基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_022845
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 10718997-10721839
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1256 bp · LXL04_022845|LXL04_022845|OH1004|cDNA
ATGTTTCGATATGCATGTGTAATCTCACACACACACGAAACGTTTCATACTTGATCTCTTTCTTCCACTTTGCGCGCGaacagaagaagatgaagaacaCGCGATTCACTGGACGCAAAGTGTCACCCAAATGGATACTCATTTTCAGCATCTTCAGCTTCGCCTTTGGCATGTTCTTCACCAACAGGGTGCTTGCTCCGCTTGATTCCGATGGAAGGGTTATGCGGCGGCGAGAACAAGAAATCAAAATTGTTTCCGAT...
CDS
下载 CDS FASTA1242 bp · LXL04_022845|LXL04_022845|OH1004|CDS
ATGTGTAATCTCACACACACACGAAACGTTTCATACTTGATCTCTTTCTTCCACTTTGCGCGCGAACAGAAGAAGATGAAGAACACGCGATTCACTGGACGCAAAGTGTCACCCAAATGGATACTCATTTTCAGCATCTTCAGCTTCGCCTTTGGCATGTTCTTCACCAACAGGGTGCTTGCTCCGCTTGATTCCGATGGAAGGGTTATGCGGCGGCGAGAACAAGAAATCAAAATTGTTTCCGATGATTGCATAACAAA...
413 aa · LXL04_022845|LXL04_022845|OH1004|PROTEIN
MCNLTHTRNVSYLISFFHFAREQKKMKNTRFTGRKVSPKWILIFSIFSFAFGMFFTNRVLAPLDSDGRVMRRREQEIKIVSDDCITNKDTDLLGAIHKSDEAIRSLGNSLSKLRMELPIAERSPEKVNHESLQANNTVSEKDSRRKKAFVVIGINTAFSSRRRRDSVRETWMPRGEKLIQLEKENGIVVRFMIGHSATSKSILDRAIDSEESQHKDFLRLKHVEGYHELTAKTRTFFATAFAKWDAKFYVKVDDDVHVNL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_022845 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_022845 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:10718997-10721839 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to B3GALT7: Beta-1,3-galactosyltransferase 7 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009101 glycoprotein biosynthetic process 生物过程 GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程 GO:0010208 pollen wall assembly 生物过程 GO:0010407 non-classical arabinogalactan protein metabolic process 生物过程 GO:0010584 pollen exine formation 生物过程 GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程 GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0008378 galactosyltransferase activity 分子功能 GO:0048531 beta-1,3-galactosyltransferase activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G05170 ath:AT1G22015 ath:AT1G32930 ath:AT1G33430 ath:AT1G77810 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
高尔基体0.811
内质网0.083
细胞膜0.072
细胞质0.059
细胞外0.055
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF13334.12DUF409437-120 aaPF01762.28Galactosyl_T162-359 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_022845 | PF13334.12 | DUF4094 | 37 | 120 | 2.4e-17 | 63.9 |
| LXL04_022845 | PF01762.28 | Galactosyl_T | 162 | 359 | 8.8e-49 | 166.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q6NQB7 | 拟南芥 | Beta-1,3-galactosyltransferase 7 | 64.051% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
A8MRC7 | 拟南芥 | Probable beta-1,3-galactosyltransferase 2 | 57.552% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9C809 | 拟南芥 | Probable beta-1,3-galactosyltransferase 8 | 59.536% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9MAP8 | 拟南芥 | Beta-1,6-galactosyltransferase GALT31A | 58.355% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9LM60 | 拟南芥 | Probable beta-1,3-galactosyltransferase 5 | 58.869% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |