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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_021336
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 127518961-127524693 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2127 bp · LXL04_021336|LXL04_021336|OH1004|cDNA

AATCTCCATTATTGTTTTCAAGTCAAATTAAAACACACCACCACACCCTCTTTCTATCCTTTCCTTAATACCTTCCATGATCGTCATCCCCTTTATCTACATTCAGACAAACACATCTCTGCAAATCTCTTTAAAATTATGAAAAAACGCACAGTTATCTTCACCTTTTTCCTATTATTTAACCAATATTTCTGCATAGATCTTAGCTATGAATCTTGTGTTCCAAAAGACTGTGGAGATGGGCGTAACATTAGTTATCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1989 bp · LXL04_021336|LXL04_021336|OH1004|CDS

ATGAAAAAACGCACAGTTATCTTCACCTTTTTCCTATTATTTAACCAATATTTCTGCATAGATCTTAGCTATGAATCTTGTGTTCCAAAAGACTGTGGAGATGGGCGTAACATTAGTTATCCATTTTTCATCCAAGGTTTACAGGATTCCTCTTGTGGCTACCCTGGATTTCAACTCCACTGCAGCAATTCGTCCTCGATTATTCGGATCTCAGATAACGACTATGTTATTAAACATATTCAATATGAAAACCAATCCCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

662 aa · LXL04_021336|LXL04_021336|OH1004|PROTEIN

MKKRTVIFTFFLLFNQYFCIDLSYESCVPKDCGDGRNISYPFFIQGLQDSSCGYPGFQLHCSNSSSIIRISDNDYVIKHIQYENQSLRLQNAAIWPNVAKSCPSNIRNLTLDLNRFRLDSSSTRNLVIISNCSGDLADGLEKYSVRSCGTGNKDAVMLDYDPYFRNVTARCGDGSAIVQMPVDLSGDYGRSVVVDGVNYPEVVETGFVLHWLAADCGGCLSSGGRCGFNKTTFGFRCFCPDRPHMVSCKPDVTNGTQIIT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_021336
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_021336
位置Chr04:127518961-127524693 (-)
描述Similar to LRK10L-1.2: LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g18390 可能参与脱落酸 信号转导的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。
The AtLRK10L1.2, Arabidopsis ortholog of wheat LRK10, is involved in ABA-mediated signaling and drought resistance.2015 · DOI: 10.1007/s00299-014-1724-2
At1g25390 叶锈病 10 抗病位点受体样蛋白激酶样 1.1。 暂无已核实直接文献
At1g66880 叶锈病10抗病位点受体样蛋白激酶样 1.4。 暂无已核实直接文献
At5g38210 叶锈病 10 抗性位点受体样蛋白激酶类似物 1.3。 暂无已核实直接文献
At2g23450 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021336 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0010089 xylem development 生物过程
GO:0042631 cellular response to water deprivation 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048573 photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18390
ath:AT1G25390
ath:AT1G66880
ath:AT2G23450
ath:AT5G38210
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.856
排名 1 · LXL04_021336 · OH-1004
细胞质0.083
排名 2 · LXL04_021336 · OH-1004
内质网0.082
排名 3 · LXL04_021336 · OH-1004
细胞核0.053
排名 4 · LXL04_021336 · OH-1004
溶酶体／液泡0.031
排名 5 · LXL04_021336 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13947.12GUB_WAK_bind27-90 aa
PF14380.12WAK_assoc177-242 aa
PF00069.32Pkinase335-602 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr337-604 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_021336PF13947.12GUB_WAK_bind27908.2e-1658.9
LXL04_021336PF14380.12WAK_assoc1772426.7e-1246.7
LXL04_021336PF00069.32Pkinase3356021.7e-49169.3
LXL04_021336PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr3376041.1e-49169.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P0C5E2拟南芥LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.247.164%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9C6K9拟南芥LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.154.564%Swiss-Prot中等数据库同源证据
F4HQ17拟南芥LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.441.679%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8VYG0拟南芥LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.341.926%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8RY67拟南芥Wall-associated receptor kinase-like 1438.821%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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