基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_019375
当前版本: OH-1004
染色体: Chr04
坐标: 30083730-30085153
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1038 bp · LXL04_019375|LXL04_019375|OH1004|cDNA
ATGATGGAAAATGAAGATTCTAATGGTTCAAACATGAATCACTTCTCTTGCAGGAACATTAGTagtgatgatgatgaggaggtTGATGATGAAAGCAACACCAAATCAAGCCAAAGTTCAGGGAACAACAGCTTGGTGGATCAAGTGGAGGGtgagaagaaagatggatccaCTAGAGTAAGGCCATATGTAAGATCTAAGATGCCTAGGCTCAGATGGAGTCCTGATCTTCATCTCACTTTTGTTCAAGCTATAGAGCG...
CDS
下载 CDS FASTA1038 bp · LXL04_019375|LXL04_019375|OH1004|CDS
ATGATGGAAAATGAAGATTCTAATGGTTCAAACATGAATCACTTCTCTTGCAGGAACATTAGTAGTGATGATGATGAGGAGGTTGATGATGAAAGCAACACCAAATCAAGCCAAAGTTCAGGGAACAACAGCTTGGTGGATCAAGTGGAGGGTGAGAAGAAAGATGGATCCACTAGAGTAAGGCCATATGTAAGATCTAAGATGCCTAGGCTCAGATGGAGTCCTGATCTTCATCTCACTTTTGTTCAAGCTATAGAGCG...
345 aa · LXL04_019375|LXL04_019375|OH1004|PROTEIN
MMENEDSNGSNMNHFSCRNISSDDDEEVDDESNTKSSQSSGNNSLVDQVEGEKKDGSTRVRPYVRSKMPRLRWSPDLHLTFVQAIERLGGQERATPKLVLQLMNVQGLNIAHVKSHLQMYRSKKIDDQGQVISGGDSYAGSNNHLFHNLCQLPGIDGRLFRPIISENSWSNHGSRPWRNNKTARIEDHGLNHARYEEFNINTIMNYGEYYMREKLEDENCKITYQEFEKDEALTNTKSSLINPELTNREKQGREEEPNSF...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_019375 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_019375 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:30083730-30085153 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to At1g14600: Putative Myb family transcription factor At1g14600 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0009944 polarity specification of adaxial/abaxial axis 生物过程 GO:0010158 abaxial cell fate specification 生物过程 GO:0010582 floral meristem determinacy 生物过程 GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程 GO:0030154 cell differentiation 生物过程 GO:0048440 carpel development 生物过程 GO:0048481 plant ovule development 生物过程 GO:0080060 integument development 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G14600 ath:AT1G32240 ath:AT5G42630 dosa:Os04g0566600 dosa:Os06g0670300 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.981
细胞质0.073
细胞膜0.023
内质网0.013
质体0.011
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00249.38Myb_DNA-binding70-121 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_019375 | PF00249.38 | Myb_DNA-binding | 70 | 121 | 2.1e-07 | 31.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q700D9 | 拟南芥 | Putative Myb family transcription factor At1g14600 | 60.494% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9C616 | 拟南芥 | Probable transcription factor KAN2 | 54.545% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FJV5 | 拟南芥 | Probable transcription factor KAN4 | 50.000% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
A3AWH5 | 水稻 | Myb family transcription factor MOF1 | 67.143% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
A0A0P0X0C0 | 水稻 | Myb family transcription factor MPH1 | 61.905% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |