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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_024731
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 97632143-97634028 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1797 bp · LXL04_024731|LXL04_024731|OH1004|cDNA

ATGGATTCATCTGCGAAATCAGTAGACGACGTGGTGGAAGAGATAATGAGAATTCATAGATCTCTTCCTCCAAGACCTGGAATCGATGATGTTGAAGCTGCATTGATACTAATCCGGAACGCAGACAATGAAGAACAATCAAGGATCGAAAGCATTTCCAGGCAAAAGAAGCGAAAATACATCCCTGAAGAACTCTTCAACGTCCTGTTAGAGATGCAGAAACAATCAGTCCAATTCCAAAGTAAAGAACAGAAGAGAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1797 bp · LXL04_024731|LXL04_024731|OH1004|CDS

ATGGATTCATCTGCGAAATCAGTAGACGACGTGGTGGAAGAGATAATGAGAATTCATAGATCTCTTCCTCCAAGACCTGGAATCGATGATGTTGAAGCTGCATTGATACTAATCCGGAACGCAGACAATGAAGAACAATCAAGGATCGAAAGCATTTCCAGGCAAAAGAAGCGAAAATACATCCCTGAAGAACTCTTCAACGTCCTGTTAGAGATGCAGAAACAATCAGTCCAATTCCAAAGTAAAGAACAGAAGAGAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

598 aa · LXL04_024731|LXL04_024731|OH1004|PROTEIN

MDSSAKSVDDVVEEIMRIHRSLPPRPGIDDVEAALILIRNADNEEQSRIESISRQKKRKYIPEELFNVLLEMQKQSVQFQSKEQKREAVKLLDLENIHQLFDEMIQRASKCCSPSGNTQSGASTSSSSSPSTNTTSYSGTSFDLSTPTTASLTTSSTSSLSFDKDHVKSSHLFIKDDSYVNKSKFYSDSVGGGIGSSKFSRPQIVDSTLKPSITSGEFKSSHIYIILELDYLKILVSIALICHFVGQGGDKLSLIKLASL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_024731
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_024731
位置Chr05:97632143-97634028 (-)
描述Similar to PIRL4: Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g35470 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献
At2g17440 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献
At3g26500 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0511700 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献
Os10g0572300 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024731 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0055046 microgametogenesis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G17440
ath:AT3G26500
ath:AT4G35470
dosa:Os08g0511700
dosa:Os10g0572300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.304
排名 1 · LXL04_024731 · OH-1004
细胞质0.286
排名 2 · LXL04_024731 · OH-1004
细胞核0.267
排名 3 · LXL04_024731 · OH-1004
内质网0.111
排名 4 · LXL04_024731 · OH-1004
溶酶体／液泡0.088
排名 5 · LXL04_024731 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598.2LRR_14281-347 aa
PF13855.13LRR_8286-328 aa
PF13855.13LRR_8294-351 aa
PF12799.14LRR_4294-332 aa
PF12799.14LRR_4317-355 aa
PF13855.13LRR_8340-397 aa
PF12799.14LRR_4340-378 aa
PF23598.2LRR_14359-473 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_024731PF23598.2LRR_142813472.9e-35122.4
LXL04_024731PF13855.13LRR_82863286.5e-35119.4
LXL04_024731PF13855.13LRR_82943516.5e-35119.4
LXL04_024731PF12799.14LRR_42943321.6e-2589.2
LXL04_024731PF12799.14LRR_43173551.6e-2589.2
LXL04_024731PF13855.13LRR_83403976.5e-35119.4
LXL04_024731PF12799.14LRR_43403781.6e-2589.2
LXL04_024731PF23598.2LRR_143594732.9e-35122.4
LXL04_024731PF13855.13LRR_83634206.5e-35119.4
LXL04_024731PF12799.14LRR_43634021.6e-2589.2
LXL04_024731PF13855.13LRR_84094666.5e-35119.4
LXL04_024731PF13855.13LRR_84324876.5e-35119.4
LXL04_024731PF12799.14LRR_44324691.6e-2589.2
LXL04_024731PF13855.13LRR_84785376.5e-35119.4
LXL04_024731PF23598.2LRR_144915342.9e-35122.4
LXL04_024731PF12799.14LRR_45035391.6e-2589.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SVW8拟南芥Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 455.667%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q5G5E0拟南芥Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 553.993%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LRV8拟南芥Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 237.544%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q6Z8P4水稻Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 449.172%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8S7M7水稻Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 555.523%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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