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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_024573
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 94004143-94007391 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3160 bp · LXL04_024573|LXL04_024573|OH1004|cDNA

TGGGAGCTTTGTGAAGCTCTGCTCTTGCATATCATAAACGCAAAGAATCAATCCTTTACCAATGGAGAAGGCCAATTTCATCCGAATATCTATTCTCATGCTTGCTACAATTTTCCTTTCCCCGATTGTCGCTTATGGTTCTTCTGTTGAAGCCATTGCTCTTTTAAAATGGAAAGGTAGCCTCCAAAGCGATAGAAAGAGTTCTGCGTTATCTTCATGGATATATCCTGTTCCGAGCAGTCGAAACACGTCTTTGGCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

3099 bp · LXL04_024573|LXL04_024573|OH1004|CDS

ATGGAGAAGGCCAATTTCATCCGAATATCTATTCTCATGCTTGCTACAATTTTCCTTTCCCCGATTGTCGCTTATGGTTCTTCTGTTGAAGCCATTGCTCTTTTAAAATGGAAAGGTAGCCTCCAAAGCGATAGAAAGAGTTCTGCGTTATCTTCATGGATATATCCTGTTCCGAGCAGTCGAAACACGTCTTTGGCTCCAAAAAAACCAACTATGTATTGGTGCACTTGGTATGGAGTTTTTTGTAATTCTGATGGGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1032 aa · LXL04_024573|LXL04_024573|OH1004|PROTEIN

MEKANFIRISILMLATIFLSPIVAYGSSVEAIALLKWKGSLQSDRKSSALSSWIYPVPSSRNTSLAPKKPTMYWCTWYGVFCNSDGSVVKLNLAFSSLTGTLNSFTFSSFPNLTHIELSVNNLFGIIPAEIGNLTKLVYLNLVSNHFSSIIPPEIRLLADLEGLHLFENQLSGSIPQGICQMKFLSVLSLYNNTLSGSLPSCVGNLTNLSYIYLYHNKLSGSIPYELGNLSNLNVLQLQKNFLTGTIPNSLGSLTNLLRL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_024573
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_024573
位置Chr05:94004143-94007391 (-)
描述Similar to MIK2: MDIS1-interacting receptor like kinase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g08850 作为十字花科植物SCOOP肽的受体，调节包括植物生长、发育和应激反应在内的多种过程。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
Perception of a divergent family of phytocytokines by the Arabidopsis receptor kinase MIK2.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-20932-y
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w
The MIK2/SCOOP Signaling System Contributes to Arabidopsis Resistance Against Herbivory by Modulating Jasmonate and Indole Glucosinolate Biosynthesis.2022 · DOI: 10.3389/fpls.2022.852808
At1g35710 可能的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At1g35710。 暂无已核实直接文献
At1g17230 富含亮氨酸重复序列的受体样丝/苏氨酸蛋白激酶 At1g17230。 暂无已核实直接文献
At5g44700 与 GSO1 一起，是在胚胎和子叶表皮表面发育过程中所需的受体样丝氨酸/苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057
At4g20140 与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸／苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024573 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002213 defense response to insect 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0009695 jasmonic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009759 indole glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0031349 positive regulation of defense response 生物过程
GO:0080027 response to herbivore 生物过程
GO:1901653 cellular response to peptide 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17230
ath:AT1G35710
ath:AT4G08850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.872
排名 1 · LXL04_024573 · OH-1004
内质网0.079
排名 2 · LXL04_024573 · OH-1004
细胞质0.057
排名 3 · LXL04_024573 · OH-1004
细胞核0.034
排名 4 · LXL04_024573 · OH-1004
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · LXL04_024573 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13855.13LRR_889-147 aa
PF23598.2LRR_14106-263 aa
PF23598.2LRR_14235-335 aa
PF13855.13LRR_8265-315 aa
PF23598.2LRR_14339-430 aa
PF13855.13LRR_8447-507 aa
PF13855.13LRR_8496-555 aa
PF12799.14LRR_4520-559 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_024573PF13855.13LRR_8891478e-46154.4
LXL04_024573PF23598.2LRR_141062631.3e-41143.3
LXL04_024573PF23598.2LRR_142353351.3e-41143.3
LXL04_024573PF13855.13LRR_82653158e-46154.4
LXL04_024573PF23598.2LRR_143394301.3e-41143.3
LXL04_024573PF13855.13LRR_84475078e-46154.4
LXL04_024573PF13855.13LRR_84965558e-46154.4
LXL04_024573PF12799.14LRR_45205592.8e-32110.7
LXL04_024573PF23598.2LRR_145596451.3e-41143.3
LXL04_024573PF13855.13LRR_85686278e-46154.4
LXL04_024573PF13855.13LRR_85926518e-46154.4
LXL04_024573PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr77110255.7e-48164.2
LXL04_024573PF00069.32Pkinase77110222.9e-47162.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZG8拟南芥MDIS1-interacting receptor like kinase 246.473%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LP24拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g3571045.216%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SHI2拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1723038.576%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FIZ3拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO237.603%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGQ5拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO137.224%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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