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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_022619
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 2590232-2592494 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1137 bp · LXL04_022619|LXL04_022619|OH1004|cDNA

ATGTCGGTGGTGGAATCAAGTTCCGCTACTACAGCGGATCAGAGTAATATCAAAGGGGTTCTTACACATGGCGGTCGTTATGTTCAGTATAATGTGTACGGCAATCTTTTTGAAGTATCCCGGAAGTATATTCCTCCGATTCGACCTGTCGGTAGAGGCGCCTACGGTATCGTTTGTGCTGCAACAAATGCAGAGACACGTGAAGAAGTTGCCATAAAGAAAATCGGGAATGCTTTTGACAACAGAATAGACGCCAAAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1137 bp · LXL04_022619|LXL04_022619|OH1004|CDS

ATGTCGGTGGTGGAATCAAGTTCCGCTACTACAGCGGATCAGAGTAATATCAAAGGGGTTCTTACACATGGCGGTCGTTATGTTCAGTATAATGTGTACGGCAATCTTTTTGAAGTATCCCGGAAGTATATTCCTCCGATTCGACCTGTCGGTAGAGGCGCCTACGGTATCGTTTGTGCTGCAACAAATGCAGAGACACGTGAAGAAGTTGCCATAAAGAAAATCGGGAATGCTTTTGACAACAGAATAGACGCCAAAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

378 aa · LXL04_022619|LXL04_022619|OH1004|PROTEIN

MSVVESSSATTADQSNIKGVLTHGGRYVQYNVYGNLFEVSRKYIPPIRPVGRGAYGIVCAATNAETREEVAIKKIGNAFDNRIDAKRTLREIKLLRHMDHENVIAIKDIIRPPLKENFNDVYIVYELMDTDLHQIIRSNQPLADDHCRYFLYQILRGLKYVHSAHVLHRDLKPSNLLLNANCDLKIGDFGLARTTSETDFMTEYVVTRWYRAPELLLNCSEYTAAIDIWSVGCILGEILTRQPLFPGKDYVHQLRLITEL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_022619
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_022619
位置Chr05:2590232-2592494 (-)
描述Similar to MPK4: Mitogen-activated protein kinase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g01370 ANPs-MKK6-MPK4 模块参与减数分裂和有丝分裂过程中植物胞质分裂的调节。
Arabidopsis map kinase 4 negatively regulates systemic acquired resistance.2000 · DOI: 10.1016/s0092-8674(00)00213-0
The MKK2 pathway mediates cold and salt stress signaling in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1016/j.molcel.2004.06.023
Involvement of MPK4 in osmotic stress response pathways in cell suspensions and plantlets of Arabidopsis thaliana: activation by hypoosmolarity and negative role in hyperosmolarity tolerance.2004 · DOI: 10.1016/j.febslet.2004.08.001
The MAP kinase substrate MKS1 is a regulator of plant defense responses.2005 · DOI: 10.1038/sj.emboj.7600737
Arabidopsis homologs of nucleus- and phragmoplast-localized kinase 2 and 3 and mitogen-activated protein kinase 4 are essential for microtubule organization.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071746
HINKEL kinesin, ANP MAPKKKs and MKK6/ANQ MAPKK, which phosphorylates and activates MPK4 MAPK, constitute a pathway that is required for cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1093/pcp/pcq135
The MAP kinase MPK4 is required for cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.077164
AtMPK4 is required for male-specific meiotic cytokinesis in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04642.x
The MEKK1-MKK1/MKK2-MPK4 kinase cascade negatively regulates immunity mediated by a mitogen-activated protein kinase kinase kinase in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.097253
Phosphorylation of trihelix transcriptional repressor ASR3 by MAP KINASE4 negatively regulates Arabidopsis immunity.2015 · DOI: 10.1105/tpc.114.134809
A Dominant Mutation in the HT1 Kinase Uncovers Roles of MAP Kinases and GHR1 in CO2-Induced Stomatal Closure.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00131
At1g01560 促分裂素活化蛋白激酶11。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0157000 丝裂原活化蛋白激酶 2。 暂无已核实直接文献
Os10g0533600 丝裂原活化蛋白激酶 6。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022619 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000911 cytokinesis by cell plate formation 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006972 hyperosmotic response 生物过程
GO:0007112 male meiosis cytokinesis 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009861 jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance 生物过程
GO:0009862 systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G01560
ath:AT4G01370
dosa:Os08g0157000
dosa:Os10g0533600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.611
排名 1 · LXL04_022619 · OH-1004
细胞核0.565
排名 2 · LXL04_022619 · OH-1004
细胞膜0.077
排名 3 · LXL04_022619 · OH-1004
线粒体0.044
排名 4 · LXL04_022619 · OH-1004
内质网0.026
排名 5 · LXL04_022619 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase48-330 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr48-241 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_022619PF00069.32Pkinase483304.8e-69233.4
LXL04_022619PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr482411.6e-32113.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39024拟南芥Mitogen-activated protein kinase 486.486%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LMM5拟南芥Mitogen-activated protein kinase 1185.359%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q5J4W4水稻Mitogen-activated protein kinase 285.596%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q336X9水稻Mitogen-activated protein kinase 685.278%Swiss-Prot强数据库同源证据

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