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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_022421
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 150083260-150096970 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5766 bp · LXL04_022421|LXL04_022421|OH1004|cDNA

ATGCTTTTACAGATACTTGTAGCCATGGCAGCTTTGGGGGCAGCAAGTGCTCAACAGGAGCCAAAATGTAAAAAACCATGTGGCAATTTGACTATCGAGTACCCTTTTGGTTATGAGGGATGCAACTACAATTCTGCTTTCCTTGTCACCTGTAACGAAACATCCGGTGAGCCAATACCTATCCTTGGAGATGGCACAACCGACATTATTGTTAAAAATATGTCGATTGACAGAGGTGAGTTGGAGATTATGATGTTTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

5766 bp · LXL04_022421|LXL04_022421|OH1004|CDS

ATGCTTTTACAGATACTTGTAGCCATGGCAGCTTTGGGGGCAGCAAGTGCTCAACAGGAGCCAAAATGTAAAAAACCATGTGGCAATTTGACTATCGAGTACCCTTTTGGTTATGAGGGATGCAACTACAATTCTGCTTTCCTTGTCACCTGTAACGAAACATCCGGTGAGCCAATACCTATCCTTGGAGATGGCACAACCGACATTATTGTTAAAAATATGTCGATTGACAGAGGTGAGTTGGAGATTATGATGTTTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1921 aa · LXL04_022421|LXL04_022421|OH1004|PROTEIN

MLLQILVAMAALGAASAQQEPKCKKPCGNLTIEYPFGYEGCNYNSAFLVTCNETSGEPIPILGDGTTDIIVKNMSIDRGELEIMMFVGRSCYNSSGYTGGIDASLTLGSLEEIRVSAKNRFVAIGCDTLGAFRGTRGKMIDVTGCYSACSRNSLFINGSCSGVGCCEAAVPEGISSFNITLISINDHKNITDFNPCSYGFFLKDGGFNFSTNDLRDLQSSRMPMLLDWAIGNLTWETASGDANSFLCKGNSVYNQDYTGP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_022421
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_022421
位置Chr04:150083260-150096970 (-)
描述Similar to WAK2: Wall-associated receptor kinase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g21270 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At1g21240 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At1g21230 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At1g21250 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。
Oxygen-evolving enhancer protein 2 is phosphorylated by glycine-rich protein 3/wall-associated kinase 1 in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1016/s0006-291x(03)00851-9
Aluminum-induced gene expression and protein localization of a cell wall-associated receptor kinase in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1104/pp.103.022129
At1g21210 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。
Antisense expression of a cell wall-associated protein kinase, WAK4, inhibits cell elongation and alters morphology.2001 · DOI: 10.1105/tpc.13.6.1317

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022421 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0009311 oligosaccharide metabolic process 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0009992 intracellular water homeostasis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030247 polysaccharide binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G21240
ath:AT1G21270
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.747
排名 1 · LXL04_022421 · OH-1004
细胞质0.133
排名 2 · LXL04_022421 · OH-1004
内质网0.073
排名 3 · LXL04_022421 · OH-1004
细胞核0.060
排名 4 · LXL04_022421 · OH-1004
溶酶体／液泡0.048
排名 5 · LXL04_022421 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13947.12GUB_WAK_bind23-83 aa
PF07645.22EGF_CA296-329 aa
PF00069.32Pkinase419-687 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr423-691 aa
PF13947.12GUB_WAK_bind831-892 aa
PF00008.34EGF1099-1126 aa
PF00069.32Pkinase1216-1503 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr1220-1507 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_022421PF13947.12GUB_WAK_bind23832.6e-1557.3
LXL04_022421PF07645.22EGF_CA2963297.7e-0833.2
LXL04_022421PF00069.32Pkinase4196872.2e-126421.4
LXL04_022421PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr4236915e-121403.6
LXL04_022421PF13947.12GUB_WAK_bind8318922.6e-1557.3
LXL04_022421PF00008.34EGF109911263.7e-0937.4
LXL04_022421PF00069.32Pkinase121615032.2e-126421.4
LXL04_022421PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr122015075e-121403.6
LXL04_022421PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr163117545e-121403.6
LXL04_022421PF00069.32Pkinase163217542.2e-126421.4
LXL04_022421PF00069.32Pkinase175018402.2e-126421.4
LXL04_022421PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr175018445e-121403.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LMP1拟南芥Wall-associated receptor kinase 243.660%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LMN8拟南芥Wall-associated receptor kinase 343.324%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LMN7拟南芥Wall-associated receptor kinase 542.913%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q39191拟南芥Wall-associated receptor kinase 143.579%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LMN6拟南芥Wall-associated receptor kinase 441.260%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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