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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_024660
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 96199394-96203570 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1653 bp · LXL04_024660|LXL04_024660|OH1004|cDNA

ATGGGTATCTGTTTTTCGACAACCAAGATCAGCGGCTCCGACAGCATCGCTCCCTCCCTTAACGACGGCGCCTCCACCACCGCCGGCGAAAACCAACAAAAGCATCTCGTCTTGAAACAGGATGGACGTGGGTATAATGGTAAATTACCCAAAACGAGAGATTCCAATAGGAGTGCATATCAAAAGCAGGGTTTCAACAATAGTAAAACTAAACCGAAAGGTAAGTCGACGCCAAAGCGTCAAAAAGGGTTGATTCCTTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1653 bp · LXL04_024660|LXL04_024660|OH1004|CDS

ATGGGTATCTGTTTTTCGACAACCAAGATCAGCGGCTCCGACAGCATCGCTCCCTCCCTTAACGACGGCGCCTCCACCACCGCCGGCGAAAACCAACAAAAGCATCTCGTCTTGAAACAGGATGGACGTGGGTATAATGGTAAATTACCCAAAACGAGAGATTCCAATAGGAGTGCATATCAAAAGCAGGGTTTCAACAATAGTAAAACTAAACCGAAAGGTAAGTCGACGCCAAAGCGTCAAAAAGGGTTGATTCCTTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

550 aa · LXL04_024660|LXL04_024660|OH1004|PROTEIN

MGICFSTTKISGSDSIAPSLNDGASTTAGENQQKHLVLKQDGRGYNGKLPKTRDSNRSAYQKQGFNNSKTKPKGKSTPKRQKGLIPCGKRTDFGYLKDFDRRYSTGKLLGHGQFGYTYVAVDKANGDRVAVKKIDKAKMVLPIAVEDVKREVKILRALSGHENVVQFHNAFEDDSFVYIVMELCKGGELLDRILSKKEGRYTEKDAAIVVRQMLKVAAECHLHGLVHRDMKPENFLFKSPNEDSHLKATDFGLSDFIRPG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_024660
TK1151 IDTkA06G119610
OH-1004 IDLXL04_024660
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_024660
位置Chr05:96199394-96203570 (+)
描述Similar to CPK28: Calcium-dependent protein kinase 28
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g66210 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用（可能）。
Function of calcium-dependent protein kinase CPK28 of Arabidopsis thaliana in plant stem elongation and vascular development.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12090
The calcium-dependent protein kinase CPK28 buffers plant immunity and regulates BIK1 turnover.2014 · DOI: 10.1016/j.chom.2014.10.007
Catalytically inactive subgroup VIII receptor-like cytoplasmic kinases regulate the immune-triggered oxidative burst in Arabidopsis thaliana.2025 · DOI: 10.1093/jxb/erae486
At2g17890 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At4g36070 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0409900 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用（通过相似性）。
A rice calcium-dependent protein kinase is expressed in cortical root cells during the presymbiotic phase of the arbuscular mycorrhizal symbiosis.2011 · DOI: 10.1186/1471-2229-11-90
Rice small C2-domain proteins are phosphorylated by calcium-dependent protein kinase.2013 · DOI: 10.1007/s10059-013-2185-0
Direct phosphorylation and activation of a mitogen-activated protein kinase by a calcium-dependent protein kinase in rice.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.126441
Os02g0126400 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024660 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0051592 response to calcium ion 生物过程
GO:1900425 negative regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:2000032 regulation of secondary shoot formation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G17890
ath:AT4G36070
ath:AT5G66210
dosa:Os02g0126400
dosa:Os07g0409900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.514
排名 1 · LXL04_024660 · OH-1004
细胞质0.288
排名 2 · LXL04_024660 · OH-1004
细胞核0.209
排名 3 · LXL04_024660 · OH-1004
内质网0.063
排名 4 · LXL04_024660 · OH-1004
高尔基体0.061
排名 5 · LXL04_024660 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase103-363 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr106-353 aa
PF14531.13Kinase-like187-313 aa
PF13202.13EF-hand_5411-433 aa
PF00036.39EF-hand_1411-437 aa
PF13499.13EF-hand_7411-471 aa
PF13405.13EF-hand_6411-436 aa
PF13833.13EF-hand_8423-471 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_024660PF00069.32Pkinase1033631.3e-69235.2
LXL04_024660PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr1063531.9e-2796.9
LXL04_024660PF14531.13Kinase-like1873134.9e-0626.7
LXL04_024660PF13202.13EF-hand_54114336.2e-2792.5
LXL04_024660PF00036.39EF-hand_14114374.3e-2689.2
LXL04_024660PF13499.13EF-hand_74114713e-2485.9
LXL04_024660PF13405.13EF-hand_64114366.5e-2275.8
LXL04_024660PF13833.13EF-hand_84234718.3e-1451.8
LXL04_024660PF13202.13EF-hand_54915126.2e-2792.5
LXL04_024660PF00036.39EF-hand_14915124.3e-2689.2
LXL04_024660PF13499.13EF-hand_74915443e-2485.9
LXL04_024660PF13405.13EF-hand_64925116.5e-2275.8
LXL04_024660PF13202.13EF-hand_55235446.2e-2792.5
LXL04_024660PF00036.39EF-hand_15245464.3e-2689.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FKW4拟南芥Calcium-dependent protein kinase 2881.874%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7XJR9拟南芥Calcium-dependent protein kinase 1671.864%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q1PE17拟南芥Calcium-dependent protein kinase 1878.085%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q0D715水稻Calcium-dependent protein kinase 1880.426%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q6Z2M9水稻Calcium-dependent protein kinase 478.186%Swiss-Prot强数据库同源证据

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