基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_021545
当前版本: OH-1004
染色体: Chr04
坐标: 132203302-132210505
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3264 bp · LXL04_021545|LXL04_021545|OH1004|cDNA
ATGGCGGCGGAGAAGCTTAGGGATTTAAGTCAGCCGATTGATGTTGCTTTACTTGATGCTACTGTTGCTGCCTTCTATGGCACCGGATCTAAAGACGAGAGGACAGCTGCTGATCATATACTGCGTGACTTGCAAAACAATCCAGATATGTGGCTTCAAGTTGTTCACATTCTGTCCAATACACAGAGCTTGAACACCAAGTTCTTCTCTTTACAGGTTCTTGAGGGTGTCATCAAGTATAGATGGAATGTATTACCTGT...
CDS
下载 CDS FASTA3264 bp · LXL04_021545|LXL04_021545|OH1004|CDS
ATGGCGGCGGAGAAGCTTAGGGATTTAAGTCAGCCGATTGATGTTGCTTTACTTGATGCTACTGTTGCTGCCTTCTATGGCACCGGATCTAAAGACGAGAGGACAGCTGCTGATCATATACTGCGTGACTTGCAAAACAATCCAGATATGTGGCTTCAAGTTGTTCACATTCTGTCCAATACACAGAGCTTGAACACCAAGTTCTTCTCTTTACAGGTTCTTGAGGGTGTCATCAAGTATAGATGGAATGTATTACCTGT...
1087 aa · LXL04_021545|LXL04_021545|OH1004|PROTEIN
MAAEKLRDLSQPIDVALLDATVAAFYGTGSKDERTAADHILRDLQNNPDMWLQVVHILSNTQSLNTKFFSLQVLEGVIKYRWNVLPVEQRDGMKNYISDVIVKLSSNESSFRQERLYVNKLNIILVQILKHEWPARWRSFIPDLVAAAKTSETICENCMAILKLLSEEVFDFSRGEMTQQKIKELKQSLNSEFQLIHELCLYVLSASQRTELIRATLATLHAFLSWIPLGYIFESPLLETLLKFFPVPSYRNLTLQCLTE...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_021545 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_021545 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:132203302-132210505 (+) | |||||||||
| 描述 | Similar to XPO1: Protein EXPORTIN 1A | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000054 ribosomal subunit export from nucleus 生物过程 GO:0000055 ribosomal large subunit export from nucleus 生物过程 GO:0000056 ribosomal small subunit export from nucleus 生物过程 GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0006406 mRNA export from nucleus 生物过程 GO:0006611 protein export from nucleus 生物过程 GO:0006913 nucleocytoplasmic transport 生物过程 GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0009410 response to xenobiotic stimulus 生物过程 GO:0009553 embryo sac development 生物过程 GO:0009555 pollen development 生物过程 GO:0009846 pollen germination 生物过程 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G03110 ath:AT5G17020 hsa:7514 mmu:103573 rno:85252 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.590
细胞质0.557
高尔基体0.076
溶酶体／液泡0.068
细胞膜0.057
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF03810.26IBN_N38-102 aaPF08389.19Xpo1115-258 aaPF18777.8CRM1_repeat337-372 aaPF18784.7CRM1_repeat_2409-476 aaPF18787.8CRM1_repeat_3489-539 aaPF08767.18CRM1_C723-1044 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_021545 | PF03810.26 | IBN_N | 38 | 102 | 7.4e-15 | 55.4 |
| LXL04_021545 | PF08389.19 | Xpo1 | 115 | 258 | 3.6e-44 | 151.1 |
| LXL04_021545 | PF18777.8 | CRM1_repeat | 337 | 372 | 1.8e-17 | 63.4 |
| LXL04_021545 | PF18784.7 | CRM1_repeat_2 | 409 | 476 | 5.7e-31 | 106.7 |
| LXL04_021545 | PF18787.8 | CRM1_repeat_3 | 489 | 539 | 3.2e-27 | 95.0 |
| LXL04_021545 | PF08767.18 | CRM1_C | 723 | 1044 | 1.1e-131 | 439.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。