基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_024237
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 85504657-85508683
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1326 bp · LXL04_024237|LXL04_024237|OH1004|cDNA
ATGGTGAGTTCAGCATCGCCGATTGGCTTCTTTCCGGTTGAACGAAAAACATCTACTCAAGATATGAAGAGCACGGACACCGTCGATTCCCTACGTTCTAGGACCACCAATTCCACAAATCCTGCCACTGCCGCGAGGCGGAGAACCGCCGGTAACGCAACGCCGGCGAAAACCTCCCCTAATTTATGTCGGTCACAATCGTTCAGTCGCGAGATCGGACATGCTGCTAGTGAAACGTATTTGATTTCTCGCCTTGCGTT...
CDS
下载 CDS FASTA1326 bp · LXL04_024237|LXL04_024237|OH1004|CDS
ATGGTGAGTTCAGCATCGCCGATTGGCTTCTTTCCGGTTGAACGAAAAACATCTACTCAAGATATGAAGAGCACGGACACCGTCGATTCCCTACGTTCTAGGACCACCAATTCCACAAATCCTGCCACTGCCGCGAGGCGGAGAACCGCCGGTAACGCAACGCCGGCGAAAACCTCCCCTAATTTATGTCGGTCACAATCGTTCAGTCGCGAGATCGGACATGCTGCTAGTGAAACGTATTTGATTTCTCGCCTTGCGTT...
441 aa · LXL04_024237|LXL04_024237|OH1004|PROTEIN
MVSSASPIGFFPVERKTSTQDMKSTDTVDSLRSRTTNSTNPATAARRRTAGNATPAKTSPNLCRSQSFSREIGHAASETYLISRLAFTLLRYLGVGRRWISRLLALGLYAMLLMPGFLQVLHQYFFSTQIRRSIVYGDQPRNRLDLYLPKNIDSPKPVIVFVTGGAWIIGYKGWGSLLGFQLAERDIIVTCLDYRNFPQGTISDMVDDVSRGISFICNNIANYGGDPNRIYLMGQSAGAHISSCVLLKQAIMESKGDPTS...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_024237 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_024237 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:85504657-85508683 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ICMEL2: Probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICMEL2 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0010296 prenylcysteine methylesterase activity 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G26120 ath:AT3G02410 ath:AT5G15860 dosa:Os05g0577200 dosa:Os06g0708100 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
内质网0.320
高尔基体0.218
细胞质0.163
溶酶体／液泡0.160
细胞膜0.152
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF20434.6BD-FAE144-351 aaPF00135.35COesterase144-248 aaPF07859.20Abhydrolase_3159-368 aaPF00326.28Peptidase_S9324-369 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_024237 | PF20434.6 | BD-FAE | 144 | 351 | 2.6e-25 | 89.9 |
| LXL04_024237 | PF00135.35 | COesterase | 144 | 248 | 6.9e-13 | 49.1 |
| LXL04_024237 | PF07859.20 | Abhydrolase_3 | 159 | 368 | 1.1e-13 | 52.1 |
| LXL04_024237 | PF00326.28 | Peptidase_S9 | 324 | 369 | 1.4e-07 | 32.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q1PET6 | 拟南芥 | Probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICMEL2 | 69.588% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q94AS5 | 拟南芥 | Isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICME | 70.557% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q8VYP9 | 拟南芥 | Probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICMEL1 | 63.265% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q6L5F5 | 水稻 | Probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICME | 60.363% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q5Z9I2 | 水稻 | Probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICMEL1 | 63.712% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |