LXL04_018786 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_018786

当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 18232090-18233611 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

732 bp · LXL04_018786|LXL04_018786|OH1004|cDNA

ATGTTGAACCGAATGTTCGGGAAAACCGACCCGGAGTCGGGGTCGAGTGAACCGTTGTATCCGACGATGGTTGAATCACCGGATCTCCGGTGGTCTTTCATCCGCAAAATATACTCGATTGTCGCCATACAGTTACTCCTCACCGCCGTTGTCGGTGCTATTGTGGTCTCTTATCATCCAATCATCACTTTCCTCACGACAACGAGAGGCGGATTCGCCTGTTACATTCTCATCATAGTTACTCCTTTCATCATGCTTTG...

CDS

下载 CDS FASTA

732 bp · LXL04_018786|LXL04_018786|OH1004|CDS

ATGTTGAACCGAATGTTCGGGAAAACCGACCCGGAGTCGGGGTCGAGTGAACCGTTGTATCCGACGATGGTTGAATCACCGGATCTCCGGTGGTCTTTCATCCGCAAAATATACTCGATTGTCGCCATACAGTTACTCCTCACCGCCGTTGTCGGTGCTATTGTGGTCTCTTATCATCCAATCATCACTTTCCTCACGACAACGAGAGGCGGATTCGCCTGTTACATTCTCATCATAGTTACTCCTTTCATCATGCTTTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

243 aa · LXL04_018786|LXL04_018786|OH1004|PROTEIN

MLNRMFGKTDPESGSSEPLYPTMVESPDLRWSFIRKIYSIVAIQLLLTAVVGAIVVSYHPIITFLTTTRGGFACYILIIVTPFIMLCPLSCYYQRHPVNYILLGIFTIALAFGVGLSCAFTSGKVILEAVILTAVVVVSLTLFTFWAAKRGSDFNFLGPFLFGALMVLIVFSIIQIFFPMGKISVMIYAGLSAIIFCGYIIYDTDNLIKRYSYDEYIWAAIALYLDVINLFLSLLTILRGVDR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_018786`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_018786

位置 Chr04:18232090-18233611 (+)

描述 Similar to LFG2: Protein LIFEGUARD 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g63310`	调节油菜素甾醇信号通路，介导细胞伸长和器官形态发生。	LIFEGUARD proteins support plant colonization by biotrophic powdery mildew fungi.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert217
`At1g03070`	蛋白 LIFEGUARD 4。	暂无已核实直接文献
`At4g02690`	蛋白 LIFEGUARD 3。	暂无已核实直接文献
`At4g14730`	（微生物感染）促进白粉病真菌E.cruciferarum的发育。	LIFEGUARD proteins support plant colonization by biotrophic powdery mildew fungi.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert217
`At4g15470`	BI1样蛋白。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018786 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程

GO:0030968 endoplasmic reticulum unfolded protein response 生物过程

GO:0034620 cellular response to unfolded protein 生物过程

GO:1905421 regulation of plant organ morphogenesis 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0005262 calcium channel activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G03070

ath:AT3G63310

ath:AT4G02690

ath:AT4G14730

ath:AT4G15470

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.354

排名 1 · LXL04_018786 · OH-1004

细胞质0.270

排名 2 · LXL04_018786 · OH-1004

高尔基体0.238

排名 3 · LXL04_018786 · OH-1004

细胞膜0.179

排名 4 · LXL04_018786 · OH-1004

内质网0.170

排名 5 · LXL04_018786 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01027.27Bax1-I30-240 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_018786	`PF01027.27`	Bax1-I	30	240	1.3e-50	172.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M1V9`	拟南芥	Protein LIFEGUARD 2	74.894%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9SA63`	拟南芥	Protein LIFEGUARD 4	68.313%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9ZQX7`	拟南芥	Protein LIFEGUARD 3	67.623%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`F4JIE8`	拟南芥	Protein LIFEGUARD 1	54.741%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q94A20`	拟南芥	BI1-like protein	53.469%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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