基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_022093
当前版本: OH-1004
染色体: Chr04
坐标: 144496906-144498754
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1392 bp · LXL04_022093|LXL04_022093|OH1004|cDNA
ATGGCATTATCGATTGATTCCACACCAGCAGCTTCGTCACTCGCTCCTGGGTTTAGGTTTCATCCAACAGATGAGGAACTCGTACGGTACTATCTCAGGCGCAAGGTTTGCGGTAAACCCTTCCGATTTGACGCGATTTCCGACGTTGATGTCTACAAAGTCGAGCCATGGGATCTTCCAGATTTGTCAAAACTGAAGAGCAGAGACTTAGAATGGTACTTTTTCAGTGCCCTCGACAAGAAATACGGGAACGGATCCAG...
CDS
下载 CDS FASTA1392 bp · LXL04_022093|LXL04_022093|OH1004|CDS
ATGGCATTATCGATTGATTCCACACCAGCAGCTTCGTCACTCGCTCCTGGGTTTAGGTTTCATCCAACAGATGAGGAACTCGTACGGTACTATCTCAGGCGCAAGGTTTGCGGTAAACCCTTCCGATTTGACGCGATTTCCGACGTTGATGTCTACAAAGTCGAGCCATGGGATCTTCCAGATTTGTCAAAACTGAAGAGCAGAGACTTAGAATGGTACTTTTTCAGTGCCCTCGACAAGAAATACGGGAACGGATCCAG...
463 aa · LXL04_022093|LXL04_022093|OH1004|PROTEIN
MALSIDSTPAASSLAPGFRFHPTDEELVRYYLRRKVCGKPFRFDAISDVDVYKVEPWDLPDLSKLKSRDLEWYFFSALDKKYGNGSRTNRATEKGYWKTTGKDRAVHHRSQPVGMKKTLVYHSGRAPKGERTNWVMHEYRLIDEELKKAGITQDAFVLCRIFRKSGSGPKNGEKYGAPFIEEEWEDEDESVVVFKQEDFTEELPVDEDSYLDANDIQQILNTDMPVEDIPAESNKSSDPEEPNNVMNFDFDFDYLLDQPY...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_022093 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_022093 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:144496906-144498754 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to NAC078: NAC domain-containing protein 78 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0009644 response to high light intensity 生物过程 GO:0009819 drought recovery 生物过程 GO:0009908 flower development 生物过程 GO:0009962 regulation of flavonoid biosynthetic process 生物过程 GO:0010150 leaf senescence 生物过程 GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程 GO:0045814 negative regulation of gene expression, epigenetic 生物过程 GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0048573 photoperiodism, flowering 生物过程 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G10480 ath:AT3G10500 ath:AT5G04410 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.837
细胞质0.175
内质网0.105
细胞膜0.102
质体0.022
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF02365.21NAM16-141 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_022093 | PF02365.21 | NAM | 16 | 141 | 1.1e-48 | 165.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q84K00 | 拟南芥 | NAC domain-containing protein 78 | 75.635% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q949N0 | 拟南芥 | NAC domain-containing protein 53 | 73.206% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9SQX9 | 拟南芥 | NAC domain containing protein 50 | 52.788% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9SQY0 | 拟南芥 | NAC domain containing protein 52 | 66.120% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FY82 | 拟南芥 | NAC domain-containing protein 82 | 61.017% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |