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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_018506
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 13901871-13923761 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5847 bp · LXL04_018506|LXL04_018506|OH1004|cDNA

ATGGAAGACTATTTGAAGGATTTTAACGTTCCGGCGAAGCATCCGTCGGAAGCAGCTCTGAAGAAATGGCGCAAGGCCGTCTCCCTCGTCAAAAACCACCGACGACGCTTCCGCCATGTCGCTGACCTCGAAAAACGATCTATTCACCAGAACCGACTGAGCAAAATCAAGGAAGACCTGCGTGTAACCTTCATCGCCATGAGAGCAGCAATGCGGTTCATGGACGCTGCCGCTCACCCTCAAAACCCTCGCGAACACCA...

CDS

下载 CDS FASTA

5847 bp · LXL04_018506|LXL04_018506|OH1004|CDS

ATGGAAGACTATTTGAAGGATTTTAACGTTCCGGCGAAGCATCCGTCGGAAGCAGCTCTGAAGAAATGGCGCAAGGCCGTCTCCCTCGTCAAAAACCACCGACGACGCTTCCGCCATGTCGCTGACCTCGAAAAACGATCTATTCACCAGAACCGACTGAGCAAAATCAAGGAAGACCTGCGTGTAACCTTCATCGCCATGAGAGCAGCAATGCGGTTCATGGACGCTGCCGCTCACCCTCAAAACCCTCGCGAACACCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1948 aa · LXL04_018506|LXL04_018506|OH1004|PROTEIN

MEDYLKDFNVPAKHPSEAALKKWRKAVSLVKNHRRRFRHVADLEKRSIHQNRLSKIKEDLRVTFIAMRAAMRFMDAAAHPQNPREHHQPREIKLSEYTKNPDKLASMVRNYDMKTLRSLNGATGIAEAINVSIPEGVKSTDIPTRQETYGVNKYTEKPSKSFFMFIWDALHDLTLIILIVCAIVSIAVGLATEGFPNGIYDGLGILLSILLVVTVTAVSDYKQSLQFKDLDKEKKKISCHVTRDSGRKKVSIYDLVVGDV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_018506
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_018506
位置Chr04:13901871-13923761 (-)
描述Similar to ACA4: Calcium-transporting ATPase 4, plasma membrane-type
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g41560 这种依赖镁的酶催化 ATP 水解，同时将钙从胞质转运到小液泡中。 暂无已核实直接文献
At3g57330 这种依赖镁的酶催化ATP水解，并伴随钙离子从胞质转运出细胞或进入细胞器。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0136900 这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。 暂无已核实直接文献
Os11g0140400 这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。 暂无已核实直接文献
Os01g0939100 这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018506 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0043069 negative regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0051480 regulation of cytosolic calcium ion concentration 生物过程
GO:0055081 monoatomic anion homeostasis 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G41560
ath:AT3G57330
dosa:Os12g0136900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.527
排名 1 · LXL04_018506 · OH-1004
内质网0.213
排名 2 · LXL04_018506 · OH-1004
细胞质0.138
排名 3 · LXL04_018506 · OH-1004
溶酶体／液泡0.129
排名 4 · LXL04_018506 · OH-1004
高尔基体0.110
排名 5 · LXL04_018506 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12515.14CaATP_NAI6-47 aa
PF00690.32Cation_ATPase_N122-185 aa
PF00122.26E1-E2_ATPase236-334 aa
PF00702.33Hydrolase451-755 aa
PF13246.13Cation_ATPase489-651 aa
PF08282.19Hydrolase_3728-783 aa
PF00689.27Cation_ATPase_C828-991 aa
PF00689.27Cation_ATPase_C985-1066 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_018506PF12515.14CaATP_NAI6476e-2587.2
LXL04_018506PF00690.32Cation_ATPase_N1221854.7e-2897.3
LXL04_018506PF00122.26E1-E2_ATPase2363341.4e-47160.4
LXL04_018506PF00702.33Hydrolase4517554.1e-29103.0
LXL04_018506PF13246.13Cation_ATPase4896519.5e-69231.5
LXL04_018506PF08282.19Hydrolase_37287834.5e-1143.7
LXL04_018506PF00689.27Cation_ATPase_C8289913.5e-50170.9
LXL04_018506PF00689.27Cation_ATPase_C98510663.5e-50170.9
LXL04_018506PF12515.14CaATP_NAI110211306e-2587.2
LXL04_018506PF00690.32Cation_ATPase_N124213064.7e-2897.3
LXL04_018506PF00122.26E1-E2_ATPase136014591.4e-47160.4
LXL04_018506PF13246.13Cation_ATPase161417769.5e-69231.5
LXL04_018506PF00702.33Hydrolase176118804.1e-29103.0
LXL04_018506PF08282.19Hydrolase_3185319134.5e-1143.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22218拟南芥Calcium-transporting ATPase 4, plasma membrane-type68.268%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9M2L4拟南芥Putative calcium-transporting ATPase 11, plasma membrane-type68.737%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q2QY12水稻Probable calcium-transporting ATPase 9, plasma membrane-type65.703%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q2RAS0水稻Probable calcium-transporting ATPase 8, plasma membrane-type64.905%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8RUN1水稻Calcium-transporting ATPase 1, plasma membrane-type63.483%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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