTGATCTCGAAATCCGATGCGATTGTACCCCTGGCTGTCAAGAAGGTCTCGCTTTTATCGTTCTTTCTTTACA...

CDS

下载 CDS FASTA

768 bp · LXL04_025493|LXL04_025493|OH1004|CDS

ATGGCGGAAGTTGTGGGAGCGAAAGAGAGCGCGGTGGTGGATGGTGGTTCGACGATGTTTAGCGAGGTGGAGGTGAGAGAGATGTCGGGGTTCAAGCGTGGTGGCGATGATCACGTGGAAGTCACGTGTGGGTGCACTAGCTTCTGCTACGGTGACGCCGTCGGCACGCTTAGGGTGTTCGCTAGTGGTGATCTCGAAATCCGATGCGATTGTACCCCTGGCTGTCAAGAAGGTCTCGCTTTTATCGTTCTTTCTTTACA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

255 aa · LXL04_025493|LXL04_025493|OH1004|PROTEIN

MAEVVGAKESAVVDGGSTMFSEVEVREMSGFKRGGDDHVEVTCGCTSFCYGDAVGTLRVFASGDLEIRCDCTPGCQEGLAFIVLSLHPFAYKLTPAAFEKHSGRETARKWKNNIWVIVDGEKVPLSKTALLKYYNKALSKTSSQTTSQRVCHRDEFLKCTQCSKLRRFHLRTKEECRAYHDAFININNWNCSDMPFHKITCDDEEERASRRVYRGCLTSSTCRGCTSCVCFGCGTCRFSDCGCQSCIDFTRNVKA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_025493`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_025493

位置 Chr05:112508508-112510022 (+)

描述 Similar to ULT1: Protein ULTRAPETALA 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g28190`	假定的转录因子，作为芽和花分生组织中细胞积累的关键负调节因子。	The ULTRAPETALA1 gene functions early in Arabidopsis development to restrict shoot apical meristem activity and acts through WUSCHEL to regulate floral meristem determinacy.2004 · DOI: 10.1534/genetics.104.028787 ULTRAPETALA1 encodes a SAND domain putative transcriptional regulator that controls shoot and floral meristem activity in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1242/dev.01642 REBELOTE, SQUINT, and ULTRAPETALA1 function redundantly in the temporal regulation of floral meristem termination in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1105/tpc.107.053306 EMBRYONIC FLOWER1 and ULTRAPETALA1 Act Antagonistically on Arabidopsis Development and Stress Response.2013 · DOI: 10.1104/pp.112.213223
`At2g20825`	假定的转录因子，作为芽和花分生组织中细胞积累的关键负调节因子。	ULTRAPETALA1 encodes a SAND domain putative transcriptional regulator that controls shoot and floral meristem activity in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1242/dev.01642

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025493 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0009909 regulation of flower development 生物过程

GO:0009910 negative regulation of flower development 生物过程

GO:0010022 meristem determinacy 生物过程

GO:0010080 regulation of floral meristem growth 生物过程

GO:0010081 regulation of inflorescence meristem growth 生物过程

GO:0010582 floral meristem determinacy 生物过程

GO:0040029 epigenetic regulation of gene expression 生物过程

GO:1901000 regulation of response to salt stress 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0003677 DNA binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G20825

ath:AT4G28190

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.887

排名 1 · LXL04_025493 · OH-1004

细胞质0.203

排名 2 · LXL04_025493 · OH-1004

细胞膜0.035

排名 3 · LXL04_025493 · OH-1004

内质网0.023

排名 4 · LXL04_025493 · OH-1004

线粒体0.020

排名 5 · LXL04_025493 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23292.2SAND_ULT128-134 aa

PF23293.2zf_ULT1152-250 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_025493	`PF23292.2`	SAND_ULT1	28	134	1.5e-38	131.9
LXL04_025493	`PF23293.2`	zf_ULT1	152	250	6.2e-42	143.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8GZA8`	拟南芥	Protein ULTRAPETALA 1	62.810%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q8S8I2`	拟南芥	Protein ULTRAPETALA 2	56.432%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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