基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_021796
当前版本: OH-1004
染色体: Chr04
坐标: 137042643-137048785
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4740 bp · LXL04_021796|LXL04_021796|OH1004|cDNA
ATGGGGAATCTGAGGGGTTTTGGGATCCATCTGATATTTGTATTTGCTTTTCTGGTTGCAGCCACATGTACGAGGGTTTTGGGTGATCAAAATACCAGTGAGCAAGTGAAAGAGCGACTTGCTCTTCTCAAGTTCAAACACAGTGTCAAAGATTCTTATGACATGTTGTCATCATGGGTTGGCAATGACTGTTGTATGTGGGAAGGAATCCACTGTGATGCTATCACCCGAAATGTGGAAAGCCTCCATCTTAGAGGTAA...
CDS
下载 CDS FASTA4740 bp · LXL04_021796|LXL04_021796|OH1004|CDS
ATGGGGAATCTGAGGGGTTTTGGGATCCATCTGATATTTGTATTTGCTTTTCTGGTTGCAGCCACATGTACGAGGGTTTTGGGTGATCAAAATACCAGTGAGCAAGTGAAAGAGCGACTTGCTCTTCTCAAGTTCAAACACAGTGTCAAAGATTCTTATGACATGTTGTCATCATGGGTTGGCAATGACTGTTGTATGTGGGAAGGAATCCACTGTGATGCTATCACCCGAAATGTGGAAAGCCTCCATCTTAGAGGTAA...
1579 aa · LXL04_021796|LXL04_021796|OH1004|PROTEIN
MGNLRGFGIHLIFVFAFLVAATCTRVLGDQNTSEQVKERLALLKFKHSVKDSYDMLSSWVGNDCCMWEGIHCDAITRNVESLHLRGNFQIQDEFVERSFFLRGYEVSSSLAELKHLKHLDLSGNYFYGSHIPKFIGSFKQLTYLNLSYSYFQGNISHHLGNLTNLKVLDLSSSERGLMVDDMAWISGLSSLELLDLSYVDLSRARNRGMVFYMIPSLQVLGLSNCGLSNADLIPFRNSSRILPNIKHLDLGINSFQGPLP...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_021796 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_021796 |
|---|---|
| 位置 | Chr04:137042643-137048785 (-) |
| 描述 | Similar to EIX2: Receptor-like protein EIX2 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002220 innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | 暂无功能描述 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.848
内质网0.085
细胞质0.061
溶酶体／液泡0.039
细胞核0.031
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF08263.18LRRNT_238-73 aaPF23598.2LRR_14105-276 aaPF13855.13LRR_8293-357 aaPF13855.13LRR_8364-401 aaPF13855.13LRR_8421-477 aaPF23598.2LRR_14428-508 aaPF23598.2LRR_14503-590 aaPF13855.13LRR_8609-668 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_021796 | PF08263.18 | LRRNT_2 | 38 | 73 | 1.7e-09 | 38.5 |
| LXL04_021796 | PF23598.2 | LRR_14 | 105 | 276 | 8.8e-52 | 176.7 |
| LXL04_021796 | PF13855.13 | LRR_8 | 293 | 357 | 4.5e-84 | 276.9 |
| LXL04_021796 | PF13855.13 | LRR_8 | 364 | 401 | 4.5e-84 | 276.9 |
| LXL04_021796 | PF13855.13 | LRR_8 | 421 | 477 | 4.5e-84 | 276.9 |
| LXL04_021796 | PF23598.2 | LRR_14 | 428 | 508 | 8.8e-52 | 176.7 |
| LXL04_021796 | PF23598.2 | LRR_14 | 503 | 590 | 8.8e-52 | 176.7 |
| LXL04_021796 | PF13855.13 | LRR_8 | 609 | 668 | 4.5e-84 | 276.9 |
| LXL04_021796 | PF13855.13 | LRR_8 | 735 | 792 | 4.5e-84 | 276.9 |
| LXL04_021796 | PF23598.2 | LRR_14 | 753 | 839 | 8.8e-52 | 176.7 |
| LXL04_021796 | PF23598.2 | LRR_14 | 911 | 973 | 8.8e-52 | 176.7 |
| LXL04_021796 | PF12799.14 | LRR_4 | 916 | 950 | 1.6e-59 | 197.2 |
| LXL04_021796 | PF13855.13 | LRR_8 | 919 | 974 | 4.5e-84 | 276.9 |
| LXL04_021796 | PF13855.13 | LRR_8 | 1109 | 1166 | 4.5e-84 | 276.9 |
| LXL04_021796 | PF13855.13 | LRR_8 | 1156 | 1215 | 4.5e-84 | 276.9 |
| LXL04_021796 | PF23598.2 | LRR_14 | 1290 | 1360 | 8.8e-52 | 176.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。