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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_022508
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 151783617-151785908 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1467 bp · LXL04_022508|LXL04_022508|OH1004|cDNA

ATGACGACGGCGAGCAGTTTCGGTTCCGGTTCCGGGTCCGGGTCGTTGAGTTCAAAACCTGCACCGGGTGTGCCAGATCAGTTCCCTGTGGGTTTGAGAGTTCTCGTTGTTGATGACGATGTAACTTGCTTGAAGATTTTGGAGCGCTTGCTTCGCAGATGCTCTTATCATGTTACAACTTGCTCACAGGCAACCACTGCCTTAAATATGCTAAGAGAAAGAAAAGACGGTTTTGATGTGGTATTAAGTGATGTACATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1467 bp · LXL04_022508|LXL04_022508|OH1004|CDS

ATGACGACGGCGAGCAGTTTCGGTTCCGGTTCCGGGTCCGGGTCGTTGAGTTCAAAACCTGCACCGGGTGTGCCAGATCAGTTCCCTGTGGGTTTGAGAGTTCTCGTTGTTGATGACGATGTAACTTGCTTGAAGATTTTGGAGCGCTTGCTTCGCAGATGCTCTTATCATGTTACAACTTGCTCACAGGCAACCACTGCCTTAAATATGCTAAGAGAAAGAAAAGACGGTTTTGATGTGGTATTAAGTGATGTACATAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

488 aa · LXL04_022508|LXL04_022508|OH1004|PROTEIN

MTTASSFGSGSGSGSLSSKPAPGVPDQFPVGLRVLVVDDDVTCLKILERLLRRCSYHVTTCSQATTALNMLRERKDGFDVVLSDVHMPDMDGFKLLELVGLEMDLPVIMMSADGRTNLVLRGIRHGACDYLIKPIREEQLKNIWQHVIRKKWNENKEHEHSGSVEHKRGGDDNNNNNHDNEYGTCSVNEGENGAVMTCHKKRRNVKEEDDCELESDDPSASKKPRVVWSVELHQQFVSAVNQLGIDKAVPKRILELMNVP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_022508
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_022508
位置Chr04:151783617-151785908 (+)
描述Similar to RR21: Two-component response regulator ORR21
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g16110 特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]GATT-3' 的转录激活剂。
The response regulator ARR2: a pollen-specific transcription factor involved in the expression of nuclear genes for components of mitochondrial complex I in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1007/s004380000400
Two-component circuitry in Arabidopsis cytokinin signal transduction.2001 · DOI: 10.1038/35096500
The response regulator 2 mediates ethylene signalling and hormone signal integration in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1038/sj.emboj.7600337
Cytokinin-mediated control of leaf longevity by AHK3 through phosphorylation of ARR2 in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0505150103
At3g16857 特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]GATT-3' 的转录激活剂。
Two-component circuitry in Arabidopsis cytokinin signal transduction.2001 · DOI: 10.1038/35096500
ARR1, a transcription factor for genes immediately responsive to cytokinins.2001 · DOI: 10.1126/science.1065201
A genetic framework for the control of cell division and differentiation in the root meristem.2008 · DOI: 10.1126/science.1164147
At2g01760 特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]GATT-3' 的转录激活剂。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XE31 可结合特定DNA序列的转录激活因子。 暂无已核实直接文献
Os03g0224200 可结合特定DNA序列的转录激活因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022508 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000160 phosphorelay signal transduction system 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010082 regulation of root meristem growth 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0010380 regulation of chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0010492 maintenance of shoot apical meristem identity 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G01760
ath:AT3G16857
ath:AT4G16110
dosa:Os03g0224200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.974
排名 1 · LXL04_022508 · OH-1004
细胞质0.077
排名 2 · LXL04_022508 · OH-1004
细胞膜0.025
排名 3 · LXL04_022508 · OH-1004
内质网0.016
排名 4 · LXL04_022508 · OH-1004
质体0.011
排名 5 · LXL04_022508 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00072.31Response_reg34-142 aa
PF00249.38Myb_DNA-binding225-274 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_022508PF00072.31Response_reg341422.7e-2486.2
LXL04_022508PF00249.38Myb_DNA-binding2252743.8e-0834.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZWJ9拟南芥Two-component response regulator ARR255.014%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q940D0拟南芥Two-component response regulator ARR157.751%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8L9Y3拟南芥Two-component response regulator ARR1459.006%Swiss-Prot中等数据库同源证据
A2XE31水稻Two-component response regulator ORR2155.530%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8H7S7水稻Two-component response regulator ORR2155.530%Swiss-Prot强数据库同源证据

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