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基因概览

LXL04_024958

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 102766619-102768004 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

543 bp · LXL04_024958|LXL04_024958|OH1004|cDNA

ATGTATTACTATGAAGTTATTGGATTatatgaaaaatatgaaacaaCGACTACTTCCCTTGATATTCCACATGAGGTGTGCAAATACTCTGTTCTCATAGAGGCATTAGTTGCTAAAGTTACCAAGGGGTTTAGCCATCGATTAGCCCCATTGAACATGTTTGTGAAAGAACTTAGTGACAGCATGCAACTTTCCAAAATTGAACATGAAGAAACTCAGGGATATGGTGGtaagaagagaaagaaaaacaACGATGGTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

543 bp · LXL04_024958|LXL04_024958|OH1004|CDS

ATGTATTACTATGAAGTTATTGGATTATATGAAAAATATGAAACAACGACTACTTCCCTTGATATTCCACATGAGGTGTGCAAATACTCTGTTCTCATAGAGGCATTAGTTGCTAAAGTTACCAAGGGGTTTAGCCATCGATTAGCCCCATTGAACATGTTTGTGAAAGAACTTAGTGACAGCATGCAACTTTCCAAAATTGAACATGAAGAAACTCAGGGATATGGTGGTAAGAAGAGAAAGAAAAACAACGATGGTGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

180 aa · LXL04_024958|LXL04_024958|OH1004|PROTEIN

MYYYEVIGLYEKYETTTTSLDIPHEVCKYSVLIEALVAKVTKGFSHRLAPLNMFVKELSDSMQLSKIEHEETQGYGGKKRKKNNDGGENSKPRDVVHVRAKRGEATYSHSLAERMRREKINEKLRRLQDRSDDGNVSDVGGNNQLRAIIAESDRCLIGKYPFKRSTQSSSHEVIAPAGVK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_024958`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_024958

位置 Chr05:102766619-102768004 (+)

描述 Similar to BHLH75: Transcription factor bHLH75

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g25330`	转录因子 bHLH75。	暂无已核实直接文献
`At5g50915`	转录因子bHLH137。	暂无已核实直接文献
`At3g07340`	转录因子 bHLH62。	暂无已核实直接文献
`At5g48560`	结合 DNA 的转录因子，结合 G box 5'-CACGTG-3' 和 E-box 5'-CANNTG-3'（通过相似性）。	Multiple bHLH proteins form heterodimers to mediate CRY2-dependent regulation of flowering-time in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003861

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os09g0510500`	转录激活因子，与 LO9-177 和 ILI5/BUL1 一起，通过调节细胞伸长促进叶片倾斜和谷粒大小。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024958 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0009637 response to blue light 生物过程

GO:0009739 response to gibberellin 生物过程

GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程

GO:0042127 regulation of cell population proliferation 生物过程

GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0051511 negative regulation of unidimensional cell growth 生物过程

GO:0071368 cellular response to cytokinin stimulus 生物过程

GO:2000024 regulation of leaf development 生物过程

GO:2000488 positive regulation of brassinosteroid biosynthetic process 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G25330

ath:AT3G07340

ath:AT5G48560

ath:AT5G50915

dosa:Os09g0510500

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.902

排名 1 · LXL04_024958 · OH-1004

细胞质0.155

排名 2 · LXL04_024958 · OH-1004

细胞膜0.041

排名 3 · LXL04_024958 · OH-1004

内质网0.024

排名 4 · LXL04_024958 · OH-1004

线粒体0.015

排名 5 · LXL04_024958 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`A4D998`	拟南芥	Transcription factor bHLH75	75.556%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q93W88`	拟南芥	Transcription factor bHLH137	56.140%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9SRT2`	拟南芥	Transcription factor bHLH62	47.436%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9FJL4`	拟南芥	Transcription factor bHLH78	58.333%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q0J0G7`	水稻	Transcription factor BC1	56.604%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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